Визуализация геликатов

[AlexKsen]

Здравствуйте, уважаемые форумчане. Может, кто сталкивался, в каких программах можно сделать подобную визуализацию. В PyMOL не нашел, а может просмотрел.

[uchebnik fiziki]

а что там визуализировано?

[Гесс]

а что там визуализировано?

судя по статьям откуда взяты картинки - "по*уй что: любые алкильные или пептидные цепочки произвольного состава и строения, лишь бы показать общее положение цепочки не загромождая картинку деталями". Нечто похожее имхо часто делают для полипептидов и белков, спиралей днк и пр. Могу попытать народ в понедельник, но для начала бы рекомендовал поискать в VMD (может и не быть, это предположение).
UPD1 RasMol и таки PyMol http://www.google.de/imgres?imgurl=http ... CD4QrQMwCg
UPD2 Более полный ответ http://en.wikipedia.org/wiki/Ribbon_diagram

[uchebnik fiziki]

Разве это белковые фрагменты? По картинке как бы не сказать.

[Гесс]

Разве это белковые фрагменты? По картинке как бы не сказать.

В статьях там не белки, а что есть принципиальная разница спираль "чего" отображать?

[uchebnik fiziki]

Как бы там не то чтобы принципиальная разница, но программы визуализации белков обычно заточены именно под белки. Визуализация спиралей нуклеиновых кислот осуществляется по другим канонам, чем белки, например, и почти наверняка с помощью иного кода.

[AlexKsen]

Визуализированы в тех статьях геликаты. Я занимаюсь подобными объектами (один из таких рис.). PyMOL и Chimera что-то похожее умеют, но это немного не то, хотелось, чтобы получилось как на представленных картинках. Гесс, если Вам удастся поговорить с коллегами, я буду Вам благодарен.

[uchebnik fiziki]

прозреваю из общих соображений, что это какая-то из программ трёмерной графики типа 3DMax

[Гесс]

Гесс, если Вам удастся поговорить с коллегами, я буду Вам благодарен.

вероятно povray, но для него возможно нужен инпут который вероятно можно сделать в vmd.
Короче я в povray не работал и оставляю эту часть вам.

[AlexKsen]

Спасибо большое:) povray, вроде, устанавливается по умолчанию с HyperChem.