Природа

вопросы строения молекул и квантовой химии
Ответить
Аватара пользователя
sanya1024
Сообщения: 1668
Зарегистрирован: Чт янв 20, 2011 3:24 pm

Re: Природа

Сообщение sanya1024 » Вт янв 25, 2011 12:38 am

Хочется сказать: значит, так и надо. А эти молекулы действительно в таком виде существуют? Боюсь, что это не программа виновата, а сама молекула такая: именно такой конфигурации ядер не соответствует локального минимума. Функционал был PBE? Возможно, в гибридном функционале (B3LYP или PBE0) такой конфигурации будет соответствовать неглубокий лок. минимум, но глобальный, видимо, все-таки соответствует какой-то совсем другой конфигурации.
Вот и вся моя работа. Стеречь ребят над пропастью во ржи. (Дж. Д. Сэлинджер)

OrganikNV
Сообщения: 257
Зарегистрирован: Вт дек 07, 2010 6:27 pm

Re: Природа

Сообщение OrganikNV » Вт янв 25, 2011 12:47 am

Спасибо, посмотрю.

OrganikNV
Сообщения: 257
Зарегистрирован: Вт дек 07, 2010 6:27 pm

Re: Природа

Сообщение OrganikNV » Ср янв 26, 2011 2:59 pm

Можна ли в природе рассчитать термодинамические параметры? Если да, то подскажите, пожалуйста, как?

Аватара пользователя
EvgeniX
Сообщения: 2780
Зарегистрирован: Пт апр 27, 2007 5:32 am

Re: Природа

Сообщение EvgeniX » Ср янв 26, 2011 4:03 pm

OrganikNV писал(а):Можна ли в природе рассчитать термодинамические параметры? Если да, то подскажите, пожалуйста, как?
Можно: http://www.qchem.ru/practice/priroda/conf/

Считаете гессиан, потом
S=S,
H=E+ddH,
G=E+ddG.

С учётом того, что E - в хартри, ddH и ddG - в ккал/моль.

OrganikNV
Сообщения: 257
Зарегистрирован: Вт дек 07, 2010 6:27 pm

Re: Природа

Сообщение OrganikNV » Ср янв 26, 2011 4:15 pm

Как вводить параметр mass, если нужно?

Аватара пользователя
EvgeniX
Сообщения: 2780
Зарегистрирован: Пт апр 27, 2007 5:32 am

Re: Природа

Сообщение EvgeniX » Ср янв 26, 2011 5:12 pm

OrganikNV писал(а):Как вводить параметр mass, если нужно?
Этот параметр для изотопов, вводить его не нужно.

OrganikNV
Сообщения: 257
Зарегистрирован: Вт дек 07, 2010 6:27 pm

Re: Природа

Сообщение OrganikNV » Ср янв 26, 2011 9:00 pm

Спасибо!

OrganikNV
Сообщения: 257
Зарегистрирован: Вт дек 07, 2010 6:27 pm

Re: Природа

Сообщение OrganikNV » Пн янв 31, 2011 11:28 pm

Подскажите пожалуйста, какой заряд и мультиплетность у радикал-аниона?

VTur
Сообщения: 7357
Зарегистрирован: Пт авг 31, 2007 1:36 pm

Re: Природа

Сообщение VTur » Вт фев 01, 2011 12:30 am

-1 1
После отстоя требуйте долива

OrganikNV
Сообщения: 257
Зарегистрирован: Вт дек 07, 2010 6:27 pm

Re: Природа

Сообщение OrganikNV » Вт фев 01, 2011 1:11 am

Спасибо!

OrganikNV
Сообщения: 257
Зарегистрирован: Вт дек 07, 2010 6:27 pm

Re: Природа

Сообщение OrganikNV » Вт фев 01, 2011 3:31 am

Подскажите пожалуйста, можно ли в Природе замораживать координаты? Если да, то как?

petrovps
Сообщения: 325
Зарегистрирован: Вс янв 04, 2009 1:01 pm
Контактная информация:

Re: Природа

Сообщение petrovps » Вт фев 01, 2011 12:24 pm

OrganikNV писал(а):Подскажите пожалуйста, можно ли в Природе замораживать координаты? Если да, то как?

Можно
$optimize fix=a,b,c,d,e value=f $end, где а-тип замораживаемой координаты, b, c, d, e-координаты атомов, f-значение замораживаемой координаты

OrganikNV
Сообщения: 257
Зарегистрирован: Вт дек 07, 2010 6:27 pm

Re: Природа

Сообщение OrganikNV » Ср фев 23, 2011 7:29 pm

Уважаемые коллеги! Я оптимизирую геометрию одного аниона. Программа выдаёт оптимальную геометрию, но меняет структуру аниона. Рассчитываю другой анион - такая же проблема. Подскажите, как с этим быть?

Аватара пользователя
Droog_Andrey
Сообщения: 2670
Зарегистрирован: Сб сен 29, 2007 8:29 pm
Контактная информация:

Re: Природа

Сообщение Droog_Andrey » Пт фев 25, 2011 12:29 am

Анионы в газовой фазе карпизны.
2^74207281-1 is prime!

OrganikNV
Сообщения: 257
Зарегистрирован: Вт дек 07, 2010 6:27 pm

Re: Природа

Сообщение OrganikNV » Пт фев 25, 2011 2:36 am

Это точно, вообще полный бред выходит.

OrganikNV
Сообщения: 257
Зарегистрирован: Вт дек 07, 2010 6:27 pm

Re: Природа

Сообщение OrganikNV » Сб фев 26, 2011 3:29 am

Уважаемые коллеги, я провожу сканирование. В выходном файле ошибка:malloc(536870912) failed
Что то значит?

Аватара пользователя
EvgeniX
Сообщения: 2780
Зарегистрирован: Пт апр 27, 2007 5:32 am

Re: Природа

Сообщение EvgeniX » Сб фев 26, 2011 8:31 am

Может быть вам перейти на HyperChem?

Аватара пользователя
Droog_Andrey
Сообщения: 2670
Зарегистрирован: Сб сен 29, 2007 8:29 pm
Контактная информация:

Re: Природа

Сообщение Droog_Andrey » Сб фев 26, 2011 8:13 pm

OrganikNV писал(а):Уважаемые коллеги, я провожу сканирование. В выходном файле ошибка:malloc(536870912) failed
Что то значит?
Это значит, что прога хотела занять 512 мегабайт оперативной памяти, но у неё не получилось.
2^74207281-1 is prime!

OrganikNV
Сообщения: 257
Зарегистрирован: Вт дек 07, 2010 6:27 pm

Re: Природа

Сообщение OrganikNV » Сб фев 26, 2011 8:43 pm

Спасибо за советы! Решение проблемы я уже нашла.

OrganikNV
Сообщения: 257
Зарегистрирован: Вт дек 07, 2010 6:27 pm

Re: Природа

Сообщение OrganikNV » Вт мар 01, 2011 11:29 pm

Я сканирую. Задаю количество точек 10, считает 7;задаю 20, считает 11. Подскажите, пожалуйста, в чём может быть проблема.

Ответить

Вернуться в «квантовая химия и моделирование»

Кто сейчас на конференции

Сейчас этот форум просматривают: нет зарегистрированных пользователей и 22 гостя