Как добавить новый растворитель в Gaussian 09
Как добавить новый растворитель в Gaussian 09
Добрый день дорогие форумчане. Подскажите, пожалуйста, как я могу применить диметилсульфон в качестве растворителя в Gaussian 09?
Достаточна ли такая процедура: #p opt freq=noraman rb3lyp/6-311g(d,p) scrf=(pcm,read) geom=connectivity (после молекулярной спецификации добавляю eps=37.61)?
Достаточна ли такая процедура: #p opt freq=noraman rb3lyp/6-311g(d,p) scrf=(pcm,read) geom=connectivity (после молекулярной спецификации добавляю eps=37.61)?
Re: Как добавить новый растворитель в Gaussian 09
Нет, недостаточна, надо намного больше цифр https://gaussian.com/smdtip/
Учитывая что у него температура плавления 109 градусов цельсия - найти для него "жидкостные" характеристики может быть проблематично.
А мы точно говорим о (CH3)2SO2? А то мне гугл дает совсем другую диэлектрическую константу http://www.stenutz.eu/chem/solv6.php?na ... yl+sulfone А ваша гуглом совершенно не ловится. Если вам принципиально сульфон, то больше жидксотных цифр есть по этил-метилсульфону, а в базе гауссина есть TetraHydroThiophene-s,s-dioxide
Учитывая что у него температура плавления 109 градусов цельсия - найти для него "жидкостные" характеристики может быть проблематично.
А мы точно говорим о (CH3)2SO2? А то мне гугл дает совсем другую диэлектрическую константу http://www.stenutz.eu/chem/solv6.php?na ... yl+sulfone А ваша гуглом совершенно не ловится. Если вам принципиально сульфон, то больше жидксотных цифр есть по этил-метилсульфону, а в базе гауссина есть TetraHydroThiophene-s,s-dioxide
У вас нет необходимых прав для просмотра вложений в этом сообщении.
Re: Как добавить новый растворитель в Gaussian 09
Не знаю, как в гауссиане, но в гамессе для PCM нужны
RSOLV = the solvent radius, in units Angstrom
EPS = the dielectric constant
А много цифр - это для SMD
RSOLV = the solvent radius, in units Angstrom
EPS = the dielectric constant
А много цифр - это для SMD
Re: Как добавить новый растворитель в Gaussian 09
Точнее #p opt freq=noraman rb3lyp/6-311g(d,p) scrf=(pcm,read) geom=connectivity temperature=453.15Гесс писал(а): ↑Чт окт 01, 2020 9:55 pmНет, недостаточна, надо намного больше цифр https://gaussian.com/smdtip/
Учитывая что у него температура плавления 109 градусов цельсия - найти для него "жидкостные" характеристики может быть проблематично.
А мы точно говорим о (CH3)2SO2? А то мне гугл дает совсем другую диэлектрическую константу http://www.stenutz.eu/chem/solv6.php?na ... yl+sulfone А ваша гуглом совершенно не ловится. Если вам принципиально сульфон, то больше жидксотных цифр есть по этил-метилсульфону, а в базе гауссина есть TetraHydroThiophene-s,s-dioxide
Sulfone.pdf
eps=37.61 это диэлектрическая константа для жидкого (CH3)2SO2 при T=453.15 K.
Re: Как добавить новый растворитель в Gaussian 09
Если это и в гауссиане так, то это было бы очень хорошо, подогнал бы величину RSOLV под экспериментальный ИК-спектр.
Re: Как добавить новый растворитель в Gaussian 09
PCM и SMD только для 298.15 K.
Кто смел тот и съел
Re: Как добавить новый растворитель в Gaussian 09
Почему только для 298.15K ? Например, вот здесь (см. Example 3) предлагают провести расчет PCM при 523.15K.
У вас нет необходимых прав для просмотра вложений в этом сообщении.
- Droog_Andrey
- Сообщения: 2670
- Зарегистрирован: Сб сен 29, 2007 8:29 pm
- Контактная информация:
Re: Как добавить новый растворитель в Gaussian 09
А если не указывать RSolv, чем это чревато?
2^74207281-1 is prime!
Re: Как добавить новый растворитель в Gaussian 09
Возможно, тем, что будет взят умолчаемый, т.е. для воды?
А зачем не указывать? Его же легко оценить из Ван-дер-Ваальсова объема, который могут считать многие программы. Например, забитые в гамесс PCM-радиусы и расчетные из MarvinSketch хорошо коррелируют (за исключением, почему-то, ТГФ)
А зачем не указывать? Его же легко оценить из Ван-дер-Ваальсова объема, который могут считать многие программы. Например, забитые в гамесс PCM-радиусы и расчетные из MarvinSketch хорошо коррелируют (за исключением, почему-то, ТГФ)
У вас нет необходимых прав для просмотра вложений в этом сообщении.
Re: Как добавить новый растворитель в Gaussian 09
Помоему на ccl было утверждение что ненадо для больших молекул брать бОльший rsolv и что 1.3 это очень удачный дефолт. Зуб за это не дам, я сольватацию недолюбливаю.
Re: Как добавить новый растворитель в Gaussian 09
1.3 - это меньше, чем даже для самой маленькой молекулы (воды). Может, 2.3? А вообще да, утверждение разумное. Например, возьмем в качестве растворителей гексан и сквалан. Сольватационные эффекты в этих средах не должны сильно отличаться. А радиусы сильно разные...
Re: Как добавить новый растворитель в Gaussian 09
https://forum.turbomole.org/index.php?topic=992.0
http://openmopac.net/manual/rsolv.html - там цитата Кламта. А кому верить как не Кламту?
У вас в каких единицах? У меня в ангстремах
http://openmopac.net/manual/rsolv.html - там цитата Кламта. А кому верить как не Кламту?
У вас в каких единицах? У меня в ангстремах
Re: Как добавить новый растворитель в Gaussian 09
У меня тоже в ангстремах.
Действительно, 1.3. Но раз гуру рекомендуют, то так и надо делать. Единственное, там, по ссылкам, речь шла про COSMO. Но, скорее всего, для PCM то же самое.
Действительно, 1.3. Но раз гуру рекомендуют, то так и надо делать. Единственное, там, по ссылкам, речь шла про COSMO. Но, скорее всего, для PCM то же самое.
Re: Как добавить новый растворитель в Gaussian 09
Ну да, Кламт плотно связан с Космо, в аутпутах гауссиана при заказе COSMORS даже пишут:
Оттуда кстати пошли "радиусы по Кламту", чем Кламт был сильно недоволен. На дефолтном PCMAtomic radii : Klamt.
Впрочем ИМХО это не имеет отношения к RSolv.Atomic radii : UFF (Universal Force Field).
У вас нет необходимых прав для просмотра вложений в этом сообщении.
- Droog_Andrey
- Сообщения: 2670
- Зарегистрирован: Сб сен 29, 2007 8:29 pm
- Контактная информация:
Re: Как добавить новый растворитель в Gaussian 09
Гауссиан не подставляет по дефолту 1.3Å. Если указать Solvent=Generic, то в качестве RSolv он подставляет ноль.
2^74207281-1 is prime!
Кто сейчас на конференции
Сейчас этот форум просматривают: нет зарегистрированных пользователей и 10 гостей