Ван дер Ваальсовы радиусы элементов Mn, Fe, Cu, Zn

вопросы строения молекул и квантовой химии
Ответить
Ferom
Сообщения: 1049
Зарегистрирован: Чт дек 16, 2010 11:43 am

Ван дер Ваальсовы радиусы элементов Mn, Fe, Cu, Zn

Сообщение Ferom » Пн сен 24, 2012 7:01 pm

Хотел сделать расчет PCM, но в GAMESS10 данных для этих элементов нет. И вообще в GAMESS информация по ван дер Ваальсовым радиусам элементов довольно скудная со ссылкой на статью A.Bondi, J.Chem.Phys. 68: 441-451(1964), (да и гуглится плохо). Неужели с 1964 года никакой новой информации не появилось?

endlesslake
Сообщения: 209
Зарегистрирован: Чт авг 09, 2012 9:13 pm

Re: Ван дер Ваальсовы радиусы элементов Mn, Fe, Cu, Zn

Сообщение endlesslake » Пн сен 24, 2012 7:39 pm

в орке для COSMO с марганца по цинк используется одно и тоже значение 2.223 А.

Ferom
Сообщения: 1049
Зарегистрирован: Чт дек 16, 2010 11:43 am

Re: Ван дер Ваальсовы радиусы элементов Mn, Fe, Cu, Zn

Сообщение Ferom » Пн сен 24, 2012 8:14 pm

Спасибо. Но возникает вопрос: Из каких соображений взято именно это число, и на кого ссылку делать?
В GAMESS для K(19) – 2.31A, для As(33) – 2.00A, между ними нули.

avelon
Сообщения: 492
Зарегистрирован: Ср авг 12, 2009 5:09 pm

Re: Ван дер Ваальсовы радиусы элементов Mn, Fe, Cu, Zn

Сообщение avelon » Пн сен 24, 2012 8:27 pm

лучше берите SMD модель в GAMESS US и в ней уже зашиты все нужные радиусы для всех элементов. а полученные результаты будут лучше чем в PCM

endlesslake
Сообщения: 209
Зарегистрирован: Чт авг 09, 2012 9:13 pm

Re: Ван дер Ваальсовы радиусы элементов Mn, Fe, Cu, Zn

Сообщение endlesslake » Вт сен 25, 2012 12:08 am

посмотрел мануал орки, - не смог найти в итоге, откуда эта цифра взялась, к сожалению. Вообще, я не удивлюсь, если она взята от фонаря практически, и для аккуратного рассчета комплексов у которых металл торчит наружу нужно эти места затыкать растворителем. А для соединений у которых снаружи только лиганды этот радиус просто не имеет значения.

Ответить

Вернуться в «квантовая химия и моделирование»

Кто сейчас на конференции

Сейчас этот форум просматривают: Baidu [Spider] и 8 гостей