Новости химической науки > Интенсификация амплификации ДНК

Йинфу Ли (Yingfu Li) и соавторы из Университета МакМастер (Гамильтон, Канада) разработали простой и эффективный способ амплификации ДНК, который может оказаться весьма полезным для ДНК диагностики.

Полимеразы производят непрерывные копии (обозначены синим) шаблона ДНК (обозначена красным) (Рисунок: © Chem. Commun., 2007, DOI: 10.1039/b709817k)

Многие из методик диагностики не отличатся достаточной чувствительностью для детектирования единичной молекулы ДНК, поэтому часто приходится прибегать к процедуре амплификации ДНК. Для получения необходимых копий ДНК часто используют метод ПЦР (polymerase chain reaction), который требует сложного инструментария для термоциклирования.

Круговая амплификация [rolling circle amplification (RCA)] была разработана в середине 1990-х годов как альтернативный метод амплификации ДНК при постоянной температуре реакции. В методе для повторного копирования циклических тяжей ДНК используют ДНК-полимеразы. Короткий линейный праймер ДНК связывается с циклической ДНК-шаблоном и воспроизводится при содействии полимераз так. Благодаря циклическому строению ДНК-матрицы она эффективно «обвивает» растущий праймер, позволяя сделать большое количество копий.

Команда Ли нашла дешевый и стабильный твердый носитель для праймеров ДНК – микрогелевые коллоидные частицы. Коллоидные частицы весьма привлекательны в роли твердых носителей для метода RCA благодаря тому, что они могут быть легко распределены по раствору, предоставляя коньюгату праймер/полимеразы конфигурационную свободу, необходимую для эффективной амплификации и простоты отбора проб для анализа.

В соответствие с утверждениями Ли, удобный метод ДНК-амплификации на подходящем носителе все еще востребован. В прошлом в качестве носителей использовали наночастицы золота и магнитные частицы, использование которых затруднено в связи с их низкой стабильностью и дороговизне.

Источник: Chem. Commun., 2007, DOI: 10.1039/b709817k

метки статьи: #биомедицинские микроприборы, #биохимия, #медицинская химия, #молекулярная биология, #химия поверхности