Молекулярный электростатический потенциал

вопросы строения молекул и квантовой химии
Dell100
Сообщения: 88
Зарегистрирован: Пн янв 24, 2011 3:05 pm

Re: Молекулярный электростатический потенциал

Сообщение Dell100 » Ср дек 28, 2011 5:59 am

Спасибо))) Сегодня вечером все вышлю)

Dell100
Сообщения: 88
Зарегистрирован: Пн янв 24, 2011 3:05 pm

Re: Молекулярный электростатический потенциал

Сообщение Dell100 » Ср дек 28, 2011 8:05 pm

Ниже прикреплен входной файл дл расчета МЭСП. Попробуйте, пожалуйста, его запустить в новой версии FF. Заранее спасибо)))
У вас нет необходимых прав для просмотра вложений в этом сообщении.

Аватара пользователя
sanya1024
Сообщения: 1672
Зарегистрирован: Чт янв 20, 2011 3:24 pm

Re: Молекулярный электростатический потенциал

Сообщение sanya1024 » Чт дек 29, 2011 2:02 am

Не-а, так и не заработало. Будем просить :)
Кстати, в инпуте была ошибка: TDDFT=EXCITE (от GAMESS-US) вместо нужного CITYP=TDDFT (в ранее выложенных файлах этой ошибки не было). Я ее исправила, но как не работало RUNTYP=PROP, так и не заработало.
Вот и вся моя работа. Стеречь ребят над пропастью во ржи. (Дж. Д. Сэлинджер)

Dell100
Сообщения: 88
Зарегистрирован: Пн янв 24, 2011 3:05 pm

Re: Молекулярный электростатический потенциал

Сообщение Dell100 » Чт дек 29, 2011 5:06 am

Спасибо!!! Да ошибка была, но когда на кластере запускала, я ее исправила, в выложенном файле наверное забыла))) Кстати, а МЭСП для основного состояния я же смогу посчитать?)))

Аватара пользователя
sanya1024
Сообщения: 1672
Зарегистрирован: Чт янв 20, 2011 3:24 pm

Re: Молекулярный электростатический потенциал

Сообщение sanya1024 » Чт дек 29, 2011 2:02 pm

Для основного -- да.
Вот и вся моя работа. Стеречь ребят над пропастью во ржи. (Дж. Д. Сэлинджер)

Dell100
Сообщения: 88
Зарегистрирован: Пн янв 24, 2011 3:05 pm

Re: Молекулярный электростатический потенциал

Сообщение Dell100 » Пт янв 13, 2012 6:12 am

Здравствуйте!!!Все с наступившим Новым годом! Все просчитала!!! Действительно для основного состояния в FF МЭСП считается ))). Но при просмотре результатов расчета, я обнаружила только дипольный момент для основного состояния. Насколько я понимаю МЭСП характеризует электростатическое поле, которое создает молекула, это поле характеризует распределение электронной плотности в молекуле. Хотелось визуализировать это поле, а лучше получить значения МЭСП для каждого атома в молекуле и определить максимальное значение МЭСП ( наибольшее отрицательное значение). Может кто-то уже делал, подскажите какие ключевые слова надо еще включить. Всем заранее спасибо!!!

Аватара пользователя
sanya1024
Сообщения: 1672
Зарегистрирован: Чт янв 20, 2011 3:24 pm

Re: Молекулярный электростатический потенциал

Сообщение sanya1024 » Сб янв 14, 2012 5:28 pm

Я не делала, но могу предположить, что для визуализации надо сохранить МЭСП в виде cube файла и потом смотреть ChemCraft-ом. Посмотрите в мануале FF и Гамесса, как делать cube.
Вот и вся моя работа. Стеречь ребят над пропастью во ржи. (Дж. Д. Сэлинджер)

Ответить

Вернуться в «квантовая химия и моделирование»

Кто сейчас на конференции

Сейчас этот форум просматривают: нет зарегистрированных пользователей и 89 гостей