Gromacs Force Field

[Aleks37]

Подскажите, пожалуйста, как проверить набор потенциалов взаимодействия в силовых полях Gromacs`a?
Мене нужно, чтобы был Леонардо-Джонс + Кулон + ОН (12-6-1-OH), использоваться будут для моделирования воды.

[Marxist]

Прочитать статью с описанием силового поля

[Aleks37]

ясно, наверное буду использовать G53a5 или G53a6, нет ни у кого манула по ним ?

[Aleks37]

Еще вопрос, в каком файле Gromacs`a можно задать плотность и/или давление в моделируемой ячейке?

[Aleks37]

оформил некоторые свои наработки по Gromacs`y в качестве практического руководства, может кому пригодиться ...
http://aleks37.blogspot.com/2010/11/gromacs.html

[Marxist]

Ничо так, только скин блога тяжеловат. Кстати, можно было бы пропихнуть этот текст в сам громакс -- типа как русский faq.

[Aleks37]

А как это можно реализовать

[Marxist]

Думаю, лучше спросить в их мейллисте