водородные связи в PCM

вопросы строения молекул и квантовой химии
Ответить
Father_Artemii
Сообщения: 19
Зарегистрирован: Чт апр 05, 2012 12:02 pm

водородные связи в PCM

Сообщение Father_Artemii » Ср ноя 13, 2013 5:46 pm

Здравствуйте, уважаемые знатоки вычислительной химии. Мой вопрос относительно водородных связей в расчетах с моедлью растворителя PCM. Дело в том, что энергия связей относительно рассчетов в газовой фазе понижается в 3 раза (по абсолюному значению 10 ккал\моль). Меня это немало удивило. Да, PCM подавляет взаимодействия, имеющие в основе электростатику, но всё же водородная связь это не просто два взаимодействующих иона. Неужели среда, на самом деле, так сильно может понижать энергию водородной связи?

Аватара пользователя
sanya1024
Сообщения: 1672
Зарегистрирован: Чт янв 20, 2011 3:24 pm

Re: водородные связи в PCM

Сообщение sanya1024 » Ср ноя 13, 2013 11:19 pm

Да, водородные связи -- это в значительной степени электростатика, так что неудивительно, что диэл. проницаемость среды их ослабляет. Альтернативный подход -- явный учет растворителя. Причем в мол. динамике. Там Вы увидите, как молекулы полярного растворителя конкурируют за связывание с компонентами межмол. комплекса. Это и есть уменьшение константы связывания в полярной среде.
Вот и вся моя работа. Стеречь ребят над пропастью во ржи. (Дж. Д. Сэлинджер)

Father_Artemii
Сообщения: 19
Зарегистрирован: Чт апр 05, 2012 12:02 pm

Re: водородные связи в PCM

Сообщение Father_Artemii » Чт ноя 21, 2013 9:09 pm

Спасибки :)

Ответить

Вернуться в «квантовая химия и моделирование»

Кто сейчас на конференции

Сейчас этот форум просматривают: нет зарегистрированных пользователей и 5 гостей