Какой выбрать CPU для GAUSSIAN09

вопросы строения молекул и квантовой химии
Ответить
Аватара пользователя
bigM
Сообщения: 4961
Зарегистрирован: Ср фев 15, 2017 2:05 am

Re: Какой выбрать CPU для GAUSSIAN09

Сообщение bigM » Пт авг 20, 2021 9:18 pm

Shorku писал(а):
Пт авг 20, 2021 9:17 pm
пассивная агрессия детектед
почему пассивная? :lol:
Не красота спасёт мир, а транквилизаторы.

Аватара пользователя
Shorku
Сообщения: 1075
Зарегистрирован: Вт дек 13, 2011 2:17 pm

Re: Какой выбрать CPU для GAUSSIAN09

Сообщение Shorku » Пт авг 20, 2021 9:20 pm

на активную Гесс прилетит, очевидно
Make quantum chemistry, not war

Аватара пользователя
bigM
Сообщения: 4961
Зарегистрирован: Ср фев 15, 2017 2:05 am

Re: Какой выбрать CPU для GAUSSIAN09

Сообщение bigM » Пн авг 23, 2021 12:34 am

Konstantinrs писал(а):
Пт авг 20, 2021 11:35 am
bigM, в бюджет не уложиться. И к АМД душа не лежит)) Есть что-то от интел подходящее?
ну ежели так, то вот вариант: https://www.nix.ru/autocatalog/intel/CP ... 35694.html
вроде Intel Optane Memory поддерживает! хоть и потоков маловато (12) по нынешним временам, но зато высокая частота в 4 ГГц, что может дать повышение производительности по сравнению с дополнительными ядрами.
материнку под неё типа https://www.nix.ru/autocatalog/motherbo ... l#pid=2245
минус только 128Гб поддерживает, но можно оперативы 2х8+Intel Optane Memory (в режиме память+СДД)
Не красота спасёт мир, а транквилизаторы.

Аватара пользователя
Гесс
Сообщения: 13063
Зарегистрирован: Ср фев 15, 2012 11:19 pm

Re: Какой выбрать CPU для GAUSSIAN09

Сообщение Гесс » Пн авг 23, 2021 12:43 am

Konstantinrs писал(а):
Чт авг 19, 2021 3:58 pm
т.к. я не расчетчик от слова совсем) Поэтому от меня еще будет пара чайниковских вопросов. Бюджет 120 тыр. Считаться что-то будет редко, то есть далеко не в каждой статье будут какие-то расчеты. Расчеты простые, типа переходных состояний, интермедиатов, путей реакции, стабильности. Это один маленький абзац в синтетических работах, который как бы не то чтобы нужен,
Это ДФТ. Ну может по праздникам DLPNO-CCSD.
bigM писал(а):
Пн авг 23, 2021 12:34 am
минус только 128Гб поддерживает, но можно оперативы 2х8+Intel Optane Memory (в режиме память+СДД)
14-ядерной машине на ДФТ-оптимизациях не потребуется больше 128 Гб RAM. А с 7-14 Гб RAM на ядро и DLPNO-CCSD поползет. Так что это не особо минус.

Аватара пользователя
Konstantinrs
Сообщения: 407
Зарегистрирован: Ср июн 24, 2009 2:35 pm

Re: Какой выбрать CPU для GAUSSIAN09

Сообщение Konstantinrs » Ср авг 25, 2021 10:23 am

bigM, спасибо! Вот, наверное, это я и куплю. Проц и мат плата. С остальным вроде все ясно. Может и оптан влезет))
Собственно, был вопрос в сокете, оптимальном соотношении "частота-количество ядер" для скромных задач, которые очень точно охарактеризовал Гесс в сообщении выше)))
Мне тут с круглыми глазами советовали рязань Тhreadripper PRO 3975WX, уверяя, что это бескомпромиссное решение для расчетов. Я понимаю, но давайте же искать компромиссы))) Зачем же ребенка в садик на бмв боком возить))
Спасибо, коллеги! Пока вопрос снят.
-А х...ральный как пишется: хИральный или хЕральный?
-Нуэ...это смотря какой...

Аватара пользователя
bigM
Сообщения: 4961
Зарегистрирован: Ср фев 15, 2017 2:05 am

Re: Какой выбрать CPU для GAUSSIAN09

Сообщение bigM » Ср авг 25, 2021 4:50 pm

Пжалуйста, обращайтесь. Только память ECC берите🙋
Не красота спасёт мир, а транквилизаторы.

Аватара пользователя
Shorku
Сообщения: 1075
Зарегистрирован: Вт дек 13, 2011 2:17 pm

Re: Какой выбрать CPU для GAUSSIAN09

Сообщение Shorku » Чт авг 26, 2021 12:31 am

Не срача ради, а из интереса: а зачем вообще на рассчетном компе нужен оптан? И существуют ли в природе тесты?
Make quantum chemistry, not war

Аватара пользователя
Гесс
Сообщения: 13063
Зарегистрирован: Ср фев 15, 2012 11:19 pm

Re: Какой выбрать CPU для GAUSSIAN09

Сообщение Гесс » Чт авг 26, 2021 12:36 am

что такое оптан?

YuraM
Сообщения: 459
Зарегистрирован: Пн ноя 26, 2007 11:07 pm

Re: Какой выбрать CPU для GAUSSIAN09

Сообщение YuraM » Чт авг 26, 2021 8:03 am

Для не специалиста, опять же, чем вышеупомянутый Xeon принципиально лучше для расчетов чем Intel core i5 10600K с похожими характеристиками, но который в 2 раза дешевле?
Кто смел тот и съел

Аватара пользователя
Konstantinrs
Сообщения: 407
Зарегистрирован: Ср июн 24, 2009 2:35 pm

Re: Какой выбрать CPU для GAUSSIAN09

Сообщение Konstantinrs » Чт авг 26, 2021 8:54 am

YuraM писал(а):
Чт авг 26, 2021 8:03 am
Для не специалиста, опять же, чем вышеупомянутый Xeon принципиально лучше для расчетов чем Intel core i5 10600K с похожими характеристиками, но который в 2 раза дешевле?
Да я вот с этим же вопросом приходил, мол, обычное железо для десктопного компа - покатит для расчетов или лучше заморочиться? Гуру вот говорят, что нужно особенное железо. Есть просто готовые системники, купил гроб, поставил, вся байда на гарантии. Я почему-то нервничаю, когда компы собираю: ниче не влазит, кабели эти везде лезут никуда не пихаются, термопаста, если еще скальпирование с жидким сплавом. В целом, китайские инженерные решения иногда огорчают. Да-да, своих нет...

Оптан, как говорит наш админ, это "подача прямо в мозг"))) Если честно я сидел под досом в свое время, меня ничем не испугать :D И современным админам веры нет, а маркетологи обладают какими-то нескончаемыми запасами доширака. Но иногда так хочется просто купить по списку и не тратить время)) Но я увидел заветную фразу "в 2 раза дешевле" и не смог пройти мимо)) Это же все с наличных покупается, с зарплаты)))
-А х...ральный как пишется: хИральный или хЕральный?
-Нуэ...это смотря какой...

Аватара пользователя
Shorku
Сообщения: 1075
Зарегистрирован: Вт дек 13, 2011 2:17 pm

Re: Какой выбрать CPU для GAUSSIAN09

Сообщение Shorku » Чт авг 26, 2021 9:15 am

YuraM писал(а):
Чт авг 26, 2021 8:03 am
Для не специалиста, опять же, чем вышеупомянутый Xeon принципиально лучше для расчетов чем Intel core i5 10600K с похожими характеристиками, но который в 2 раза дешевле?
Поддержка ECC RAM (которая с коррекцией ошибок), ширина канала до этой самой памяти, поддержка большего объема RAM, размер кэша, возможность собрать на одной плате несколько процессоров (но это не у любого Xeon, конечно).
Плюшки, которые можно легко оценить, считая DLPNO-CCSD, например: на старых серверных системах или новых intel core можно легко упереться в предел пропускной способности шины до оперативной памяти и не получать никакого профита от количества ядер (впрочем, в случае intel core мб и не получится, ввиду небольшого числа ядер), можно очень редко, но крайне обидно уронить длинный и дорогой рассчет из-за отсутствия коррекции ошибок.
Для относительно коротких рассчетов DFT разницу я тоже не очень понимаю.

Я к чему про оптан спрашиваю: сравнивал DFT со скратчем на RAM-диске и со скратчем на NVMe SSD, разницы особой не заметил (но не то чтобы набирал статистику). А оптан еще и стоит как гиперзвуковая ракета.
Гесс писал(а):
Чт авг 26, 2021 12:36 am
что такое оптан?
Intel Optane - специфический тип долговременной памяти, быстрая как матрос после кругосветки, износостойкая как его инструмент, дорогая как хозяйка заведения. В силу дороговизны, используется как своего рода кэш, где можно хранить наиболее используемые файлы.
Make quantum chemistry, not war

Аватара пользователя
bigM
Сообщения: 4961
Зарегистрирован: Ср фев 15, 2017 2:05 am

Re: Какой выбрать CPU для GAUSSIAN09

Сообщение bigM » Вт авг 31, 2021 9:20 pm

Konstantinrs писал(а):
Чт авг 26, 2021 8:54 am
Если честно я сидел под досом в свое время, меня ничем не испугать :D И современным админам веры нет, а маркетологи обладают какими-то нескончаемыми запасами доширака. Но иногда так хочется просто купить по списку и не тратить время)) Но я увидел заветную фразу "в 2 раза дешевле" и не смог пройти мимо)) Это же все с наличных покупается, с зарплаты)))
Драйвер верхней памяти под дос6.22 ставили?
Не красота спасёт мир, а транквилизаторы.

ximi
Сообщения: 4407
Зарегистрирован: Вс янв 29, 2012 7:50 pm

Re: Какой выбрать CPU для GAUSSIAN09

Сообщение ximi » Вт авг 31, 2021 10:09 pm

Гесс писал(а):
Чт авг 26, 2021 12:36 am
что такое оптан?
Оптан это типа SSD но не на флеш технологии а на другой патентованной от интел.

1) Быстрее флеша в разы.
2) Энергопотребление ниже.
3) Выдерживает в сотни раз больше циклов записи чем флеш.

Можно использовать и как промежуточный кэш и как отдельный носитель.

Стоит ну очень дорого. И использовать нужно только на процах Intel.

Аватара пользователя
bigM
Сообщения: 4961
Зарегистрирован: Ср фев 15, 2017 2:05 am

Re: Какой выбрать CPU для GAUSSIAN09

Сообщение bigM » Ср сен 01, 2021 12:17 am

Konstantinrs писал(а):
Чт авг 26, 2021 8:54 am
Но я увидел заветную фразу "в 2 раза дешевле" и не смог пройти мимо)) Это же все с наличных покупается, с зарплаты)))
Вы что узнать хотите? Почему принимаются те или иные решения в выборе железа?
Не красота спасёт мир, а транквилизаторы.

ximi
Сообщения: 4407
Зарегистрирован: Вс янв 29, 2012 7:50 pm

Re: Какой выбрать CPU для GAUSSIAN09

Сообщение ximi » Ср сен 01, 2021 12:22 am

Оптан, как говорит наш админ, это "подача прямо в мозг")))
Соврал ваш админ .. ОЗУ это подача прямо в мозг.

Аватара пользователя
bigM
Сообщения: 4961
Зарегистрирован: Ср фев 15, 2017 2:05 am

Re: Какой выбрать CPU для GAUSSIAN09

Сообщение bigM » Ср сен 01, 2021 12:26 am

ximi писал(а):
Ср сен 01, 2021 12:22 am
Оптан, как говорит наш админ, это "подача прямо в мозг")))
Соврал ваш админ .. ОЗУ это подача прямо в мозг.
:facepalm: ниче не соврамши. Есть два типа оптан памяти, одна вставляется в димм раз'ем озу, а другая в pci-e
Не красота спасёт мир, а транквилизаторы.

Аватара пользователя
Shorku
Сообщения: 1075
Зарегистрирован: Вт дек 13, 2011 2:17 pm

Re: Какой выбрать CPU для GAUSSIAN09

Сообщение Shorku » Ср сен 01, 2021 10:51 am

Окей, адепты Оптана тестов не дают, пришлось самому искать. Тут вот тесты, втч на Гамессе:

Код: Выделить всё

The performance of the direct HF method on “DRAM” and
“IMDT”-configured nodes is very similar (see Figure 6 (A), green
line). However, the performance of the incore method differs between “DRAM” and “IMDT” (see Figure 6 (A), red and yellow lines).
The efficiency shown in Figure 6 (B) for incore IMDT vs incore
DRAM (purple line) behaves similar to other benchmarks – when
benchmarks fits in the DRAM cache of the IMDT then the efficiency
is close to 100%, otherwise it decreases to ≈50%. 
Источник: https://arxiv.org/pdf/1811.10220.pdf

Кмк, вывод тут можно сделать такой, что пока можно вкладывать деньги в больший объем более быстрой оперативки (включая, но не ограничиваясь CPU c большим bandwidth, матплатой, поддерживающей больше RAM, тайминги, количество банков на ранг) - это и надо делать. Intel Optane для квантов имхо годится только если вы уже собрали bleeding edge систему, а деньги еще почему-то остались.
Make quantum chemistry, not war

Аватара пользователя
bigM
Сообщения: 4961
Зарегистрирован: Ср фев 15, 2017 2:05 am

Re: Какой выбрать CPU для GAUSSIAN09

Сообщение bigM » Пн сен 13, 2021 8:31 pm

Konstantinrs писал(а):
Ср авг 25, 2021 10:23 am
Вот, наверное, это я и куплю.
получилось? каковы результаты?
Не красота спасёт мир, а транквилизаторы.

Аватара пользователя
Shorku
Сообщения: 1075
Зарегистрирован: Вт дек 13, 2011 2:17 pm

Re: Какой выбрать CPU для GAUSSIAN09

Сообщение Shorku » Вт сен 14, 2021 11:41 am

Может быть, кстати, запилить отдельную тему с типовым тестовым инпутом под какой-нибудь распространенный кв-хим пакет, чтобы можно было выкладывать конфиг конкретных машин и результаты?
Make quantum chemistry, not war

Аватара пользователя
bigM
Сообщения: 4961
Зарегистрирован: Ср фев 15, 2017 2:05 am

Re: Какой выбрать CPU для GAUSSIAN09

Сообщение bigM » Ср сен 15, 2021 12:58 am

Было б любопытно
Не красота спасёт мир, а транквилизаторы.

Ответить

Вернуться в «квантовая химия и моделирование»

Кто сейчас на конференции

Сейчас этот форум просматривают: нет зарегистрированных пользователей и 15 гостей