Коллеги, всем привет!
Если кто-то пользовался веб-сервисом докинга малых лигандов к макромолекулам (белкам) http://swissdock.ch, прошу помочь разобраться в интерпретации их термина "Energy".
Чем он у них отличается от энергии Гиббса?
В файлах с результатами докинга они отдельно дают столбцы с параметрами "deltaG" и "Energy".
Собственный их форум http://swissdock.vital-it.ch/forum недоступен.
Сервис SwissDock - Energy и deltaG
-
- Сообщения: 2
- Зарегистрирован: Пн фев 21, 2022 5:22 am
Re: Сервис SwissDock - Energy и deltaG
Я не по докингу, но в норме "электронная энергия" достаточно плотно коррелирует с энтальпией (поправки мало влияют), и отличается от энергии Гиббса на энтропийный член.
Re: Сервис SwissDock - Energy и deltaG
deltaG - это должно быть именно свободной энергией образования комплекса белок-лиганд. Что такое в их интерпретации Energy - не знаю: этим сервисом пользоваться пока что не приходилось.
Когда начинает изменять память, практики заводят записную книжку, а романтики садятся писать мемуары.
-
- Сообщения: 1158
- Зарегистрирован: Ср фев 26, 2014 11:22 am
Re: Сервис SwissDock - Energy и deltaG
Похоже на потенциальную энергию лиганда в поле белка.
Кто сейчас на конференции
Сейчас этот форум просматривают: нет зарегистрированных пользователей и 23 гостя