Скорость конформационных изменений

вопросы строения молекул и квантовой химии
Ответить
anasanity
Сообщения: 14
Зарегистрирован: Чт янв 30, 2014 5:48 pm

Скорость конформационных изменений

Сообщение anasanity » Пт апр 03, 2015 12:20 am

Здравствуйте.

Буду благодарен, если поможете в следующем вопросе. Есть реакция перенесения протона в составе пары азотистых оснований (то есть она первого порядка), с энергией активации около 16 ккал/моль (газовая фаза, 298 K). Эта реакция исследуется для нескольких экзоциклических модификаций одного из оснований. Например, есть урацил, к которому присоединена oxyacetic acid (извиняюсь, не разбираюсь в правильной номенклатуре на русском). Эта модификация исследуется в двух конформациях - закрытой (есть внутремолекулярная водородная связь карбоксильной группы с кислородом урацила) и открытой (нет внутремол. водородных связей). Стоит задача решить решить уравнения скорости для системы, в которой продукт и реагент имеют по две конформации. Важно включать их в систему, так как для продуктов и реагентов основная конформация отличается. Такая же задача стоит для той же реакции и с другими, немного большими модификациями. Искать переходные состояния для конформационных изменений не хочется.
Вопрос: можно ли, исходя из размера модификации и энергии внутремол. вод. связи оценить скорость конформационных изменений, что бы быть уверенным в том, что она намного выше скорости реакции?

Ответить

Вернуться в «квантовая химия и моделирование»

Кто сейчас на конференции

Сейчас этот форум просматривают: Baidu [Spider] и 10 гостей