Спиновая плотность Визуализация.

вопросы строения молекул и квантовой химии
Ответить
we909
Сообщения: 1
Зарегистрирован: Вт сен 15, 2015 1:56 pm

Спиновая плотность Визуализация.

Сообщение we909 » Пн ноя 23, 2015 4:12 pm

Здравствуйте! Позвольте вопрос немного не по теме.
Имеется спиновая плотность p(x,y,z) в cube файле firefly. Какой программой можно визуализировать p(r) или хотя бы получить ее из cube?

Аватара пользователя
Гесс
Сообщения: 13067
Зарегистрирован: Ср фев 15, 2012 11:19 pm

Re: Спиновая плотность Визуализация.

Сообщение Гесс » Пн ноя 23, 2015 4:37 pm

Выделил в отдельную тему.
Если cube нормальный - то VMD или Chimera. (Химера атомы в кубе не увидит, ей их надо будет скормить отдельным xyz, VMD достаточно одного cube, но надо строить дополнительную изоповерхность). Впринципе Chemcraft тоже может открыть куб, но выкручивать value вручную может быть долго, особенно когда непонятно в какую сторону крутить.

alxyppv
Сообщения: 560
Зарегистрирован: Сб апр 07, 2007 11:23 am

Re: Спиновая плотность Визуализация.

Сообщение alxyppv » Пн ноя 23, 2015 10:32 pm

На мой взгляд, в Chemcraft как раз проще. Открываешь файл, ставишь знчение 0.001-0.002 (для сптновой плотности) и вперед. VMD конечно гораздо больше может в смысле красивости картинок, но и возни с ним гораздо больше, и для человека без особого опыта визуализации - барьер вхождения все-таки гораздо выше. Так что если надо быстро и просто - то тут Chemcraft на первом месте.
А.П.

Ответить

Вернуться в «квантовая химия и моделирование»

Кто сейчас на конференции

Сейчас этот форум просматривают: нет зарегистрированных пользователей и 82 гостя