Курс лекций "Теория молекулярно-динамических расчетов" (ВИДЕО)

вопросы строения молекул и квантовой химии
Ответить
comcon1
Сообщения: 27
Зарегистрирован: Ср дек 18, 2013 12:12 pm

Курс лекций "Теория молекулярно-динамических расчетов" (ВИДЕО)

Сообщение comcon1 » Пт дек 16, 2016 3:02 pm

Уважаемы вычислители.

Мы закончили первый год курса "Теория молекулярно-динамических расчетов". Хотим представить видеозаписи лекций на суд общественности.

Список всех видео с аннотациями по курсу "Теория молекулярно-динамических расчетов"

В курсе излагаются теоретические основы проведения и обработки молекулярно-динамических расчетов. Материал достаточно сложный и не рекомендуется тем, кто хочет ознакомиться с тем, что такое молекулярная динамика. Напротив, курс предполагает, что слушатель уже в некоторой степени знаком с вычислительной химией и предлагает рассмотреть данный материал всерьез. В первой части курса рассказывается о технологиях расчета потенциальной энергии, во второй части — о технологиях интегрирования уравнений движения. В заключительной части рассказывается об извлечении информации из траекторий МД. Основными опорными учебниками курса являются «Molecular simulation of Liquids» (M. Allen, D. Tidesley) и «Understanding molecular simulations» (D. Frenkel, B. Smith), хотя некоторых вещей там нет.

В лекциях существенно ненулевое количество матана, статов, теормеха и разных других аспектов физики.

Для примера вот аннотация одной из лекций:
"Лекция 5Б. Термостат. Виды термостатов. Термостат Нозе. Лагранжева механика. Расширение системы — координата «bath». Лагранжево представление расширенной системы в термостате Нозе. Выведение канонического распределение для подсистемы. Свойства дельта-функции. Настройки термостата Нозе, цепочки вложенных термостатов."
и сама лекция https://www.youtube.com/watch?v=ObnuAnY ... e=youtu.be

Естественно, в лекциях бывают ошибки, затупы и вообще не слишком удачные места. В следующем году (если нам вдруг не снимут курс) практически все лекции планируется переснять. Однако эти версии мы хотели бы вывесить уже сейчас. Наверняка, найдутся те, кому они будут интересны и понятны. Большая просьба к потенциальным зрителям - если видите ошибку или хотите оставить какой-то комментарий именно к конкретной лекции - пожалуйста делайте это прямо на YouTube, а не здесь и не в коментах сайта ERG.

Аватара пользователя
uchebnik fiziki
Сообщения: 4265
Зарегистрирован: Пн авг 20, 2012 9:04 pm

Re: Курс лекций "Теория молекулярно-динамических расчетов" (ВИДЕО)

Сообщение uchebnik fiziki » Пт дек 16, 2016 4:46 pm

Хорошее дело! Но выглядит ужасно, ничего не слышно.

Рекомендации:
1. Поставьте нормальный свет, но лучше дополнять презенташками и видео, если возможно.
2. Купите микрофон и пишите звук с него, а не с камеры.
3. Вырежьте паузы.
4. Сделайте нормальный текст в качестве основы.
Свобода, равенство, братство.

Или смерть.

comcon1
Сообщения: 27
Зарегистрирован: Ср дек 18, 2013 12:12 pm

Re: Курс лекций "Теория молекулярно-динамических расчетов" (ВИДЕО)

Сообщение comcon1 » Пт дек 16, 2016 5:09 pm

Спасибо. Это примерно понятно.

На первом году курса особенно заморачиваться с постановкой съемок мы не стали, потому что содержание пока не вызывает нашего удовлетворения. Сейчас мы подождем отзывов и комментариев по сути, примем экзамен, скорректируем программу. А снимать красиво будем, наверное, год на третий.

Аватара пользователя
uchebnik fiziki
Сообщения: 4265
Зарегистрирован: Пн авг 20, 2012 9:04 pm

Re: Курс лекций "Теория молекулярно-динамических расчетов" (ВИДЕО)

Сообщение uchebnik fiziki » Пт дек 16, 2016 5:29 pm

А вы это делаете как онлайн-курс в рамках каких-то там универовских программ?
Свобода, равенство, братство.

Или смерть.

comcon1
Сообщения: 27
Зарегистрирован: Ср дек 18, 2013 12:12 pm

Re: Курс лекций "Теория молекулярно-динамических расчетов" (ВИДЕО)

Сообщение comcon1 » Пт дек 16, 2016 5:39 pm

Это не онлайн-курс. Это обычный спецкурс, просто мы снимаем его теоретическую часть - там вопросы студентов возникают прямо на видео. Одна пара в неделю лекций + одна пара практикума, который снимать бессмысленно :)

Аватара пользователя
surius
Сообщения: 1489
Зарегистрирован: Пт сен 21, 2007 11:20 am

Re: Курс лекций "Теория молекулярно-динамических расчетов" (ВИДЕО)

Сообщение surius » Сб дек 17, 2016 3:46 pm

Отличная задумка.
Скажите, а вы это на голом энтузиазме делаете или у вас есть грант на выпуск курса. Просто это большая работа, участие в которой должны принимать не только хорошие лекторы но и проф. звуко- и видео операторы/монтажеры. Возможно есть варианты добыть деньги у универа? Обычно администрация не скупиться давать деньги на подобного рода проэкты. Популяризация как никак, ну и всякие там рейтинги опять таки явно или не явно учитывают подобные проекты
"Bite my shiny metal ass"
Bender

comcon1
Сообщения: 27
Зарегистрирован: Ср дек 18, 2013 12:12 pm

Re: Курс лекций "Теория молекулярно-динамических расчетов" (ВИДЕО)

Сообщение comcon1 » Сб дек 17, 2016 6:53 pm

мы просто снимаем тот курс, который ведем. Никакой специальной видеоработой мы не занимались. Основной потоковый курс нашего профессора по матбиологии (Г.Ризниченко) тоже весь записан и безо всякого монтажа. И никто никаких денег ей не предлагал, хотя ее курс не в пример более серьезный и масштабный. Думаю, в следующий раз мы возьмем манжетку с микрофоном и будем писать звук с нее. И писать постараемся крупнее и тупить меньше. На какие-то бОльшие телодвижения у нас просто физически не будет времени.

Вопрос про гранты вообще хорош. Я сейчас с ходу нашел только гранты Потанина для преподавателей магистратуры. В следующем году можно будет попробовать сунуть.. Ничего больше не нашел. Если вы что-то знаете - думаю, все вам будут благодарны за ссылки (не только мы).

Аватара пользователя
uchebnik fiziki
Сообщения: 4265
Зарегистрирован: Пн авг 20, 2012 9:04 pm

Re: Курс лекций "Теория молекулярно-динамических расчетов" (ВИДЕО)

Сообщение uchebnik fiziki » Сб дек 17, 2016 10:39 pm

https://distant.msu.ru/
бабло из программы развития, как я понимаю
Свобода, равенство, братство.

Или смерть.

Аватара пользователя
surius
Сообщения: 1489
Зарегистрирован: Пт сен 21, 2007 11:20 am

Re: Курс лекций "Теория молекулярно-динамических расчетов" (ВИДЕО)

Сообщение surius » Сб дек 17, 2016 11:55 pm

comcon1 писал(а): Вопрос про гранты вообще хорош. Я сейчас с ходу нашел только гранты Потанина для преподавателей магистратуры. В следующем году можно будет попробовать сунуть.. Ничего больше не нашел. Если вы что-то знаете - думаю, все вам будут благодарны за ссылки (не только мы).
Я, к сожалению, совсем не осведомлен о такого рода грантах. Но если бы мне нужно было найти деньги на нечто подобное я бы пошел по цепочке институтских инстанций. У универов/институтов обычно есть соответствующие статьи расходов на подобную деятельность - а у МГУ деньги на пропаганду быть должны, я думаю. Насколько реально получить эти деньги "с разгона" это другой вопрос и тут бы спросить у кого-нибудь кто уже ходил по этой тропке. Может ваш шеф легче найдет путь к "источнику" :dontknow:

Несколько лет назад на хабре была статья про то как писать видео лекции + комментарии к ней - может вам будет полезно?!
Habra
"Bite my shiny metal ass"
Bender

Аватара пользователя
Shorku
Сообщения: 1075
Зарегистрирован: Вт дек 13, 2011 2:17 pm

Re: Курс лекций "Теория молекулярно-динамических расчетов" (ВИДЕО)

Сообщение Shorku » Вс дек 18, 2016 8:40 pm

Спасибо! Судя по оглавлению, вторая половина курса должна быть очень полезной.
Кстати, а почему во водной лекции стретч и бендинг энергии нарисованы как 1/х^2, а не x^2, я чего-то не так понимаю, или это просто опечатки?
Make quantum chemistry, not war

comcon1
Сообщения: 27
Зарегистрирован: Ср дек 18, 2013 12:12 pm

Re: Курс лекций "Теория молекулярно-динамических расчетов" (ВИДЕО)

Сообщение comcon1 » Вс дек 18, 2016 10:01 pm

Это, очевидно очепятка. Нарисована как раз парабола, а подписано с ошибкой. Спасибо - я поставил на видео комент, что на такой-то секунде на доске ошибка. Я говорю - если что-то смотрите и видите ошибку - не стесняйтесь, пожалуйста, об этом писать прямо туда. многое очевидное пропускается, некоторые места могут иметь концептуальные ошибки.

Ответить

Вернуться в «квантовая химия и моделирование»

Кто сейчас на конференции

Сейчас этот форум просматривают: нет зарегистрированных пользователей и 56 гостей