DI в AIMAll

вопросы строения молекул и квантовой химии
Ответить
Аватара пользователя
Гесс
Сообщения: 13067
Зарегистрирован: Ср фев 15, 2012 11:19 pm

DI в AIMAll

Сообщение Гесс » Пт окт 18, 2013 1:06 am

Господа, вопрос в следующем:
Есть статья в которой для ряда молекул (производные адамантана но не суть важно) приведены Delocalization indexы между определенными атомами. Причем эти атомы не соседние а "через один". Я воспроизвел расчет, обработал чекпоинт AIMQB, открыл полученный sumviz, вижу в нем bond critical points, которые лежат разумеется на bond paths. Для этих точек я без проблем отображаю DI, хоть графиком хоть таблицей. Однако эти DI мне неинтересны. А интересующих меня критических точек как бы нет, и путей для них тоже нет. В работе применялся AIM2000. Мои Rho и энергии совпадают со статейными.
Как найти индекс делокализации между несвязанными атомами?
Выглядит это так:
AIMamamia.jpg
Разные DI из подменю Population, Pairs and Localisation (типа DI_NonBond(A,A')) уже опробовал. Оно проставляет по цифре возле каждого выделенного атома, причем попарное суммирование этих цифр всеравно не похоже на правду.
У вас нет необходимых прав для просмотра вложений в этом сообщении.

Аватара пользователя
Гесс
Сообщения: 13067
Зарегистрирован: Ср фев 15, 2012 11:19 pm

Re: DI в AIMAll

Сообщение Гесс » Пт окт 18, 2013 2:25 am

Нашел сам.
Atoms - Properties - Atom B - выбираем один из интересуемых атомов и смотрим для него DI от каждого другого интересуемого атома. Самое обычное DI, которое в Commons.
Надеюсь это кому то поможет.

VTur
Сообщения: 7357
Зарегистрирован: Пт авг 31, 2007 1:36 pm

Re: DI в AIMAll

Сообщение VTur » Пт окт 18, 2013 4:56 pm

Иногда ещеполезно просматривать int и sum файлы. Там еще много вещей

[ Post made via Android ] Изображение
После отстоя требуйте долива

Аватара пользователя
Гесс
Сообщения: 13067
Зарегистрирован: Ср фев 15, 2012 11:19 pm

Re: DI в AIMAll

Сообщение Гесс » Пт окт 18, 2013 6:17 pm

Ой даааа...

Ответить

Вернуться в «квантовая химия и моделирование»

Кто сейчас на конференции

Сейчас этот форум просматривают: Bing [Bot] и 54 гостя