оценить тип связи

вопросы строения молекул и квантовой химии
Аватара пользователя
Elbereth
Сообщения: 41
Зарегистрирован: Ср авг 17, 2011 2:38 am

оценить тип связи

Сообщение Elbereth » Вс ноя 11, 2012 6:55 am

Здравствуйте.

Необходимо определить тип химических связей в молекуле (ковалентные, ионные). Знаю, что определить это можно рассмотрев заселенности перекрывания после оптимизации геометрии молекулы (overlape populations). Чем меньше число, тем более ионная связь. Но есть ли какие-то критерии, по которым из полученных данных можно сказать, какая именно там связь? Т. е. в каком промежутке значений (по цифрам) у нас находится ковалентная, в каком ионная связь?

Спасибо.

Reizen
Сообщения: 69
Зарегистрирован: Пт ноя 21, 2008 12:54 pm

Re: оценить тип связи

Сообщение Reizen » Вс ноя 11, 2012 1:47 pm

(неуверенно)

Я знаю, как по Бейдеру формально определяется отличие ковалентной связи от ионной (крутизна спада эл.плотности вдоль оси, соединяющей ядра - или по касательной к связевому пути, если связь изогнутая - при приближении к точке минимума на оси ("связевая точка") должна быть меньше/больше, чем крутизна спада при удалении от этой оси (в этой точке!) в перпендикулярном направлении). Но вот подойдёт ли вам это определение, если учесть, что теория Бэйдера - это общеизвестная "вещь в себе"...
...Reveal your face to me, guide me through the Stygian fields,
Enthral my soul to Sepedet's beams to serve your will!

(Nightwish - "The Pharaoh Sails To Orion")

Аватара пользователя
Shorku
Сообщения: 1075
Зарегистрирован: Вт дек 13, 2011 2:17 pm

Re: оценить тип связи

Сообщение Shorku » Вс ноя 11, 2012 2:09 pm

Можно еще по вкладам в натуральную связевую орбиталь

[ Post made via Android ] Изображение
Make quantum chemistry, not war

Аватара пользователя
Elbereth
Сообщения: 41
Зарегистрирован: Ср авг 17, 2011 2:38 am

Re: оценить тип связи

Сообщение Elbereth » Вс ноя 11, 2012 2:18 pm

Shorku писал(а):Можно еще по вкладам в натуральную связевую орбиталь

[ Post made via Android ] Изображение
а поподробнее?

VTur
Сообщения: 7357
Зарегистрирован: Пт авг 31, 2007 1:36 pm

Re: оценить тип связи

Сообщение VTur » Вс ноя 11, 2012 8:56 pm

Если исходить из кв.хим. Связи как перекрывания атомных орбиталей, то ковалентный порядок связи можно расчитать по Чиословскому (Cioslovsky)

[ Post made via Android ] Изображение
После отстоя требуйте долива

Аватара пользователя
Droog_Andrey
Сообщения: 2700
Зарегистрирован: Сб сен 29, 2007 8:29 pm
Контактная информация:

Re: оценить тип связи

Сообщение Droog_Andrey » Пн ноя 12, 2012 1:22 am

Можно по высоте барьеров гомо- и гетеролитического разрыва. Но это долго.
2^74207281-1 is prime!

Аватара пользователя
EvgeniX
Сообщения: 2780
Зарегистрирован: Пт апр 27, 2007 5:32 am

Re: оценить тип связи

Сообщение EvgeniX » Пн ноя 12, 2012 6:42 am

Droog_Andrey писал(а):Можно по высоте барьеров гомо- и гетеролитического разрыва. Но это долго.
А если их на основе каких-нибудь реакционных индексов предсказывать?

leos
Сообщения: 30
Зарегистрирован: Вс ноя 29, 2009 9:40 pm

Re: оценить тип связи

Сообщение leos » Пн ноя 12, 2012 7:46 pm

Elbereth писал(а):
Shorku писал(а):Можно еще по вкладам в натуральную связевую орбиталь

[ Post made via Android ] Изображение
а поподробнее?
см. http://en.wikipedia.org/wiki/Natural_bond_orbital
и ссылки

Такой анализ встроен, в частности, в G03, G09

Аватара пользователя
Лечащий Врач
Сообщения: 382
Зарегистрирован: Вс окт 26, 2003 2:09 pm
Контактная информация:

Re: оценить тип связи

Сообщение Лечащий Врач » Пн ноя 12, 2012 11:51 pm

Если попробуете байдеристику, то вас интересует подход Кремера и Краки. С оценкой типа связи этим методом спорить не будет никто :) Другое дело, что вообще-то ответ на такой вопрос часто можно угадать заранее - у вас какая связь, хотя бы примерно? Между какими атомами?

Аватара пользователя
Shorku
Сообщения: 1075
Зарегистрирован: Вт дек 13, 2011 2:17 pm

Re: оценить тип связи

Сообщение Shorku » Вт ноя 13, 2012 12:03 am

Лечащий Врач писал(а): Другое дело, что вообще-то ответ на такой вопрос часто можно угадать заранее - у вас какая связь, хотя бы примерно? Между какими атомами?
Ну для одной молекулы в общем-то и толку от всех этих цифр столько же, сколько и от угадывания- одинаково правильно и одинаково бесполезно. Вот если есть ряд соединений и надо смотреть тренд, особенно если он не слишком очевидный, это уже другое дело.
Make quantum chemistry, not war

Аватара пользователя
EvgeniX
Сообщения: 2780
Зарегистрирован: Пт апр 27, 2007 5:32 am

Re: оценить тип связи

Сообщение EvgeniX » Вт ноя 13, 2012 12:20 am

Ну так смотрите заряды, в чём проблема?

Аватара пользователя
Droog_Andrey
Сообщения: 2700
Зарегистрирован: Сб сен 29, 2007 8:29 pm
Контактная информация:

Re: оценить тип связи

Сообщение Droog_Andrey » Вт ноя 13, 2012 7:38 am

EvgeniX писал(а):А если их на основе каких-нибудь реакционных индексов предсказывать?
Всё равно придётся моделировать реакции, чтобы удостовериться в нужном механизме.
Лечащий Врач писал(а):Если попробуете байдеристику, то вас интересует подход Кремера и Краки. С оценкой типа связи этим методом спорить не будет никто :) Другое дело, что вообще-то ответ на такой вопрос часто можно угадать заранее
Эх, если было так просто... ну вот пробная лошадка: какая связь между кислородом и кремнием в (SiF3)2O?
2^74207281-1 is prime!

Аватара пользователя
Лечащий Врач
Сообщения: 382
Зарегистрирован: Вс окт 26, 2003 2:09 pm
Контактная информация:

Re: оценить тип связи

Сообщение Лечащий Врач » Вт ноя 13, 2012 12:11 pm

Droog_Andrey писал(а):Эх, если было так просто... ну вот пробная лошадка: какая связь между кислородом и кремнием в (SiF3)2O?
С вероятностью 90% (моя оценка) по Кремеру-Краке будет промежуточная ;) Связи Si-O, даже в обычной ковалентной кремнийорганике, часто имеют положительный лапласиан электронной плотности в КТ(3,-1), то есть, грубо говоря, облака электронной плотности, отвечащие атомам, оказываются по направлению этой связи существенно разделены. Локальная же плотность электронной энергии будет, скорее всего, отрицательной, потому что связь достаточно короткая и на ней локализована достаточная электронная плотность, в отличие от, напр, Li+...F-.

Аватара пользователя
Droog_Andrey
Сообщения: 2700
Зарегистрирован: Сб сен 29, 2007 8:29 pm
Контактная информация:

Re: оценить тип связи

Сообщение Droog_Andrey » Ср ноя 14, 2012 1:04 am

А по мне так там связь более ионная, чем в молекуле LiF. :) Валентный угол Si=O=Si болтается как хочет и спокойно принимает значение в 180°, можно по желанию добавлять или отщеплять SiF3+, причём в (SiF3)3O+ кислород плоско трёхкоординирован (C3h), т.е., по сути, трифторсилилы катаются по круглому кислороду, как хотят, и никакой тут направленности или насыщаемости - вполне себе ионная связь, разве что вместо обычной поляризации деформация плоского SiF3+ в пирамидку, ну так это и с каким-нибудь NO2+ порой случается :)
2^74207281-1 is prime!

Аватара пользователя
Лечащий Врач
Сообщения: 382
Зарегистрирован: Вс окт 26, 2003 2:09 pm
Контактная информация:

Re: оценить тип связи

Сообщение Лечащий Врач » Ср ноя 14, 2012 12:58 pm

Ну, предположить, что за столь простым соединением стоит столь мощная аргументация, я не мог. Не бросите в тему WFN-файл? Потому что, ну, гибкость валентного угла - это в общем не вполне аргумент в пользу ионности, с точки зрения рентгенщика :)

Ferom
Сообщения: 1049
Зарегистрирован: Чт дек 16, 2010 11:43 am

Re: оценить тип связи

Сообщение Ferom » Ср ноя 14, 2012 8:46 pm

А почему нельзя просто оценить вклад в энергию связи из обменных интегралов (как это было сделано Лондоном)? Вычленить энергию обменного взаимодействия и сравнить ее с полной энергией связи. И если обменное взаимодействие сравнительно велико, то связь будет близка к ковалентной, не так?

VTur
Сообщения: 7357
Зарегистрирован: Пт авг 31, 2007 1:36 pm

Re: оценить тип связи

Сообщение VTur » Ср ноя 14, 2012 8:53 pm

Это было бы так, если бы расчет шел в мотоде валентных связей, но считают то все в хартри-фоковских канонических орбиталях
Обменное взаимодействие между чем? Разными орбиталями, размазанными по всей молекуле?

[ Post made via Android ] Изображение
После отстоя требуйте долива

Ferom
Сообщения: 1049
Зарегистрирован: Чт дек 16, 2010 11:43 am

Re: оценить тип связи

Сообщение Ferom » Ср ноя 14, 2012 9:07 pm

VTur, так вот и ответ… Может достаточно указать в опциях вместо хартри-фока - GVB?

П.С. Возможно, я путаю или плохо помню, но разве одноцентровые и двухцентровые интегралы в фокиане это не аналог обменных интегралов?

VTur
Сообщения: 7357
Зарегистрирован: Пт авг 31, 2007 1:36 pm

Re: оценить тип связи

Сообщение VTur » Ср ноя 14, 2012 10:06 pm

Ferom писал(а):VTur, так вот и ответ… Может достаточно указать в опциях вместо хартри-фока - GVB?

П.С. Возможно, я путаю или плохо помню, но разве одноцентровые и двухцентровые интегралы в фокиане это не аналог обменных интегралов?
Они к атомам никакого отношения не имеют - МО орбитали многоцентровые и не существует способа разделить их на части. Обменные интегралы возникают в орбитальных теориях в силу представления единой неделимой волновой функции в виде антисимметризованного произведения - определителя и являются артефактами теории, в ур Ш никах обменных интегралов нет.
Однако в GVB разработан формализм на основе интегралов перекрывания по качественному определению долей ионности и ковалентности в порядке связи.
Поэтому, да, можно посоветовать сменить теорию, но там цифры будут относительными и сами по себе они ничего не говорят. Нужно будет просчитать одинаковым набором метод/базис кучу реперных веществ, сравнить с изучаемым и на основе корреляции сделать вывод

[ Post made via Android ] Изображение
После отстоя требуйте долива

Аватара пользователя
Droog_Andrey
Сообщения: 2700
Зарегистрирован: Сб сен 29, 2007 8:29 pm
Контактная информация:

Re: оценить тип связи

Сообщение Droog_Andrey » Ср ноя 14, 2012 11:12 pm

Лечащий Врач писал(а):Не бросите в тему WFN-файл? Потому что, ну, гибкость валентного угла - это в общем не вполне аргумент в пользу ионности, с точки зрения рентгенщика :)
Гибкость сама по себе - не аргумент, конечно.

WFN-а нету, но вот считал когда-то Гауссианом: http://www.primefan.ru/stuff/chem/sif3.rar
2^74207281-1 is prime!

Ответить

Вернуться в «квантовая химия и моделирование»

Кто сейчас на конференции

Сейчас этот форум просматривают: нет зарегистрированных пользователей и 77 гостей