прога для ЯМР-спектров

физико-химические методы исследования, методики и другие вопросы аналитической химии
analytical chemistry, analysis and techniques for professionals
Ответить
Аватара пользователя
Larsa
Сообщения: 19
Зарегистрирован: Ср дек 12, 2007 6:17 pm

прога для ЯМР-спектров

Сообщение Larsa » Ср ноя 23, 2011 4:24 pm

добрый день, коллеги:))

встал вот какой вопрос- юзаю для спектров Mestre-C.
все устраивало до того момента, как не приспичило эти спектры в статью вставить.
на выходе они такие бледные и некрасивые, что, боюсь, в редакции любого журнала завернут.
подскажите, пожалуйста, программу для чтения ЯМР-спектров, где можно было менять ширину линии,
т.е. чтобы при вставке в статью было более-менее видно.
спектры получаю с 1r и 1i файлами..

п.с. только не кидайтесь тапками :very_shuffle:

asp99
Сообщения: 254
Зарегистрирован: Вт май 11, 2010 3:47 pm

Re: прога для ЯМР-спектров

Сообщение asp99 » Ср ноя 23, 2011 5:46 pm

в g-NMR можно менять ширину всех линий или каждой в отдельности. Туда вроде можно из разных форматов данные импортировать.

Аватара пользователя
Quinolin'ka
Сообщения: 954
Зарегистрирован: Чт сен 02, 2010 10:29 pm

Re: прога для ЯМР-спектров

Сообщение Quinolin'ka » Ср ноя 23, 2011 9:40 pm

Пользуемся всей кафедрой Advasp'ом, кучу статей написали и не один диссер оформили. Очень удобная и понятная программа, на мой взгляд.
кавайная печенюфффка

Аватара пользователя
amge
Сообщения: 2047
Зарегистрирован: Вт июл 31, 2007 11:42 am

Re: прога для ЯМР-спектров

Сообщение amge » Чт ноя 24, 2011 8:17 am

Larsa писал(а):спектры в статью вставить
Например, так:
1. Открываем и обрабатываем спектр в SpinWorks.
2. Печатаем в pdf с помощью PDFCreator (после установки PDFCreator появится в списке принтеров).
3. Открываем pdf-файл в редакторе векторной графики Inkscape и редактируем его. Из SpinWorks получается хороший pdf. Нужно разгруппировать картинку (несколько раз), убрать лишнее. После разгруппирования текст будет текстом, который можно править, сам спектр - несколько полилиний, которые легко объединить и сделать сколь угодно толстыми, цветными, масштабировать и т.д.

Все упомянутые программы свободные.
Можно пробовать печатать в pdf и из Mestre, но не уверен, что получится хороший pdf.

Аватара пользователя
amge
Сообщения: 2047
Зарегистрирован: Вт июл 31, 2007 11:42 am

Re: прога для ЯМР-спектров

Сообщение amge » Чт ноя 24, 2011 8:26 am

Larsa писал(а):менять ширину линии
Если нужно изменить ширину линии (сигнала) в спектре (например, чтобы не были палками), то это - в ЯМРной программе, умножая на экспоненту (ef). А толщину линий на рисунке проще менять в редакторе векторной графики.

Polychemist
Сообщения: 9726
Зарегистрирован: Вт дек 21, 2004 11:42 am

Re: прога для ЯМР-спектров

Сообщение Polychemist » Чт ноя 24, 2011 11:03 am

А эти ЯМР-программы в .txt не сохраняют? Если да - Excel, OpenOffice и т.п....

Аватара пользователя
amge
Сообщения: 2047
Зарегистрирован: Вт июл 31, 2007 11:42 am

Re: прога для ЯМР-спектров

Сообщение amge » Чт ноя 24, 2011 12:00 pm

Polychemist писал(а):А эти ЯМР-программы в .txt не сохраняют? Если да - Excel, OpenOffice и т.п....
SpinWorks сохраняет. При этом, конечно, не будет интегралов, пик-пикинга и др. атрибутов ЯМР-спектров, но для статьи это, как правило, и не нужно. Потом, правда, потребуется некоторая ловкость, чтобы сохранить диаграмму Excel с хорошим разрешением, но и это достижимо - опять через печать, либо в PDFCreator (получится векторный рисунок), либо в Microsoft Office Document Image Writer Driver (получится хороший tiff-растр).

Аватара пользователя
Larsa
Сообщения: 19
Зарегистрирован: Ср дек 12, 2007 6:17 pm

Re: прога для ЯМР-спектров

Сообщение Larsa » Чт ноя 24, 2011 12:09 pm

asp99 писал(а):в g-NMR можно менять ширину всех линий или каждой в отдельности. Туда вроде можно из разных форматов данные импортировать.
спасибо - попробую! :235:

Аватара пользователя
Larsa
Сообщения: 19
Зарегистрирован: Ср дек 12, 2007 6:17 pm

Re: прога для ЯМР-спектров

Сообщение Larsa » Чт ноя 24, 2011 12:11 pm

amge писал(а):
Larsa писал(а):спектры в статью вставить
Например, так:
1. Открываем и обрабатываем спектр в SpinWorks.
2. Печатаем в pdf с помощью PDFCreator (после установки PDFCreator появится в списке принтеров).
3. Открываем pdf-файл в редакторе векторной графики Inkscape и редактируем его. Из SpinWorks получается хороший pdf. Нужно разгруппировать картинку (несколько раз), убрать лишнее. После разгруппирования текст будет текстом, который можно править, сам спектр - несколько полилиний, которые легко объединить и сделать сколь угодно толстыми, цветными, масштабировать и т.д.

Все упомянутые программы свободные.
Можно пробовать печатать в pdf и из Mestre, но не уверен, что получится хороший pdf.
я уже думала на тему: пдф или рисунок, полученный из местре, обработать в редакторе графики.
честно сказать, решила, что есть проги с такими тулами сразу:) (типа ориджина).

всем спасибо!
буду пробовать...

MONSTA
Сообщения: 3279
Зарегистрирован: Вт фев 20, 2007 11:36 am

Re: прога для ЯМР-спектров

Сообщение MONSTA » Пн ноя 28, 2011 11:09 am

Polychemist писал(а):А эти ЯМР-программы в .txt не сохраняют? Если да - Excel, OpenOffice и т.п....
Автора не устраивало, что спектры бледные и некрасивые. А Ёксель-Моксель по части некрасивости - реально чуть ли не впереди планеты всей. Open Office, к сожалению, с него пример берет. По части графического оформления научных расчетов Excel - самая последняя программа, про которую я бы подумал. Неудобно (только один вариант из имеющихся соответствует научному пониманию слова "график", и тот обозван "точечной диаграммой"), непредсказуемо (в версиях после Офиса 97 года выделение нескольких столбцов, особенно если они не смежные, в надежде получить график типа один Х + несколько Y почти гарантированно даст полную фигню, которую даже не удается исправить прямыми назначениями осей координат при разборе вариантов построения; Open Office тут хоть поддается регулировке), и выглядит коряво до ужаса - вот тут вряд ли кто будет спорить.

Cherep
Сообщения: 23485
Зарегистрирован: Чт окт 30, 2003 9:22 am

Re: прога для ЯМР-спектров

Сообщение Cherep » Пн ноя 28, 2011 7:42 pm

проблема в том, что про непредсказуемый ( :deal: ) эксель пишут книги
а про правильные gnuplot или там LabPlot или QTIPlot никто и не слышал. всех с малолетсва подсадили на иглу венды, вот и имеем результат. ну да как-то же обходятся экселем... ну их, безграмотных

Polychemist
Сообщения: 9726
Зарегистрирован: Вт дек 21, 2004 11:42 am

Re: прога для ЯМР-спектров

Сообщение Polychemist » Вт ноя 29, 2011 4:36 pm

Я в Excel не работаю, я в С работаю, а в Excel-е печатаю, сделав лет 10 назад макрос... А вообще оффтоп пошёл... Моя идея была загнать данные в ЛЮБУЮ любимую рисовалку и там сделать то, что надо.

Аватара пользователя
Larsa
Сообщения: 19
Зарегистрирован: Ср дек 12, 2007 6:17 pm

Re: прога для ЯМР-спектров

Сообщение Larsa » Чт дек 15, 2011 5:29 pm

отчитываюсь - одна из прог, рекомендуемых тут, всего лишь симулятор (или я неправильно инструкцию читала) 8)
пошла фотошопить.

ескель тоже фигню выдает, в ориджине как-то красивее это все, изящнее.

Аватара пользователя
amge
Сообщения: 2047
Зарегистрирован: Вт июл 31, 2007 11:42 am

Re: прога для ЯМР-спектров

Сообщение amge » Пт дек 16, 2011 5:54 am

Larsa писал(а):ескель тоже фигню выдает, в ориджине как-то красивее это все, изящнее.
Cherep писал(а):а про правильные gnuplot или там LabPlot или QTIPlot никто и не слышал. всех с малолетсва подсадили на иглу венды, ... ну их, безграмотных
:(

Ответить

Вернуться в «аналитическая химия / analytical chemistry»

Кто сейчас на конференции

Сейчас этот форум просматривают: нет зарегистрированных пользователей и 13 гостей