Создание вычислительного кластера для ORCA

вопросы строения молекул и квантовой химии
Ответить
gregory98
Сообщения: 1
Зарегистрирован: Сб дек 08, 2018 12:26 am

Создание вычислительного кластера для ORCA

Сообщение gregory98 » Пт фев 10, 2023 10:20 pm

Всем доброго времени суток.
Заинтересовался темой квантовохимических вычислений, в качестве основной программы была выбрана ORCA. Для ускорения расчетов хотелось бы запилить кластер, но знаний в этой области маловато. Кластер планирую делать из обычных офисных ПК в основном второй свежести. Ось - винда; версия ORCA - 5.0.3
Буду благодарен за любой совет!

Аватара пользователя
Гесс
Сообщения: 13055
Зарегистрирован: Ср фев 15, 2012 11:19 pm

Re: Создание вычислительного кластера для ORCA

Сообщение Гесс » Сб фев 11, 2023 1:27 am

Совет: Ось - линукс.
И посмотрите что такое менеджеры задач, скажем SLURM или PBS.
Одна из машин (самая живая и сильная) должна стать мастер нодой, остальные - расчетными нодами.

Аватара пользователя
Ahha
Сообщения: 3765
Зарегистрирован: Чт сен 20, 2007 7:02 pm

Re: Создание вычислительного кластера для ORCA

Сообщение Ahha » Сб фев 11, 2023 1:42 am

Несколько настораживает выражение "офисные ПК второй свежести". Как бы "офисность второй свежести" не оказалась узким местом. Впрочем, у меня опыта построения реальных кластеров нет, поэтому можно воспринимать это как "реплику бабушки у подъезда".
Когда начинает изменять память, практики заводят записную книжку, а романтики садятся писать мемуары.

mizuchi
Сообщения: 95
Зарегистрирован: Ср фев 23, 2011 5:10 pm

Re: Создание вычислительного кластера для ORCA

Сообщение mizuchi » Сб фев 11, 2023 1:51 pm

Еще нужно продумать архитектуру коммуникации. Если речь об офисных ПК, то, наверное, имеет смысл купить каждому по сетевой карте 10Gb Ethernet и свитч на всех. "Обычный" Ethernet может стать узким местом, а InfiniBand или Omni-Path - это, определенно, оверкилл. Хотя если подержанное оборудование удастся найти подешевле, то можно и InfiniBand.

Ответить

Вернуться в «квантовая химия и моделирование»

Кто сейчас на конференции

Сейчас этот форум просматривают: нет зарегистрированных пользователей и 16 гостей