Вопрос по визуализации

вопросы строения молекул и квантовой химии
Ответить
Asb
Сообщения: 294
Зарегистрирован: Чт ноя 18, 2010 1:38 am

Вопрос по визуализации

Сообщение Asb » Пт апр 05, 2013 9:16 am

Доброе утро коллеги.
Во многих журналах по медицинской химии, а также в журналах биоорганического профиля можно увидить красивые картинки результатов докинга. Подскажите пожалуйста в каких программах визуализаторах их можно сделать.
Огромное спасибо тем кто откликнется.

Аватара пользователя
uchebnik fiziki
Сообщения: 4265
Зарегистрирован: Пн авг 20, 2012 9:04 pm

Re: Вопрос по визуализации

Сообщение uchebnik fiziki » Пт апр 05, 2013 12:32 pm

pymol, vmd, chimera, sybyl, maestro, vida
Свобода, равенство, братство.

Или смерть.

den2042
Сообщения: 23
Зарегистрирован: Пн июл 30, 2012 5:46 pm

Re: Вопрос по визуализации

Сообщение den2042 » Сб апр 06, 2013 4:12 pm

ИМХО, программы для докинга это одно, а визуализация докинга это, все-таки, немного другое.
В моем личном рейтинге лидер -- Pymol
http://ihome.cuhk.edu.hk/~b102142/pymol ... orial.html

Asb
Сообщения: 294
Зарегистрирован: Чт ноя 18, 2010 1:38 am

Re: Вопрос по визуализации

Сообщение Asb » Вт апр 09, 2013 8:09 am

Большое спасибо! Но честно говоря я не увидел у перечисленных программ, способность работь с выходными файлами autodock. Чтобы была возможность визуализировать контакты.

Аватара пользователя
uchebnik fiziki
Сообщения: 4265
Зарегистрирован: Пн авг 20, 2012 9:04 pm

Re: Вопрос по визуализации

Сообщение uchebnik fiziki » Вт апр 09, 2013 1:51 pm

MGL Tools вас спасёт. Как же вы читали мануалы, если не нашли на неё ссылку?

Кстати, к автоматической визуализации контактов надо относиться осторожно.
Свобода, равенство, братство.

Или смерть.

Asb
Сообщения: 294
Зарегистрирован: Чт ноя 18, 2010 1:38 am

Re: Вопрос по визуализации

Сообщение Asb » Вт апр 09, 2013 5:52 pm

MGL Tools дает картинки ужасного качества

Аватара пользователя
uchebnik fiziki
Сообщения: 4265
Зарегистрирован: Пн авг 20, 2012 9:04 pm

Re: Вопрос по визуализации

Сообщение uchebnik fiziki » Вт апр 09, 2013 6:50 pm

Не нравится качество -- рисуйте другими программами, перечисленными выше.
Свобода, равенство, братство.

Или смерть.

Ответить

Вернуться в «квантовая химия и моделирование»

Кто сейчас на конференции

Сейчас этот форум просматривают: нет зарегистрированных пользователей и 69 гостей