Проблема такая: DFT считать реакцию "вчерне" слишком дорого, поэтому нужна полуэмпирика, а дальше или ONIOM или DFT, но когда уже будет ясно, что пересчитывать.
Считаю в Gaussian, выбрал PM7. И получаю стационарные точки, которых в DFT не было (в дополнение к тем, что были), странные геометрические артефакты, совсем другое соотношение барьеров. Что логично, с учётом особенностей системы.
Вроде как PM6-D3H4 должен её получше описывать. В Gaussian этой параметризации нет, хотя в целом он поддерживает возможность вручную ввести параметризацию. В литературе списка параметров не нашёл. Или плохо искал? Может, кто-нибудь меня ткнёт в то, где его взять?
PM6-D3H4 в Gaussian: реально ли, и если да, то как?
Re: PM6-D3H4 в Gaussian: реально ли, и если да, то как?
Если DFT дорого - то пробуйте 3c методы в орке.
Если 3c методы дорого - пробуйте GFN-xTB2 или хотя бы DFTB+
Если не хотите уходить в другой софт - урезайте систему до смыслового куска.
Если у вас не чистая органика и не система очень близкая к параметризации то до любой полуэмпирики можно ожидать достаточно плохих результатов. Для металлорагики - не исключено что качественно неправильных и неприменимых для дальнейшего допиливания на DFT. Описалово "стационарные точки, которых в DFT не было (в дополнение к тем, что были), странные геометрические артефакты, совсем другое соотношение барьеров." этому очень соответствует.
Если 3c методы дорого - пробуйте GFN-xTB2 или хотя бы DFTB+
Если не хотите уходить в другой софт - урезайте систему до смыслового куска.
Если у вас не чистая органика и не система очень близкая к параметризации то до любой полуэмпирики можно ожидать достаточно плохих результатов. Для металлорагики - не исключено что качественно неправильных и неприменимых для дальнейшего допиливания на DFT. Описалово "стационарные точки, которых в DFT не было (в дополнение к тем, что были), странные геометрические артефакты, совсем другое соотношение барьеров." этому очень соответствует.
Re: PM6-D3H4 в Gaussian: реально ли, и если да, то как?
Ну от полуэмпирики я пока ушёл, решил, что лучше PBE/SBK в Природе, чем полуэмпирика. К сожалению, урезать лишнее не очень получается - очень уж сложная система попалась.
Но да, эти все методы в Орке попробую при случае, может быть, для чего-то другого.
Но да, эти все методы в Орке попробую при случае, может быть, для чего-то другого.
Кто сейчас на конференции
Сейчас этот форум просматривают: нет зарегистрированных пользователей и 1 гость