sp3.63 гибридизация азота в NH связи имино группы
sp3.63 гибридизация азота в NH связи имино группы
Здравствуйте.
Вообщем, вопрос в названии. Как такое может быть? Вкладываю лог. С гибридизацией азота в NC связи все в порядке. Поляризация NH связи только уменьшилась по сравнению с амино таутомером, у которого была 2.42 гибридизация (из-за p характера неподеленной пары у планарной аминогруппы), так что за счет этого p характер не мог увеличиться. Буду благодарен за все идеи.
Может я просто чего-то элементарного не знаю, тогда сразу извиняюсь.
Вообщем, вопрос в названии. Как такое может быть? Вкладываю лог. С гибридизацией азота в NC связи все в порядке. Поляризация NH связи только уменьшилась по сравнению с амино таутомером, у которого была 2.42 гибридизация (из-за p характера неподеленной пары у планарной аминогруппы), так что за счет этого p характер не мог увеличиться. Буду благодарен за все идеи.
Может я просто чего-то элементарного не знаю, тогда сразу извиняюсь.
У вас нет необходимых прав для просмотра вложений в этом сообщении.
Re: sp3.63 гибридизация азота в NH связи имино группы
О гибридизации корректно можно говорить только в минимальном базисе.
В Вашем базисе никакой гибридизации быть не может. Точнее может, но совершенно бессмысленная. Из-за этого получаются такие числа.
В Вашем базисе никакой гибридизации быть не может. Точнее может, но совершенно бессмысленная. Из-за этого получаются такие числа.
После отстоя требуйте долива
-
endlesslake
- Сообщения: 209
- Зарегистрирован: Чт авг 09, 2012 9:13 pm
Re: sp3.63 гибридизация азота в NH связи имино группы
В целом, мне такой результат странным не кажется. В имине пара приобрела больший s-характер, а связь с достаточно электроотрицательным водородом - больший p. Уменьшение поляризации как следствие. Опять же, не кажется странным, что CH2=NH и CH2=OH+ будут иметь сходное NBO-строение, как и то, что с кислорода на протон будет подаваться в большей степени лежащая выше по энергии p пара.
Re: sp3.63 гибридизация азота в NH связи имино группы
У Вас методт МО ЛКАО. Это молекулярные делокализованные орбитали, растянутые на все ядра. Тут нет отдельных атомов, из которых образована молекула. Гибридизация, как таковая, возможно с функцией Гайтлера-Лондона.
Но можно говорить о какой-то гибридизации в МО ЛКАО при использовании минимального базиса.
Вы наблюдаете s-характер в одном месте и р в другом, так как поставили ++.
Кроме того, Вы используете орбитали КШ, а не ХФ. Из-за этого орбитальный анализ бессмыслен, так оптимальны не сами орбитали, а построенная на них электронная плотность.
Но можно говорить о какой-то гибридизации в МО ЛКАО при использовании минимального базиса.
Вы наблюдаете s-характер в одном месте и р в другом, так как поставили ++.
Кроме того, Вы используете орбитали КШ, а не ХФ. Из-за этого орбитальный анализ бессмыслен, так оптимальны не сами орбитали, а построенная на них электронная плотность.
После отстоя требуйте долива
Re: sp3.63 гибридизация азота в NH связи имино группы
А, что величина гибритизации является наблюдаемой (с точки зрения квантовой механики) величиной. У нее есть квантово-механический оператор?anasanity писал(а):Здравствуйте.
Вообщем, вопрос в названии. Как такое может быть? Вкладываю лог. С гибридизацией азота в NC связи все в порядке. Поляризация NH связи только уменьшилась по сравнению с амино таутомером, у которого была 2.42 гибридизация (из-за p характера неподеленной пары у планарной аминогруппы), так что за счет этого p характер не мог увеличиться. Буду благодарен за все идеи.
Может я просто чего-то элементарного не знаю, тогда сразу извиняюсь.
Какие физические свойства вы хотите оценить на основании величины гибритизации?
If you are not part of the solution, you are part of the precipitate.
Re: sp3.63 гибридизация азота в NH связи имино группы
Конечно, никакого физического смысла эти величины не несут. Они являются удобным способом объяснения задним числом различных химических явлений.
После отстоя требуйте долива
Re: sp3.63 гибридизация азота в NH связи имино группы
Спасибо за все ответы.
endlesslake - посмотрев остальные параметры, такие как повышение длинны связи и уменьшение положительного заряда я убедился что действительно такое значение p-характера в принципе возможно. удивляет все-таки такая большая разница между гибридизацией сигма связей NC и NH, но теперь уже не так сильно.
Vtur - признаюсь сразу - спорить на темы собственно вычислительной химии с вами не смогу. я понимаю что получать методом DFT орбитали это странно (кажется, эта тема на форуме уже где-то была), но, насколько я знаю, его используют для этого потому что он дает удовлетворительно близкие к тому же MP2 результаты. Тот же Slawomir Grabowski считает обычно NBO на DFT. например:
Alkorta I., Elguero J., Grabowski S. J. How To Determine Whether Intramolecular H...H Interactions Can Be Classified as Dihydrogen Bonds // The Journal of Physical Chemistry A.- 2008.-Vol.112.-No.12.- P.2721-2727.
Кстати, насчет гибридизации - опять таки есть известные ученые (Weinhold, автор программы NBO), которые считают гибридизацию на Pople базисах, правда как на DFT так и на MP2:
Alabugin I. V., Manoharan M., Peabody S., Weinhold F. Electronic Basis of Improper Hydrogen Bonding: A Subtle Balance of Hyperconjugation and Rehybridization // Journal of the American Chemical Society.- 2003.-Vol.125.-No.19.- P.5973-5987.
Kbob - если так, то тогда весь NBO не стоит считать)
endlesslake - посмотрев остальные параметры, такие как повышение длинны связи и уменьшение положительного заряда я убедился что действительно такое значение p-характера в принципе возможно. удивляет все-таки такая большая разница между гибридизацией сигма связей NC и NH, но теперь уже не так сильно.
Vtur - признаюсь сразу - спорить на темы собственно вычислительной химии с вами не смогу. я понимаю что получать методом DFT орбитали это странно (кажется, эта тема на форуме уже где-то была), но, насколько я знаю, его используют для этого потому что он дает удовлетворительно близкие к тому же MP2 результаты. Тот же Slawomir Grabowski считает обычно NBO на DFT. например:
Alkorta I., Elguero J., Grabowski S. J. How To Determine Whether Intramolecular H...H Interactions Can Be Classified as Dihydrogen Bonds // The Journal of Physical Chemistry A.- 2008.-Vol.112.-No.12.- P.2721-2727.
Кстати, насчет гибридизации - опять таки есть известные ученые (Weinhold, автор программы NBO), которые считают гибридизацию на Pople базисах, правда как на DFT так и на MP2:
Alabugin I. V., Manoharan M., Peabody S., Weinhold F. Electronic Basis of Improper Hydrogen Bonding: A Subtle Balance of Hyperconjugation and Rehybridization // Journal of the American Chemical Society.- 2003.-Vol.125.-No.19.- P.5973-5987.
Kbob - если так, то тогда весь NBO не стоит считать)
Re: sp3.63 гибридизация азота в NH связи имино группы
Я не занимаюсь вычислительной химией, я в этом мало, что понимаю. Я занимаюсь квантовой механикой молекул.
Спорить с Вами я не буду. Год назад еще стал бы, а сейчас уже надоело.
Писать можно, что угодно - бумага все стерпит, поэтому стараюсь не читать статьи по квантовой химии, ну, если уж совсем припрет - читаю.
Считать гибридизацию для DFT и MP2 по меньшей мере - расписываться в незнании основ квантовой химии. Гибридизация была создана в другой модели. У Вас же нет в МО ЛКАО атомных орбиталей - у Вас разложение МО в ряд по фунуциям, центрированным на ядрах. Ивсе. Более ничего нет. Почитайте Новосадов Б.К. "Методы математической физики молекулярных систем"
Орбитальный анализ пригоден для чистого GVB и нужен, чтобы задним числом объяснять разные явления. Поэтому исключений там столько же, сколько и правил.
Спорить с Вами я не буду. Год назад еще стал бы, а сейчас уже надоело.
Писать можно, что угодно - бумага все стерпит, поэтому стараюсь не читать статьи по квантовой химии, ну, если уж совсем припрет - читаю.
Считать гибридизацию для DFT и MP2 по меньшей мере - расписываться в незнании основ квантовой химии. Гибридизация была создана в другой модели. У Вас же нет в МО ЛКАО атомных орбиталей - у Вас разложение МО в ряд по фунуциям, центрированным на ядрах. Ивсе. Более ничего нет. Почитайте Новосадов Б.К. "Методы математической физики молекулярных систем"
Орбитальный анализ пригоден для чистого GVB и нужен, чтобы задним числом объяснять разные явления. Поэтому исключений там столько же, сколько и правил.
После отстоя требуйте долива
Кто сейчас на конференции
Сейчас этот форум просматривают: нет зарегистрированных пользователей и 7 гостей