Я знаю, что нечто подобное уже обсуждалось
http://www.chemport.ru/guest2/viewtopic.php?t=16610
но хотелось бы подойти к вопросу с другой стороны.
Есть заданная сумма в 75000 руб.
Как должна выглядеть конфигурация "идеального", для данной цены, компа для квантово-химических расчетов (Гауссиан 03)?
Конфигурация ПК (Гауссиан)
Re: Конфигурация ПК (Гауссиан)
Сейчас есть 3 разновидности гауссиана - оптимизированная для x86, для AMD64 и для EM64T. Раньше было только для x86 и AMD64.
Вопрос в том, под какой гауссиан покупается компьютер.
Если для x86, то на эти деньги можно купить штук 5 компьютеров (т.к. данный гауссиан ограничен примерно 2 ГБ ОЗУ и 20 ГБ места на диске).
Если для AMD64 (единственная на данный момент распространённая версия 64-битного гауссиана), то компьютер на базе AMD (Athlon, Opteron), раза в 2-3 дешевле Интела будет с Интелом на одинаковой скорости (лично провёл множество тестов). Покупать больше 2-4 ядер (суммарное число) нет смысла, потому как многие задачи распараллеливаются лишь на 2-х ядрах. Т.е. в итоге вполне можно купить пару-тройку нормальных вычислительных компов.
EM64T в руках никогда не держал (буквально в последние пару месяцев появился). Вот для него вполне можно за такую сумму что-то собрать. Но где же эту версию взять (даже академическая лицензия в итоге под 4 тысячи $ стоит, с учётом всех растаможек)?
Серверные варианты покупать не стоит, т.к. через год-два они устареют, а стоят в несколько раз дороже (а выгоды никакой).
Ну и также стоит сказать, под какие задачи будет заточен комп. Может быть и стоит взять полу-серверное решение, с 16 ГБ ОЗУ. Но на такие расчёты как правило тратится чрезвычайно много времени с малой практической пользой.
Вопрос в том, под какой гауссиан покупается компьютер.
Если для x86, то на эти деньги можно купить штук 5 компьютеров (т.к. данный гауссиан ограничен примерно 2 ГБ ОЗУ и 20 ГБ места на диске).
Если для AMD64 (единственная на данный момент распространённая версия 64-битного гауссиана), то компьютер на базе AMD (Athlon, Opteron), раза в 2-3 дешевле Интела будет с Интелом на одинаковой скорости (лично провёл множество тестов). Покупать больше 2-4 ядер (суммарное число) нет смысла, потому как многие задачи распараллеливаются лишь на 2-х ядрах. Т.е. в итоге вполне можно купить пару-тройку нормальных вычислительных компов.
EM64T в руках никогда не держал (буквально в последние пару месяцев появился). Вот для него вполне можно за такую сумму что-то собрать. Но где же эту версию взять (даже академическая лицензия в итоге под 4 тысячи $ стоит, с учётом всех растаможек)?
Серверные варианты покупать не стоит, т.к. через год-два они устареют, а стоят в несколько раз дороже (а выгоды никакой).
Ну и также стоит сказать, под какие задачи будет заточен комп. Может быть и стоит взять полу-серверное решение, с 16 ГБ ОЗУ. Но на такие расчёты как правило тратится чрезвычайно много времени с малой практической пользой.
Примерная кофигурация лучшего из средних компов для использования Gaussian/GAMESS/Priroda:
на базе c2q:
1. Материнская плата из серии ASUS P5B/P5K (лучше с тепловыми трубками) ~ 4000-5000 руб
2. Процессор Core 2 Quad 6600 ~ 8000 руб
3. ОЗУ 4 планки по 1 ГБ (в итоге 4 ГБ) ~ 4000 руб
4. Видеокарта с пассивным охлаждением на PC-E ~ 2000 руб
5. НЖМД (4 штуки в RAID, SATA, например из серии Seagate 7200.10 ES) по 150-300 ГБ ~ 8000 руб
6. Привод DVD-RAM ~ 1000 руб
7. Корпус Miditower ASCOT 6AR6/420 (V2.01) (или чифтеки) ~ 3000 руб
8. вентилятор Zalman 9700 NT (можно и боксовый использовать, но у этого крепления лучше, не выгибается плата) ~ 2500 руб
9. ИБП Smart от APC на 700 ВА ~ 7000 руб
10. Монитор ~ 7000 руб
Итого: 47 тысяч. Реально около 35-40 будет, т.е. можно взять 2 компа.
По НЖМД - как правило расчёты, тратящие больше 100 ГБ не эффективны, т.е. не стоит гнаться за объёмом.
По ОЗУ - планки 2ГБ по стоят непропорционально намного дороже 1 ГБ (да и греться по идее должны больще). Стоит брать DDR2 PC6400, а не DDR3 (несмотря на всё - быстрее)
Четырёхядерные коры, которые лучше Q6600 непропорционально скорости стоят дороже (10% производительности вытекает в 100% повышения цены).
PS: естественно, что это всё затачивается под Linux. Современные квантовохимический расчёты под Windows имеет смысл производить лишь в крайних случаях (когда комп используется многими людьми для разных нужд).
на базе c2q:
1. Материнская плата из серии ASUS P5B/P5K (лучше с тепловыми трубками) ~ 4000-5000 руб
2. Процессор Core 2 Quad 6600 ~ 8000 руб
3. ОЗУ 4 планки по 1 ГБ (в итоге 4 ГБ) ~ 4000 руб
4. Видеокарта с пассивным охлаждением на PC-E ~ 2000 руб
5. НЖМД (4 штуки в RAID, SATA, например из серии Seagate 7200.10 ES) по 150-300 ГБ ~ 8000 руб
6. Привод DVD-RAM ~ 1000 руб
7. Корпус Miditower ASCOT 6AR6/420 (V2.01) (или чифтеки) ~ 3000 руб
8. вентилятор Zalman 9700 NT (можно и боксовый использовать, но у этого крепления лучше, не выгибается плата) ~ 2500 руб
9. ИБП Smart от APC на 700 ВА ~ 7000 руб
10. Монитор ~ 7000 руб
Итого: 47 тысяч. Реально около 35-40 будет, т.е. можно взять 2 компа.
По НЖМД - как правило расчёты, тратящие больше 100 ГБ не эффективны, т.е. не стоит гнаться за объёмом.
По ОЗУ - планки 2ГБ по стоят непропорционально намного дороже 1 ГБ (да и греться по идее должны больще). Стоит брать DDR2 PC6400, а не DDR3 (несмотря на всё - быстрее)
Четырёхядерные коры, которые лучше Q6600 непропорционально скорости стоят дороже (10% производительности вытекает в 100% повышения цены).
PS: естественно, что это всё затачивается под Linux. Современные квантовохимический расчёты под Windows имеет смысл производить лишь в крайних случаях (когда комп используется многими людьми для разных нужд).
shulerin
Вы много матплат видели с официальной поддержкой такой памяти?
1. данная память предназначена как правило для бенчинга и используется как правило энтузиастами (оверклокерами)
2. эта память не на много быстрее тойже DDR2 6400, не смотря на то что
частота памяти увеличена тайминги у нее более высокие либо если тайминги более агрессивные то работает она на повышенном напряжении
порядка 2.0-2.1 В, следовательно греется и т.д.
3. стоит она как правило гораздо дороже обычной поскльку для нее производитель использует отборные чипы
резюмруя выше сказанное: общее увеличение в производительности не стоит тех денег которые стоит эта память поэтому берите то что Вам посоветовал EvgeniX
Вы много матплат видели с официальной поддержкой такой памяти?
1. данная память предназначена как правило для бенчинга и используется как правило энтузиастами (оверклокерами)
2. эта память не на много быстрее тойже DDR2 6400, не смотря на то что
частота памяти увеличена тайминги у нее более высокие либо если тайминги более агрессивные то работает она на повышенном напряжении
порядка 2.0-2.1 В, следовательно греется и т.д.
3. стоит она как правило гораздо дороже обычной поскльку для нее производитель использует отборные чипы
резюмруя выше сказанное: общее увеличение в производительности не стоит тех денег которые стоит эта память поэтому берите то что Вам посоветовал EvgeniX
В выходном файле где-то в начале.shulerin писал(а):EvgeniX спасибо за подробный ответ. Монитор есть, его в стоимость можно не включать. DVD в общем тоже не нужен. А как узнать тип установленного Гауссиана?
"x86" для "Linux", версия "03", ревизия "B02"
**********************************************
Gaussian 03: x86-Linux-G03RevB.02 16-Apr-2003
2-Aug-2007
**********************************************
вот это для AMD:
******************************************
Gaussian 03: AM64L-G03RevC.02 12-Jun-2004
29-Aug-2007
******************************************
Если по цене не дорогие то можно и их взять.shulerin писал(а):А почему не взять DDR2 PC9200 или PC8500?
Запустил на c2q две задачи оптимизации структуры в Priroda 6 (каждая на 2-х ядрах), конечно не Гауссиан, но всё же. Метод PBE/3z, памяти свободной было много. Так два пятиминутных расчёта несколько часов один другой тормозили.Nik® писал(а):В любом случае одному ядру доступен L2 не более 4Мб, так что если брать по максимуму то две задачи можно считать одновременно, а можно узнать на какой серии расчетов видно снижение производительности о котором Вы говорите ?
Кто сейчас на конференции
Сейчас этот форум просматривают: нет зарегистрированных пользователей и 6 гостей