GAUSSIAN программа

[VTur]

http://gaussian.com/g_tech/g_ur/k_irc.htm
Задаете переходное состояние и гессиан (можно рассчитать на месте). В гессиане должна быть одна мнимая частота, она и задает координату реакции.

[Neitrino]

У меня такой вопрос. Может ли Gaussian09 считать ЯМР для систем с периодическим условием? На их официальном сайте об этом не написано . Если да, то дайте какой-нибудь пример или ссылку на статью, где использовали программу для таких расчетов.

[EvgeniX]

Никто не в курсе, в гауссиане хим.сдвиги стандарта можно задавать (для расчёта относительных х.с.)?

[o-oxhem]

У меня такой вопрос. Может ли Gaussian09 считать ЯМР для систем с периодическим условием? На их официальном сайте об этом не написано .

Нет, не может.

Никто не в курсе, в гауссиане хим.сдвиги стандарта можно задавать (для расчёта относительных х.с.)?

Результатом кв.-хим. расчёта являются экранирования ядер. А "стандарт " там нигде не указывается. Можно рассчитать экранирования для ядер стандарта и затем вычислить хим. сдвиг. Можно и иначе, например, строить регрессию в координатах хим . сдвиг (эксперимент) - экранирование (расчёт).

[EvgeniX]

Результатом кв.-хим. расчёта являются экранирования ядер. А "стандарт " там нигде не указывается. Можно рассчитать экранирования для ядер стандарта и затем вычислить хим. сдвиг. Можно и иначе, например, строить регрессию в координатах хим . сдвиг (эксперимент) - экранирование (расчёт).

Жаль. К примеру, в ПРИРОДе можно задавать хим.сдвиги стандарта и тогда в выводе будут isotropic shielding и хим.сдвиги относительно стандарта.

[Neitrino]

Жаль, думал, что Gaussian09 универсальна

[Neitrino]

Меня мучает один вопрос, можно посчитать freq для систем с периодическим условием в Gaussian09? Так как считая примеры из мануала (неопрен, графит и арсенид галлия) с ключевым словом freq программа выдает ошибку.

[o-oxhem]

применялось именно FREQ=numer ?

[Neitrino]

Нет, вначале freq=raman, затем просто freq. Советуете попробовать freq=numer?

[o-oxhem]

Это рекомендуют в мануале.

[Neitrino]

Подскажите, пожалуйста. В Гуассиане можно посчитать Байдеровский анализ?

[EvgeniX]

> Подскажите, пожалуйста. В Гуассиане можно посчитать Байдеровский анализ?
Можно сгенерировать wfn-файл, а дальше файл обрабатывать в сторонних программах.

[o-oxhem]

Подскажите, пожалуйста. В Гуассиане можно посчитать Байдеровский анализ?

Можно. Например, #p rhf/lp-31g test geom=modela aim
Но эта часть кода не стабильна. Лучше сразу перейти на aimall или прочие программы.

[Neitrino]

У меня выходит такая ошибка, не знаю как ее исправить.

>>>>>>>>>> Convergence criterion not met.
SCF Done: E(RPM6) = 3.26301806600 A.U. after 129 cycles
Convg = 0.1178D-05 -V/T = 1.0023
KE=-1.422441379923D+03 PE=-8.078199811563D+04 EE= 4.069827285355D+04
Convergence failure -- run terminated.
Error termination via Lnk1e in C:\G09W\l502.exe at Fri Jan 01 10:17:39 2010.
Job cpu time: 0 days 0 hours 16 minutes 16.0 seconds.
File lengths (MBytes): RWF= 800 Int= 0 D2E= 0 Chk= 200 Scr= 1

[o-oxhem]

Что-нибудь похожее на scf(xqc,maxcycle=512,vshift=150) скорее всего поможет.

[Neitrino]

Что-нибудь похожее на scf(xqc,maxcycle=512,vshift=150) скорее всего поможет.

Большое спасибо, помогло. У меня теперь такой вопрос, считаю большую молекулу по слоям, PM6 и DFT. Хочу посчитать NBO, но выскакивает ошибка

Analyzing the SCF density

Job title: Title Card Required

Storage needed: 4231584 in NPA, 5394820 in NBO ( 50101896 available)

Subroutine NAOANL could not find a S-type valence orbital on atom C 1.
IVAL : 1 1 0 0 M : 1 LA : 1
Error
Error termination via Lnk1e in C:\G09W\l607.exe at Sat Jan 02 17:34:47 2010.
Job cpu time: 0 days 1 hours 11 minutes 4.0 seconds.
File lengths (MBytes): RWF= 598 Int= 0 D2E= 0 Chk= 21 Scr= 1

насколько я понимаю это из-за того что я использую полуэмпирику, потому при ДФТ NBO считает нормально.

[o-oxhem]

Да, потому что считаете полуэмпирическим методом.

[Neitrino]

Попробую, вместо полуэмпирики использовать ДФТ, но с маленьким базисом. Посмотрю, какое время займет.

[Neitrino]

Два раза выдала одну и ту же ошибку при счете с ДФТ:


Problem signature:
Problem Event Name: APPCRASH
Application Name: l601.exe
Application Version: 0.0.0.0
Application Timestamp: 4c659abc
Fault Module Name: l601.exe
Fault Module Version: 0.0.0.0
Причем выдает ОС, а не сама программа.

[o-oxhem]

Нужно перезагрузиться.