Снятие Fmoc с пептида на Rink resin

форум для специалистов в области органической химии
organic chemistry issues discussion for professional scientists
Ответить
Аватара пользователя
Phobos
Сообщения: 6568
Зарегистрирован: Чт авг 12, 2004 9:24 am

Снятие Fmoc с пептида на Rink resin

Сообщение Phobos » Сб июл 03, 2021 5:35 pm

В процессе синтеза пептида надо снять Fmoc с амина на полимере, повесить защищенную опять же Fmoc-ом аминокислоту, опять снять Fmoc и т.д.
Фирма-разработчик утверждает, что научилась довольно хорошо следить за полнотой снятия FMOC при помощи HPLC. Работая каждый раз в том же объеме р-рителя и отбирая из фильтрата пробы одного объема, они получали на HPLC примерно одинаковую площадь пиков двух образующихся фрагментов - фульвен и его аддукт с пиперидином.
fulvene+adduct.jpg
При этом осталось неясным, почему соотношение изначально каждый раз другое и после того, как образец постоит, оно меняется, но никогда не приходит к тому же самому равновесному соотношению. Соответственно, т.к. коэфициэнт поглощения у фульвена будет больше, чем у аддукта, изменение этого соотношения также должно влиять на общую площадь пиков.
Кто знаком с этой реакцией лично, просветите плз в следующем:
1. Зависит ли соотношение продуктов от условий снятия - иногда в статьях пишут 30 минут/комнатная темп., иногда 5 миныт/70 С.
2. Является ли реакция присоединения пиперидина обратимой, и существует ли некая равновесная смесь, характерная для данной температуры-концентрации?
3. Можно ли кк-то "заморозить" смесь в изначальном соотношении, добавив TFA к образцу - протонировать пиперидин и сделать его ненуклеофильным?
У вас нет необходимых прав для просмотра вложений в этом сообщении.
Wodka trinkt man pur und kalt, das macht hundert Jahre alt!

Nickolas
Сообщения: 1530
Зарегистрирован: Пн авг 27, 2007 8:15 pm

Re: Снятие Fmoc с пептида на Rink resin

Сообщение Nickolas » Сб июл 03, 2021 7:38 pm

Реакция обратимая и действительно зависит от условий. ЕМНИП, была даже статья, где описывался более воспроизводимый метод спектрофотометрического анализа полноты снятия FMOC. Мы иногда используем DBU - буквально пару процентов в DMF достаточно чтобы снять Fmoc. Если нужен аддукт, то можно добавить к раствору DBU тиол (это было описано для снятия Fmoc в растворе).

Аватара пользователя
Phobos
Сообщения: 6568
Зарегистрирован: Чт авг 12, 2004 9:24 am

Re: Снятие Fmoc с пептида на Rink resin

Сообщение Phobos » Сб июл 03, 2021 8:50 pm

Мне нужно только воспроизводимый результат получить, неважно с каким из аддуктов. У меня получился почти один пик, где-то 92% по отношению ко второму (250 нм). И потом образец мерили каждые пару часов. Этот пик рос и рос, а маленький не уменьшался.
Wodka trinkt man pur und kalt, das macht hundert Jahre alt!

Nickolas
Сообщения: 1530
Зарегистрирован: Пн авг 27, 2007 8:15 pm

Re: Снятие Fmoc с пептида на Rink resin

Сообщение Nickolas » Вс июл 04, 2021 5:46 pm

Вот кстати недавно встречал эту статью с похожим топиком:
https://link.springer.com/article/10.10 ... 21-02789-5

Может что полезное там есть..
Если нужно, могу и другие упомянутые мной статьи найти.

Аватара пользователя
Phobos
Сообщения: 6568
Зарегистрирован: Чт авг 12, 2004 9:24 am

Re: Снятие Fmoc с пептида на Rink resin

Сообщение Phobos » Пн июл 05, 2021 9:10 pm

Спасибо.
Wodka trinkt man pur und kalt, das macht hundert Jahre alt!

Ответить

Вернуться в «органическая химия / organic chemistry»

Кто сейчас на конференции

Сейчас этот форум просматривают: нет зарегистрированных пользователей и 9 гостей