Сравниваем персональные компьютеры (ORCA version)

вопросы строения молекул и квантовой химии
Аватара пользователя
Ahha
Сообщения: 3766
Зарегистрирован: Чт сен 20, 2007 7:02 pm

Re: Сравниваем персональные компьютеры (ORCA version)

Сообщение Ahha » Вт дек 28, 2021 2:47 am

А вот в этой вашей директории на диске E: какие-то временные файлы пишутся? Можете сделать скриншот с TaskManager (или как он там теперь называется?)
Когда начинает изменять память, практики заводят записную книжку, а романтики садятся писать мемуары.

Аватара пользователя
Гесс
Сообщения: 13055
Зарегистрирован: Ср фев 15, 2012 11:19 pm

Re: Сравниваем персональные компьютеры (ORCA version)

Сообщение Гесс » Вт дек 28, 2021 2:59 am

С тем инетом что у меня сейчас я виндовую версию не скачаю. Напомните в начале года, я гляну.

Аватара пользователя
Ahha
Сообщения: 3766
Зарегистрирован: Чт сен 20, 2007 7:02 pm

Re: Сравниваем персональные компьютеры (ORCA version)

Сообщение Ahha » Вт дек 28, 2021 3:01 am

Хочу вам заметить, что конец года случится всё-таки несколько позже, чем даже через четыре часа. )))
Когда начинает изменять память, практики заводят записную книжку, а романтики садятся писать мемуары.

Суровый
Сообщения: 100
Зарегистрирован: Ср окт 22, 2014 8:02 pm

Re: Сравниваем персональные компьютеры (ORCA version)

Сообщение Суровый » Вт дек 28, 2021 3:04 am

Вот. Файлы и монитор. Диск вообще отдыхает. Потом (почти) все показанные файлы удаляются.
У вас нет необходимых прав для просмотра вложений в этом сообщении.

Аватара пользователя
Ahha
Сообщения: 3766
Зарегистрирован: Чт сен 20, 2007 7:02 pm

Re: Сравниваем персональные компьютеры (ORCA version)

Сообщение Ahha » Вт дек 28, 2021 3:10 am

Так, что мы имеем? Файлы какие-то пишутся, и она использует сейчас не MPI-версию. Что нормально, поскольку nprocs 1. Давайте подождем полчасика.
Когда начинает изменять память, практики заводят записную книжку, а романтики садятся писать мемуары.

Аватара пользователя
Ahha
Сообщения: 3766
Зарегистрирован: Чт сен 20, 2007 7:02 pm

Re: Сравниваем персональные компьютеры (ORCA version)

Сообщение Ahha » Вт дек 28, 2021 3:14 am

Кстати, сейчас примерно какой шаг? Я понимаю, что они неравномерные, но я этот расчет уже так задрочил, что могу прикинуть, два часа вам осталось ждать или четыре. ))
Когда начинает изменять память, практики заводят записную книжку, а романтики садятся писать мемуары.

Суровый
Сообщения: 100
Зарегистрирован: Ср окт 22, 2014 8:02 pm

Re: Сравниваем персональные компьютеры (ORCA version)

Сообщение Суровый » Вт дек 28, 2021 3:16 am

--------------
SCF ITERATIONS
--------------
ITER Energy Delta-E Max-DP RMS-DP [F,P] Damp
*** Starting incremental Fock matrix formation ***
0 -1545.4713956953 0.000000000000 0.03442113 0.00033023 0.3201947 0.7000
1 -1545.7773842731 -0.305988577817 0.03076233 0.00026126 0.1175396 0.7000

Аватара пользователя
Ahha
Сообщения: 3766
Зарегистрирован: Чт сен 20, 2007 7:02 pm

Re: Сравниваем персональные компьютеры (ORCA version)

Сообщение Ahha » Вт дек 28, 2021 3:18 am

И это при том,что вы начали в 2.40????
Суровый писал(а):
Вт дек 28, 2021 2:40 am
Запустил на 1 процессоре. Если через 2 часа не отпишусь, значит отпишусь через 4.
Я начал где-то в 2.57, у меня тоже самое... Только что случилась третья итерация. Прикидочно, как раз около двух часов у меня и будет. Возможно, меньше.
Последний раз редактировалось Ahha Вт дек 28, 2021 3:24 am, всего редактировалось 1 раз.
Когда начинает изменять память, практики заводят записную книжку, а романтики садятся писать мемуары.

Суровый
Сообщения: 100
Зарегистрирован: Ср окт 22, 2014 8:02 pm

Re: Сравниваем персональные компьютеры (ORCA version)

Сообщение Суровый » Вт дек 28, 2021 3:23 am

На данный момент прошло 43 минуты с запуска.

Аватара пользователя
Ahha
Сообщения: 3766
Зарегистрирован: Чт сен 20, 2007 7:02 pm

Re: Сравниваем персональные компьютеры (ORCA version)

Сообщение Ahha » Вт дек 28, 2021 3:31 am

SCF ITERATIONS
--------------
ITER Energy Delta-E Max-DP RMS-DP [F,P] Damp
*** Starting incremental Fock matrix formation ***
0 -1545.4713956952 0.000000000000 0.03442209 0.00033023 0.3201947 0.7000
1 -1545.7773842732 -0.305988578076 0.03076433 0.00026126 0.1175396 0.7000
***Turning on DIIS***
2 -1545.8971335854 -0.119749312202 0.04178959 0.00043495 0.0401956 0.0000
3 -1546.0854917961 -0.188358210675 0.02992268 0.00021119 0.0553805 0.0000
Это было через 30 минут после начала.
Через 44 минуты:
SCF ITERATIONS
--------------
ITER Energy Delta-E Max-DP RMS-DP [F,P] Damp
*** Starting incremental Fock matrix formation ***
0 -1545.4713956952 0.000000000000 0.03442209 0.00033023 0.3201947 0.7000
1 -1545.7773842732 -0.305988578076 0.03076433 0.00026126 0.1175396 0.7000
***Turning on DIIS***
2 -1545.8971335854 -0.119749312202 0.04178959 0.00043495 0.0401956 0.0000
3 -1546.0854917961 -0.188358210675 0.02992268 0.00021119 0.0553805 0.0000
4 -1546.1279822553 -0.042490459192 0.00767036 0.00007088 0.0252784 0.0000
5 -1546.1305129332 -0.002530677889 0.00404464 0.00003069 0.0128408 0.0000
В итоге будет, по-видимому, порядка 2 часов. У вас - явно как раз раза в два больше, если я не ошибаюсь. В чем тут причина - не понимаю... Ну не может же быть, чтоб только из-за винды...
Когда начинает изменять память, практики заводят записную книжку, а романтики садятся писать мемуары.

Суровый
Сообщения: 100
Зарегистрирован: Ср окт 22, 2014 8:02 pm

Re: Сравниваем персональные компьютеры (ORCA version)

Сообщение Суровый » Вт дек 28, 2021 4:00 am

77 минут - только 5 итерация (с номером 4). Всё дело в памяти и материнке. Частота памяти ниже, а частота системной шины вообще 100Мгц. Плюс кеш процессора меньше.

Аватара пользователя
Ahha
Сообщения: 3766
Зарегистрирован: Чт сен 20, 2007 7:02 pm

Re: Сравниваем персональные компьютеры (ORCA version)

Сообщение Ahha » Вт дек 28, 2021 4:02 am

Это всё так. Но всё равно странно: в два с небольшим раза! Я бы понял там процентов 15-30...
Timings for individual modules:

Sum of individual times ... 5734.313 sec (= 95.572 min)
GTO integral calculation ... 2.341 sec (= 0.039 min) 0.0 %
SCF iterations ... 5731.972 sec (= 95.533 min) 100.0 %
****ORCA TERMINATED NORMALLY****
TOTAL RUN TIME: 0 days 1 hours 35 minutes 36 seconds 500 msec
:dontknow:
Когда начинает изменять память, практики заводят записную книжку, а романтики садятся писать мемуары.

Суровый
Сообщения: 100
Зарегистрирован: Ср окт 22, 2014 8:02 pm

Re: Сравниваем персональные компьютеры (ORCA version)

Сообщение Суровый » Вт дек 28, 2021 4:40 am

1 час 58 минут - 8-ая итерация (с номером 7).

Аватара пользователя
Ahha
Сообщения: 3766
Зарегистрирован: Чт сен 20, 2007 7:02 pm

Re: Сравниваем персональные компьютеры (ORCA version)

Сообщение Ahha » Вт дек 28, 2021 4:43 am

Ну это еще часа полтора ждать как минимум. Странно.
Когда начинает изменять память, практики заводят записную книжку, а романтики садятся писать мемуары.

Суровый
Сообщения: 100
Зарегистрирован: Ср окт 22, 2014 8:02 pm

Re: Сравниваем персональные компьютеры (ORCA version)

Сообщение Суровый » Вт дек 28, 2021 4:49 am

Слабым местом является FSB (частота системной шины). Если она у вас 333МГц и более, то это может полностью объяснить разницу.

Суровый
Сообщения: 100
Зарегистрирован: Ср окт 22, 2014 8:02 pm

Re: Сравниваем персональные компьютеры (ORCA version)

Сообщение Суровый » Вт дек 28, 2021 6:02 am

TOTAL RUN TIME: 0 days 3 hours 13 minutes 26 seconds 161 msec
Output
orca1proc.zip
У вас нет необходимых прав для просмотра вложений в этом сообщении.

endlesslake
Сообщения: 191
Зарегистрирован: Чт авг 09, 2012 9:13 pm

Re: Сравниваем персональные компьютеры (ORCA version)

Сообщение endlesslake » Вт дек 28, 2021 3:52 pm

Ahha писал(а):
Вт дек 28, 2021 1:04 am
Нет, я понимаю, что разные модели процессоров, памяти, разные версии MPI, разные ОСи. Но в 2 (два) раза??... Или я что-то конкретно не догоняю насчет директивы nprocs? Или в первом случае использовалось nprocs 1?
вообще то у них ширина вектора как раз в 2 раза отличается. Правда орка не сказать что хорошо векторизована, но темп невекторных инструкций тоже может отличаться, это уже мануал по оптимизации смотреть нужно.

Суровый
Сообщения: 100
Зарегистрирован: Ср окт 22, 2014 8:02 pm

Re: Сравниваем персональные компьютеры (ORCA version)

Сообщение Суровый » Вт дек 28, 2021 4:28 pm

orca_4_2_1_linux_x86-64_openmpi314.tar.zst
ALT Workstation 9.1 (Linux 5.4.85-std-def-alt1)

Установить OpenMPI не удалось, поэтому запустил на одном ядре. Общее время 2 hours 42 minutes 33 seconds 317 msec.

Аватара пользователя
amge
Сообщения: 2021
Зарегистрирован: Вт июл 31, 2007 11:42 am

Re: Сравниваем персональные компьютеры (ORCA version)

Сообщение amge » Вт окт 18, 2022 1:18 pm

Продолжу про тестирование скорости
ORCA 5.0.3, Linux, openmpi-4.1.2, AMD Ryzen 9 5950X, 16x3400MHz/64 Gb DDR4/M.2 SSD 00:07:33
На 8 ядрах 00:10:57, на 4-х - 00:18:52
Две параллельные задачки на 8 ядрах каждая - по 00:14:33

Похоже, при повышении загрузки проца понижается его частота.

При использовании HDD вместо SSD ничего не изменилось. Оно и понятно: для этой задачки всё tmp помешается в оперативку, и диск, по сути, не используется.

Аватара пользователя
bigM
Сообщения: 4949
Зарегистрирован: Ср фев 15, 2017 2:05 am

Re: Сравниваем персональные компьютеры (ORCA version)

Сообщение bigM » Вт окт 18, 2022 6:41 pm

amge писал(а):
Вт окт 18, 2022 1:18 pm
Похоже, при повышении загрузки проца понижается его частота.
есть такое. при нарастании загрузки увеличивается температура, множитель сбрасывается. посмотреть можно в системном мониторе сравнив графики температуры и частоту. если критична производительность, то лечится сменой кулера
Не красота спасёт мир, а транквилизаторы.

Ответить

Вернуться в «квантовая химия и моделирование»

Кто сейчас на конференции

Сейчас этот форум просматривают: нет зарегистрированных пользователей и 19 гостей