Подготовка файла для CCDC и SI

вопросы строения молекул и квантовой химии
Ответить
Аватара пользователя
surius
Сообщения: 1489
Зарегистрирован: Пт сен 21, 2007 11:20 am

Подготовка файла для CCDC и SI

Сообщение surius » Пт июл 22, 2016 1:33 pm

Коллеги, прошу совета, а точнее инструкции - как подготовить и загрузить файл для CCDC (Cambridge Crystallographic Data Centre) - какие-то подводные камни?. A также, если я помню правильно, файл который идет в суппортинг, тоже не просто CIF?!
До этого времени эту работу за меня делали умные дядьки, но сейчас ее сделать некому.

Заранее спасибо!

PS/Для модератора
если на ваше усмотрение локализация топика выбрана неудачно, прошу перенести ее более подходящее место
"Bite my shiny metal ass"
Bender

Аватара пользователя
Гесс
Сообщения: 13067
Зарегистрирован: Ср фев 15, 2012 11:19 pm

Re: Подготовка файла для CCDC и SI

Сообщение Гесс » Пт июл 22, 2016 1:50 pm

Я бы сказал физхимия. Но подождем пару дней...

Аватара пользователя
VIPer
Сообщения: 387
Зарегистрирован: Вт фев 13, 2007 10:17 pm

Re: Подготовка файла для CCDC и SI

Сообщение VIPer » Пн июл 25, 2016 2:54 pm

имеется в виду просто продепонировать структуру в CCDC? последний раз, когда депонировал вручную, они написали, что неплохо бы использовать автоматизированную систему, но я как-то сильно в неё не всматривался.. я обычно раньше проверял cif http://checkcif.iucr.org/ (есть и оффлайн клиент, который всё равно с сайтом взаимодействует), там вроде иногда запрашивают fcf или res файл, не помню точно. если никаких алертов страшных нет, то отправлял им по почте, и на следующий день обычно приходит ответ с номером депозита.
насчёт SI - видимо, зависит от журнала. я когда в acta cryst писал, там всё оформляется с помощью их спецсофта publCIF внутрь CIF-файла как раз (таблицы, весь текст статьи по сути), картинки отдельно. SI у них генерируется автоматически на основе данных из CIF. про другие журналы, к сожалению, пока ничего сказать не могу..

Аватара пользователя
surius
Сообщения: 1489
Зарегистрирован: Пт сен 21, 2007 11:20 am

Re: Подготовка файла для CCDC и SI

Сообщение surius » Вт авг 16, 2016 12:02 am

VIPer писал(а): я обычно раньше проверял cif http://checkcif.iucr.org/ (есть и оффлайн клиент, который всё равно с сайтом взаимодействует), там вроде иногда запрашивают fcf или res файл, не помню точно. если никаких алертов страшных нет, то отправлял им по почте, и на следующий день обычно приходит ответ с номером депозита.
Спасибо за ответ, проверяльщик действительно отличная штука.
"Bite my shiny metal ass"
Bender

Ответить

Вернуться в «квантовая химия и моделирование»

Кто сейчас на конференции

Сейчас этот форум просматривают: нет зарегистрированных пользователей и 9 гостей