US GAMESS Installation on Linux

вопросы строения молекул и квантовой химии
Ответить
Аватара пользователя
propellane
Сообщения: 253
Зарегистрирован: Пт сен 12, 2008 5:23 pm

US GAMESS Installation on Linux

Сообщение propellane » Чт июн 07, 2012 3:45 pm

Здравствуйте. Столкнулся с проблемой не могу скомпилить US GAMESS 1 may 2012 на Linux (OpenSuse 12.1). Кто компилировал не могли бы дать подробную инструкцию. Выкладываю ссылку с паролем на сам GAMESS для х86 Linux. Компилирую без MKL

Код: Выделить всё

http://www.msg.chem.iastate.edu/GAMESS/download/dist.source.shtml пароль: bTxBNAsM следующая неделя: VcBiSLFz
До этого собирал успешно 2010 версию но в последней 1may 2012 никак не могу разобраться, делаю так
1) ./config
Выбираю
linux 32
GAMES directory /home/propellane/gamess
gfortran
math libriry none
Version 00
2)Выделяю максимальное кол-во разделяемой памяти
/sbin/sysctl -w kernel.shmmax=1610612736
3)./compddi >& compddi.log и перемещаю ddikick.x в ~/gamess
4)./compall >& compall.log
5)./lked gamess 00 >& lked.log
6) А дальше самое интересное надо отредактировать rungms
раньше ставил пути как ./ так set SCR=./ ...PATHGMS=./
теперь перепробывал все и set SCR=/home/propellane/scr/$USER создал папки /home/propellane/scr/propellane
set PATHGMS=/home/propellane/gamess

там еще надо вроде отредактировать VERNO, ERICFMT, MCPPATH закоментить что то. Вообщем плиз поделитесь инструкцией все перепробывал выдает ошибку с ddikick
Не верьте в чудеса — прямо полагайтесь на них....

Аватара пользователя
Yurii
Сообщения: 682
Зарегистрирован: Сб авг 11, 2007 1:59 am

Re: US GAMESS Installation on Linux

Сообщение Yurii » Пт июн 08, 2012 7:13 pm

прозвище "Фабержé" легендарный разведчик Дроздов получил за свое уникальное умение работать с информацией, добывать ее и превращать в драгоценность высшей пробы.

Аватара пользователя
propellane
Сообщения: 253
Зарегистрирован: Пт сен 12, 2008 5:23 pm

Re: US GAMESS Installation on Linux

Сообщение propellane » Сб июн 09, 2012 9:13 pm

на Webmo я уже смотрел не катит, там собрали все вместе например там пишут

setenv ERICFMT /usr/local/gamess/ericfmt.dat
setenv MCPPATH /usr/local/gamess/mcppath

хотя это было в предыдущих версиях, теперь там задаются как переменные

setenv ERICFMT $SCR/$JOB/ericfmt.dat
setenv MCPPATH $SCR/$JOB/mcpdata

В посл. версии нет

if ($os == Linux) set GMSPATH

и т.д.

Заранее скажу смотрел еще здесь
http://molecularmodelingbasics.blogspot ... ux-pc.html
http://gamess-linux.blogspot.com/2010/0 ... 6-bit.html
Не верьте в чудеса — прямо полагайтесь на них....

o-oxhem
Сообщения: 425
Зарегистрирован: Вт июл 08, 2008 10:33 pm

Re: US GAMESS Installation on Linux

Сообщение o-oxhem » Вс июн 10, 2012 11:02 am

propellane писал(а):Здравствуйте. Столкнулся с проблемой не могу скомпилить US GAMESS 1 may 2012 на Linux (OpenSuse 12.1). Кто компилировал не могли бы дать подробную инструкцию. Выкладываю ссылку с паролем на сам GAMESS для х86 Linux. Компилирую без MKL
До этого собирал успешно 2010 версию но в последней 1may 2012 никак не могу разобраться, делаю так
1) ./config
Выбираю
linux 32
GAMES directory /home/propellane/gamess
gfortran
math libriry none
Version 00
Несколько странно, что Вы собираете GAMESS-US БЕЗ математических библиотек.

Аватара пользователя
Yurii
Сообщения: 682
Зарегистрирован: Сб авг 11, 2007 1:59 am

Re: US GAMESS Installation on Linux

Сообщение Yurii » Вт июн 12, 2012 5:53 pm

propellane писал(а):на Webmo я уже смотрел не катит...
Возможно: я его использовал в свое время из-за отсутсвия m062x в гауссиане. А так он мне и даром не нужен: для больших высокосимметричных систем все гамессы совершенно непригодны.
прозвище "Фабержé" легендарный разведчик Дроздов получил за свое уникальное умение работать с информацией, добывать ее и превращать в драгоценность высшей пробы.

Ответить

Вернуться в «квантовая химия и моделирование»

Кто сейчас на конференции

Сейчас этот форум просматривают: Baidu [Spider] и 7 гостей