Вклад характера связи

[AlexKsen]

Уважаемые форумчане, каким образом и в какой программе можно определить проценты характера связи (в некоторых статьях пишут, например, что составляющая ионной связи 60%). Я думал, что можно из NBO анализа, но проведя его в Гауссиане, подобного не обнаружил. Может, ключевые слова особенные есть, но в мануале я не нашел! Спасибо!

[ Post made via Windows Smartphone ]

[alxyppv]

А насколько система большая? если не очень, то можно попробовать метод Interacting Quantum Atom (это есть, например, в AIMAll), он четко разделяет вз-е на кулоновскую компоненту ("ионную")) и обменную (т.е. "ковалетнтое" вз-е). Но метод достаточно дорогой, сильно дольше чем просто QTAIM, поэтому для больших систем не годится

[AlexKsen]

К сожалению, система большая! И есть 2 d-металла.

[Yu/2]

IQA, да, хороший метод для анализа "межатомных" взаимодействий.
Но 2 d-металла, это еще мало о чем говорит. Сколько всего атомов?

А NBO можно все-таки ограниченно приспособить, разделив молекулу на два фрагмента по связи металл-металл и посчитать NEDA.

В качестве альтернативы, можно сделать "Localized Molecular Orbital Energy Decomposition Analysis" в US GAMESS. Примеры такого анализа тут:

Код: Выделить всё

http://dx.doi.org/10.1063/1.3159673

Но последние два метода дадут результат не для отдельной "связи" металл-металл, а для всего комплекса (кусок молекулы слева)металл-металл(кусок справа).

Ну и сама постановка задачи -- посчитать "процент" какого-то там характера связи -- очень размытая. Результат будет зависеть от модели.

[alxyppv]

К сожалению, система большая! И есть 2 d-металла.

Я в лоб считал системы до примерно 30-40 атомов. Если не очень торопитесь - то в принципе подъемно. Для больших систем можно определенные трюки применить:

DOI:

http://dx.doi.org/10.1039/C2CC32568C

но это уже наверное слишком сложно (в смысле, ненужно) - лучше другие методы искать.

[AlexKsen]

Система из 200 атомов. Не могу картинку прислать:)

[ Post made via Windows Smartphone ]

[alxyppv]

Ну да, тогда наверное ничего кроме орбитальных методов (типа указанного выше Orbital Energy Decomposition Analysis) не получится. В ADF точно есть.

[surius]

навскидку могу вас отправить к ADF и их EDA анализу. два минуса, порог вхождения в метод достаточно высок, ну и ADF конечно сильно коммерческий

[AlexKsen]

А есть, какие нибудь негласные пределы по порядкам связи на определенный вклад характера связи? Я по этому поводу смотрел, ничего не нашел! Кроме Гаусиана еще Гамесс есть, но там функция для NBO анализа платная!

[amge]

Кроме Гаусиана еще Гамесс есть, но там функция для NBO анализа платная!

NBO v.3 бесплатен, лежит где-то на CCL. Его можно приделать к современному Гамесс, но нужно править код.

[AlexKsen]

amge, спасибо за информацию, а можно более подробно, где скачать, куда закидывать, что править. Или, где про это посмотреть? Много вопросов:)
Всем спасибо за советы!

[ Post made via Windows Smartphone ]

[amge]

Старый NBO к современному GAMESS приделывал не я. Постараюсь узнать, как.

[endlesslake]

Разве в NBO 3.0 уже есть NEDA ?
А для проведения "Localized Molecular Orbital Energy Decomposition Analysis" NBO не нужно, этот метод в самом GAMESS US реализован.

[amge]

NBO 3.0 лежит здесь:

Код: Выделить всё

http://www.ccl.net/cca/software/SOURCES/FORTRAN/nbo/index.shtml

Разве в NBO 3.0 уже есть NEDA ?

Похоже, что нет. И поэтому есть подозрение, что этот NBO будет бесполезен для ТС, и не буду пока выяснять, как его хакать.

[AlexKsen]

amge, спасибо! А он ведь для Гауссиана! Да? Или для Гамесса тоже пойдет? Потому что в Гауссиане я NBO проводил, он не показывает вклад, а в Гамессе показывает, как говорят.

[amge]

Что касается NEDA (насколько я смог разобраться, это для Вас было бы лучше всего (в рамках NBO); не случайно endlesslake указал именно на него), судя по мануалу, этот метод имплементирован только для GAMESS, FIREFLY и NWCHEM.