Поверхность потенциальной энергии

[AlexKsen]

Уважаемые форумчане, первый раз сталкиваюсь с такой задачей нужно сканировать поверхность потенциальной энергии в зависимости от точек.
Работаю в Гауссиане. Я не понимаю, как задать входной файл.
Вот, например в приклепленном документе оптимизированная структура - это тестовый расчет, сделан в РМ6. Как задать правильно входной файл, чтобы сканировать по отношению кислород уксусной кислоты - - водород связанный с азотом у координационного центра.
Помогите, если не сложно!

[АлександрI]

Ну, Вы опять за своё - считать... Я понимаю - дармовая гауссиана...
Сначала об исходных: Почему Вы взяли цинк, только из-за того, что - думаете - ацетат цинка - не димер?
Далее - сам анион Ас^2- вовсе не такой, как Вы задали в исходной модели: уже в самой НАс карбоксильный водород болтается между двумя кислородами с делоклализованной эл. пл.
А после диссоциации этот крокодил с открытой пастью - остаётся. А Вы выбрали один из них и прицепили к цинку (что к цинку - правильно). А делокализация на карбоксильной группе-то осталась.
Только перестроилась. Этот аспект в уже не в КХ, а в элементарной химии Вашего комплексного соединения чрезвычайно важен. А Вы думаете, что G Inc. за Вас химию учила? Так эта бедная корбоксильная группа по ходу оптимизации и осталась искарёженной... А этого только и ждал водород близлежащей метильной группы и присобачился ко второму кислороду Н-связью соответственно изогнувшись. А с учётом делокализации этого не было бы.
Т.е. если взять гнилое мясо, то получится гнилая котлета.
А Вы ещё в этой котлете захотели иметь хрящик -

кислород уксусной кислоты - - водород связанный с азотом

т.е. координационную связь длиной более 6 анг с спрятавшимся глубоко в молекуле водородом, протонирующим оставшийся червёртый азот. Это вообще ни в какие ворота не лезет, тем более, что с её участием Вы хотите строить ППЭ...
О других аспектах - будет слишком длинный пост. Поэтому, если покороче, примите моё пожелание (уже вроде вторичное) - снчала думать - потом считать (во всяком случае в химии КС).