Столкнулся с необходимосью(не сильной) найти примеры соединений по субструктуре, для которых был сделан X-Ray. В Reaxys в отличие от других спектральных методов мне это не удалось - или их там нет, или нет данных для этих субструктур.
Есть ли пути решения этого вопроса?
+++X-Ray по субструктуре, Спасибо Suprachemister!!!
+++X-Ray по субструктуре, Спасибо Suprachemister!!!
Последний раз редактировалось Serty Пт сен 09, 2011 11:44 am, всего редактировалось 1 раз.
- suprachemister
- Сообщения: 4884
- Зарегистрирован: Пн май 18, 2009 5:34 pm
Re: X-Ray по субструктуре
CSD? Пробовал
Похоже бесплатно там можно скачать только зная точную ссылку. А именно ее то я ищу. По субструктуре там только демка с ограниченным набором структур. Шансов получить лицензию у меня нет, да ради единичной задачи не особо охота связываться.
Я скорее пытаюсь помочь нашим аналитикам, котрых замучили вопросами - E/Z? Так как для этих структур я вижу только упомянутый способ установления геометрии, хотелось бы найти работы где этим занимались. Такого рода фигню
любят совать в разные библиотеки, и ссылок навалом - все просматривать в лом. Думал подойти вот таким образом.
Я скорее пытаюсь помочь нашим аналитикам, котрых замучили вопросами - E/Z? Так как для этих структур я вижу только упомянутый способ установления геометрии, хотелось бы найти работы где этим занимались. Такого рода фигню
- suprachemister
- Сообщения: 4884
- Зарегистрирован: Пн май 18, 2009 5:34 pm
Re: X-Ray по субструктуре
если прикрепите картинку структуры, то я посмотрю в полной версии webcsd.ccdc.cam.ac.ukSerty писал(а):Шансов получить лицензию у меня нет, да ради единичной задачи не особо охота связываться.
Re: X-Ray по субструктуре
Вроде прикрепля... склероз 
Нет, это запрет на картинки .SKC. Кстати не понимаю почему... Структура приведена в общем виде, если есть необходимость, то:
Q = O, S
R = любой арил
R' = любой алкил
Нет, это запрет на картинки .SKC. Кстати не понимаю почему... Структура приведена в общем виде, если есть необходимость, то:
Q = O, S
R = любой арил
R' = любой алкил
У вас нет необходимых прав для просмотра вложений в этом сообщении.
- suprachemister
- Сообщения: 4884
- Зарегистрирован: Пн май 18, 2009 5:34 pm
Re: X-Ray по субструктуре
any Alk, any Ar- там такого не нашел,
брал немного расширенный поиск по подструктуре
.cif можно смотреть в программе Mercury
[cut]OKOTAK : (Z)-3-Benzyl-5-benzylidene-1,3-oxazolidine-2,4-dione
Guofei Chen, Chunling Fu, Shengming Ma; Org.Biomol.Chem. (2011), 9, 105, doi:10.1039/c0ob00550a
FOBQAO : 3-Ethyl-5-(5,6,7,8-tetrahydro-5,5,8,8-tetramethyl-2-naphthlylmethylene)thiazolidine-2,4-dione
O.Bozdag-Dundar, B.Dundar, E.Buyukbingol, M.Caira; Acta Crystallogr.,Sect.C:Cryst.Struct.Commun. (1999), 55, 1027, doi:10.1107/S0108270199002267
HIDXAU : 5-(4-Chloro-2-(4-chlorobenzylsulfanyl)thiazol-5-ylmethylene)-3-(2,4-dichlorobenzyl)thiazolidine-2,4-dione
O.Ozgen, O.Bozdag-Dundar, R.Ertan, E.Kendi; Acta Crystallogr.,Sect.E:Struct.Rep.Online (2007), 63, o2355, doi:10.1107/S1600536807015139
MAJNUI : 5-(4-Ethoxybenzylidene)-3-(4-methylbenzoyl)-1,3-thiazolidine-2,4-dione
K.M.Popov-Pergal, D.Poleti, M.P.Rancic, A.Meden, M.V.Pergal; J.Heterocycl.Chem. (2010), 47, 224
NIJTAC : (Z)-3-(2-(4-Chlorophenyl)-2-oxoethyl)-5-(2,4-dichlorothiazol-5-ylmethylidene)thiazolidine-2,4-dione
O.Bozdag-Dundar, O.Ozgen, A.Mentese, N.Altanlar, O.Atli, E.Kendi, R.Ertan; Bioorg.Med.Chem. (2007), 15, 6012, doi:10.1016/j.bmc.2007.06.049
WEFNIF : 3-Methyl-5-(4-oxo-4H-chromen-3-ylmethylene)-1,3-thiazolidine-2,4-dione
M.Aslantas, M.Ceylan-Unlusoy, R.Ertan, E.Kendi, O.Buyukgungor; Acta Crystallogr.,Sect.E:Struct.Rep.Online (2006), 62, o1471, doi:10.1107/S1600536806008762
YASBUQ : 3-(4-Chlorobenzyl)-5-(4-oxo-4H-chromen-3-ylmethylene)-1,3-thiazolidine-2,4-dione
O.Ozgen, M.Ceylan-Unlusoy, O.Bozdag-Dundar, R.Ertan, E.Kendi; Acta Crystallogr.,Sect.E:Struct.Rep.Online (2005), 61, o870, doi:10.1107/S1600536805006252
BOFTAR : 1-(4,5-Benzo-3-ethyl-1,3-thiazol-2-ylidene)-2-(3-ethyl-4-oxo-2-thio-1,3-thiazol-5-ylidene)-ethane
Bai Chunli, Chang Youming, Xu Xiaojie; Kexue Tongbao(Chin.)(Chin.Sci.Bull.) (1982), 27, 922
BOFTAR01 : 1-(3-Ethylbenzothiazol-2-ylidene)-2-(3-ethyl-4-oxo-2-thioxothiazolidin-5-ylidene)ethane
Youming Chang; Huaxue Tongbao(Chin.)(Chem.Bull.) (1996), 58-10
BOFTAR10 : 3-Ethyl-5-(2-(3-ethyl-2-benzothiazolinylidene)-ethylidene)-rhodanine
Bai Chunli, Chang Youming, Xu Xiaojie; Kexue Tongbao(Chin.)(Chin.Sci.Bull.) (1983), 28, 1060
BOPHOE : (5-(4-(Benzyloxy)benzylidene)-4-oxo-2-thioxo-1,3-thiazolidin-3-yl)acetic acid ethanol solvate
T.K.Smith, B.L.Young, H.Denton, D.L.Hughes, G.K.Wagner; Bioorg.Med.Chem.Lett. (2009), 19, 1749, doi:10.1016/j.bmcl.2009.01.083
BOQCEP : 3-Phenyl-5-(phenylmethylidene)-2-thioxo-1,3-thiazolidin-4-one
A.Linden, E.M.A.H.Awad, H.Heimgartner; Acta Crystallogr.,Sect.C:Cryst.Struct.Commun. (1999), 55, 1877, doi:10.1107/S0108270199008975
COTFUN : 3-Methyl-(Z)-5-(3,4,5-trimethoxybenzylidene)-2-thioxothiazolidin-4-one
B.Insuasty, A.Gutierrez, J.Cobo, C.Glidewell; Private Communication (2009)
FUHKUP : (5Z)-5-(2-Methylbenzylidene)-3-phenyl-2-thioxo-1,3-thiazolidin-4-one
D.Shahwar, M.N.Tahir, M.A.Raza, B.Iqbal; Acta Crystallogr.,Sect.E:Struct.Rep.Online (2009), 65, o2917, doi:10.1107/S1600536809044304
LAWKAV : (Z)-5-(2-Nitrophenylmethylene)-4-oxo-2-thioxothiazolidin-3-yl-(α-benzyl)ethanoic acid
S.C.Nyburg, A.W.Parkins, B.V.Smith; J.Crystallogr.Spectrosc.Res. (1993), 23, 459, doi:10.1007/BF01182518
NAVBAN : 1-(3-Ethylbenzoselenazol-2-ylidene)-2-(3-ethyl-4-oxo-2-thioxothiazolidin-5-ylidene)ethane
Youming Chang; Huaxue Tongbao(Chin.)(Chem.Bull.) (1996), 58-10
NUTSOK : (Z)-5-(1-Methoxy-2-naphthylmethylene)-4-oxo-2-thioxo-1,3-thiazolidine-3-acetic acid dimethylsulfoxide solvate
D.Tranqui, P.Fresneau, M.Cussac; Acta Crystallogr.,Sect.C:Cryst.Struct.Commun. (1998), 54, 1152, doi:10.1107/S0108270198003096
POVGOW : (Z)-5-(2-Naphthylmethylene)-4-oxo-2-thioxo-1,3-thiazolidine-3-acetic acid dimethyl dulfoxide solvate
D.TranQui, P.Fresneau, M.Cussac; Acta Crystallogr.,Sect.C:Cryst.Struct.Commun. (1998), 54, 1501, doi:10.1107/S0108270198004600
PUHCUR : (5Z)-5-(2-Hydroxybenzylidene)-3-phenyl-2-thioxo-1,3-thiazolidin-4-one
D.Shahwar, M.N.Tahir, M.A.Raza, B.Iqbal; Acta Crystallogr.,Sect.E:Struct.Rep.Online (2009), 65, o2903
SALVIK : (Z)-3-Carboxymethyl-((2E)-2-methyl-3-phenylprop-2-enylidene)rhodanine ethanol solvate
T.Ishida, Y.In, M.Inoue, Y.Ueno, C.Tanaka, N.Hamanaka; Tetrahedron Lett. (1989), 30, 959, doi:10.1016/S0040-4039(00)95290-0
SALVIK10 : (Z)-3-Carboxymethyl-((2E)-2-methyl-3-phenylprop-2-enylidene)-rhodanine ethanol solvate
T.Ishida, Y.In, M.Inoue, C.Tanaka, N.Hamanaka; J.Chem.Soc.,Perkin Trans.2 (1990), 1085, doi:10.1039/p29900001085
SILHAW : 3-Carboxymethyl-5-(2,2-dimethylpropylidene)-2-thioxo-4-thiazolidinone
Y.Ohishi, T.Mukai, M.Nagahara, M.Yajima, N.Kajikawa, K.Miyahara, T.Takano; Chem.Pharm.Bull. (1990), 38, 1911
SILHAW01 : 3-Carboxymethyl-5-(2,2-dimethylpropylidene)-2-thioxo-4-thiazolidinone
R.E.Marsh; Acta Crystallogr.,Sect.B:Struct.Sci. (1995), 51, 897, doi:10.1107/S0108768195008901
ZUGJEQ : 5-(2-(3-Ethyl-2-benzothiazolidene)ethylidene)rhodanine N-acetic acid dimethylsulfoxide solvate
F.Nuesch, M.Gratzel, R.Nesper, V.Shklover; Acta Crystallogr.,Sect.B:Struct.Sci. (1996), 52, 277, doi:10.1107/S0108768195008263
ZUGJIU : Lithium 5-(2-(3-ethyl-2-benzothiazolidene)ethylidene)rhodanine N-acetate dimethylformamide solvate dihydrate
F.Nuesch, M.Gratzel, R.Nesper, V.Shklover; Acta Crystallogr.,Sect.B:Struct.Sci. (1996), 52, 277, doi:10.1107/S0108768195008263
ZUGJOA : Sodium 5-(2-(3-ethyl-2-benzothiazolidene)ethylidene)rhodanine N-acetate octahydrate
F.Nuesch, M.Gratzel, R.Nesper, V.Shklover; Acta Crystallogr.,Sect.B:Struct.Sci. (1996), 52, 277, doi:10.1107/S0108768195008263[/cut]
брал немного расширенный поиск по подструктуре
.cif можно смотреть в программе Mercury
[cut]OKOTAK : (Z)-3-Benzyl-5-benzylidene-1,3-oxazolidine-2,4-dione
Guofei Chen, Chunling Fu, Shengming Ma; Org.Biomol.Chem. (2011), 9, 105, doi:10.1039/c0ob00550a
FOBQAO : 3-Ethyl-5-(5,6,7,8-tetrahydro-5,5,8,8-tetramethyl-2-naphthlylmethylene)thiazolidine-2,4-dione
O.Bozdag-Dundar, B.Dundar, E.Buyukbingol, M.Caira; Acta Crystallogr.,Sect.C:Cryst.Struct.Commun. (1999), 55, 1027, doi:10.1107/S0108270199002267
HIDXAU : 5-(4-Chloro-2-(4-chlorobenzylsulfanyl)thiazol-5-ylmethylene)-3-(2,4-dichlorobenzyl)thiazolidine-2,4-dione
O.Ozgen, O.Bozdag-Dundar, R.Ertan, E.Kendi; Acta Crystallogr.,Sect.E:Struct.Rep.Online (2007), 63, o2355, doi:10.1107/S1600536807015139
MAJNUI : 5-(4-Ethoxybenzylidene)-3-(4-methylbenzoyl)-1,3-thiazolidine-2,4-dione
K.M.Popov-Pergal, D.Poleti, M.P.Rancic, A.Meden, M.V.Pergal; J.Heterocycl.Chem. (2010), 47, 224
NIJTAC : (Z)-3-(2-(4-Chlorophenyl)-2-oxoethyl)-5-(2,4-dichlorothiazol-5-ylmethylidene)thiazolidine-2,4-dione
O.Bozdag-Dundar, O.Ozgen, A.Mentese, N.Altanlar, O.Atli, E.Kendi, R.Ertan; Bioorg.Med.Chem. (2007), 15, 6012, doi:10.1016/j.bmc.2007.06.049
WEFNIF : 3-Methyl-5-(4-oxo-4H-chromen-3-ylmethylene)-1,3-thiazolidine-2,4-dione
M.Aslantas, M.Ceylan-Unlusoy, R.Ertan, E.Kendi, O.Buyukgungor; Acta Crystallogr.,Sect.E:Struct.Rep.Online (2006), 62, o1471, doi:10.1107/S1600536806008762
YASBUQ : 3-(4-Chlorobenzyl)-5-(4-oxo-4H-chromen-3-ylmethylene)-1,3-thiazolidine-2,4-dione
O.Ozgen, M.Ceylan-Unlusoy, O.Bozdag-Dundar, R.Ertan, E.Kendi; Acta Crystallogr.,Sect.E:Struct.Rep.Online (2005), 61, o870, doi:10.1107/S1600536805006252
BOFTAR : 1-(4,5-Benzo-3-ethyl-1,3-thiazol-2-ylidene)-2-(3-ethyl-4-oxo-2-thio-1,3-thiazol-5-ylidene)-ethane
Bai Chunli, Chang Youming, Xu Xiaojie; Kexue Tongbao(Chin.)(Chin.Sci.Bull.) (1982), 27, 922
BOFTAR01 : 1-(3-Ethylbenzothiazol-2-ylidene)-2-(3-ethyl-4-oxo-2-thioxothiazolidin-5-ylidene)ethane
Youming Chang; Huaxue Tongbao(Chin.)(Chem.Bull.) (1996), 58-10
BOFTAR10 : 3-Ethyl-5-(2-(3-ethyl-2-benzothiazolinylidene)-ethylidene)-rhodanine
Bai Chunli, Chang Youming, Xu Xiaojie; Kexue Tongbao(Chin.)(Chin.Sci.Bull.) (1983), 28, 1060
BOPHOE : (5-(4-(Benzyloxy)benzylidene)-4-oxo-2-thioxo-1,3-thiazolidin-3-yl)acetic acid ethanol solvate
T.K.Smith, B.L.Young, H.Denton, D.L.Hughes, G.K.Wagner; Bioorg.Med.Chem.Lett. (2009), 19, 1749, doi:10.1016/j.bmcl.2009.01.083
BOQCEP : 3-Phenyl-5-(phenylmethylidene)-2-thioxo-1,3-thiazolidin-4-one
A.Linden, E.M.A.H.Awad, H.Heimgartner; Acta Crystallogr.,Sect.C:Cryst.Struct.Commun. (1999), 55, 1877, doi:10.1107/S0108270199008975
COTFUN : 3-Methyl-(Z)-5-(3,4,5-trimethoxybenzylidene)-2-thioxothiazolidin-4-one
B.Insuasty, A.Gutierrez, J.Cobo, C.Glidewell; Private Communication (2009)
FUHKUP : (5Z)-5-(2-Methylbenzylidene)-3-phenyl-2-thioxo-1,3-thiazolidin-4-one
D.Shahwar, M.N.Tahir, M.A.Raza, B.Iqbal; Acta Crystallogr.,Sect.E:Struct.Rep.Online (2009), 65, o2917, doi:10.1107/S1600536809044304
LAWKAV : (Z)-5-(2-Nitrophenylmethylene)-4-oxo-2-thioxothiazolidin-3-yl-(α-benzyl)ethanoic acid
S.C.Nyburg, A.W.Parkins, B.V.Smith; J.Crystallogr.Spectrosc.Res. (1993), 23, 459, doi:10.1007/BF01182518
NAVBAN : 1-(3-Ethylbenzoselenazol-2-ylidene)-2-(3-ethyl-4-oxo-2-thioxothiazolidin-5-ylidene)ethane
Youming Chang; Huaxue Tongbao(Chin.)(Chem.Bull.) (1996), 58-10
NUTSOK : (Z)-5-(1-Methoxy-2-naphthylmethylene)-4-oxo-2-thioxo-1,3-thiazolidine-3-acetic acid dimethylsulfoxide solvate
D.Tranqui, P.Fresneau, M.Cussac; Acta Crystallogr.,Sect.C:Cryst.Struct.Commun. (1998), 54, 1152, doi:10.1107/S0108270198003096
POVGOW : (Z)-5-(2-Naphthylmethylene)-4-oxo-2-thioxo-1,3-thiazolidine-3-acetic acid dimethyl dulfoxide solvate
D.TranQui, P.Fresneau, M.Cussac; Acta Crystallogr.,Sect.C:Cryst.Struct.Commun. (1998), 54, 1501, doi:10.1107/S0108270198004600
PUHCUR : (5Z)-5-(2-Hydroxybenzylidene)-3-phenyl-2-thioxo-1,3-thiazolidin-4-one
D.Shahwar, M.N.Tahir, M.A.Raza, B.Iqbal; Acta Crystallogr.,Sect.E:Struct.Rep.Online (2009), 65, o2903
SALVIK : (Z)-3-Carboxymethyl-((2E)-2-methyl-3-phenylprop-2-enylidene)rhodanine ethanol solvate
T.Ishida, Y.In, M.Inoue, Y.Ueno, C.Tanaka, N.Hamanaka; Tetrahedron Lett. (1989), 30, 959, doi:10.1016/S0040-4039(00)95290-0
SALVIK10 : (Z)-3-Carboxymethyl-((2E)-2-methyl-3-phenylprop-2-enylidene)-rhodanine ethanol solvate
T.Ishida, Y.In, M.Inoue, C.Tanaka, N.Hamanaka; J.Chem.Soc.,Perkin Trans.2 (1990), 1085, doi:10.1039/p29900001085
SILHAW : 3-Carboxymethyl-5-(2,2-dimethylpropylidene)-2-thioxo-4-thiazolidinone
Y.Ohishi, T.Mukai, M.Nagahara, M.Yajima, N.Kajikawa, K.Miyahara, T.Takano; Chem.Pharm.Bull. (1990), 38, 1911
SILHAW01 : 3-Carboxymethyl-5-(2,2-dimethylpropylidene)-2-thioxo-4-thiazolidinone
R.E.Marsh; Acta Crystallogr.,Sect.B:Struct.Sci. (1995), 51, 897, doi:10.1107/S0108768195008901
ZUGJEQ : 5-(2-(3-Ethyl-2-benzothiazolidene)ethylidene)rhodanine N-acetic acid dimethylsulfoxide solvate
F.Nuesch, M.Gratzel, R.Nesper, V.Shklover; Acta Crystallogr.,Sect.B:Struct.Sci. (1996), 52, 277, doi:10.1107/S0108768195008263
ZUGJIU : Lithium 5-(2-(3-ethyl-2-benzothiazolidene)ethylidene)rhodanine N-acetate dimethylformamide solvate dihydrate
F.Nuesch, M.Gratzel, R.Nesper, V.Shklover; Acta Crystallogr.,Sect.B:Struct.Sci. (1996), 52, 277, doi:10.1107/S0108768195008263
ZUGJOA : Sodium 5-(2-(3-ethyl-2-benzothiazolidene)ethylidene)rhodanine N-acetate octahydrate
F.Nuesch, M.Gratzel, R.Nesper, V.Shklover; Acta Crystallogr.,Sect.B:Struct.Sci. (1996), 52, 277, doi:10.1107/S0108768195008263[/cut]
У вас нет необходимых прав для просмотра вложений в этом сообщении.
Кто сейчас на конференции
Сейчас этот форум просматривают: нет зарегистрированных пользователей и 25 гостей