Коллеги, помогите в вопросом.
Есть трехцентровые орбитали, полученные ORCA (.loc файл). В Moldene все отлично визуализируется, но возникла задача посчитать доли трех атомов в этой трехцентровой орбитали...
Я без идей. Не подскажете, какая-то программа/скрипт для решения этой задачи есть?
Локализация орбиталей. Как вычислить доли на различных атомах?
Локализация орбиталей. Как вычислить доли на различных атомах?
Нельзя уйти от своей судьбы, - другими словами, нельзя уйти от неизбежных последствий своих собственных действий. Ф.Энгельс
Re: Локализация орбиталей. Как вычислить доли на различных атомах?
Вы локализованную орбиталь хотите на куски порезать? Если честно то плохо представляю. Это типа "сколько электрона" каждый из атомов отдал на этот электрон? Так это зависит и от того сколько у них было (сколько от них отобрали на другие орбитали). ИМХО задача нормального решения не имеет, хотя зуб не дам.
Re: Локализация орбиталей. Как вычислить доли на различных атомах?
NBO не поможет?. Вроде, в орке есть, хотя не уверен.
Re: Локализация орбиталей. Как вычислить доли на различных атомах?
Если включить многоцентровые он может поймать эту орбиталь (а может и не поймать). А вней будет разбивка на атомные компоненты?
Re: Локализация орбиталей. Как вычислить доли на различных атомах?
Если в NBO включить NRT, покажет все найденные резонансные формы с весами. Например, для EtOAc получается два референса: 62.5% для "карбонильной формы" и 22.8% для формы O-С=ОEt. Локализация на атомах показывется для двухцентровых связей. Может, в этой стороне ТС найдет решение своей проблемы?
Когда начинает изменять память, практики заводят записную книжку, а романтики садятся писать мемуары.
Кто сейчас на конференции
Сейчас этот форум просматривают: нет зарегистрированных пользователей и 33 гостя