Здравствуйте, может кто нибудь подсказать какой базис выбрать для AgNO3 ?
Экспериментирую в gaussuan с рассчетами биомолекул с солями, биомолекулы считаю методом B3LYP с базисом 6-31G(d). Но при попытке рассчитать AgNO3 выводится ошибка Atomic number out of range for 6-31G basis set.
Биомолекулы аденин-тимин и аминокислоты.
Какой базис выбрать для AgNO3
-
- Сообщения: 3
- Зарегистрирован: Чт мар 12, 2020 9:11 pm
Re: Какой базис выбрать для AgNO3
Например def2-TZVP, тогда все остальное разумно делать в def2-SVP.
Либо LANL2DZ, тогда остальное можно оставить в попловском базисе.
Если там комплексообразование - очень рекомендую использовать D3 дисперсионную коррекцию.
Если комплексование на ароматическое кольцо аденина - учтите что серебро может давать комплексы разной гаптичности.
Вообщем подводных камней тут может быть несколько.
Либо LANL2DZ, тогда остальное можно оставить в попловском базисе.
Если там комплексообразование - очень рекомендую использовать D3 дисперсионную коррекцию.
Если комплексование на ароматическое кольцо аденина - учтите что серебро может давать комплексы разной гаптичности.
Вообщем подводных камней тут может быть несколько.
-
- Сообщения: 3
- Зарегистрирован: Чт мар 12, 2020 9:11 pm
Re: Какой базис выбрать для AgNO3
спасибо, взял базис LANL2DZ.
Для начала хотел произвести расчет соли без биомолекул но на этапе оптимизации структуры AgNO3 появляется ошибка No NMR shielding tensors so no spin-rotation constants, насколько понимаю это связано с тем что атом серебра связан с группой NO3 ионной связью. Есть ли какие то флаги для оптимизации структур с ионными связями в gaussian? или стоит посмотреть в сторону других программных пакетах которые позволяют это выполнить
Для начала хотел произвести расчет соли без биомолекул но на этапе оптимизации структуры AgNO3 появляется ошибка No NMR shielding tensors so no spin-rotation constants, насколько понимаю это связано с тем что атом серебра связан с группой NO3 ионной связью. Есть ли какие то флаги для оптимизации структур с ионными связями в gaussian? или стоит посмотреть в сторону других программных пакетах которые позволяют это выполнить
Re: Какой базис выбрать для AgNO3
No NMR shielding tensors so no spin-rotation constants - это не ошибка само по себе. И точно не связано с ионной связью. Это сообщение кажется проходит когда оптимизация не сошлась, но надо смотреть аутпут, причин может быть много. Выложите тут в архиве либо заменив расширение на txt - посмотрим.
В гауссиане как и в других пакетах на уровне теории ДФТ и выше - принципиально нет концепции связи. Ни ионной, ни ковалентной, никакой. Соответственно и никаких флагов под "связи" нет.
В гауссиане как и в других пакетах на уровне теории ДФТ и выше - принципиально нет концепции связи. Ни ионной, ни ковалентной, никакой. Соответственно и никаких флагов под "связи" нет.
-
- Сообщения: 3
- Зарегистрирован: Чт мар 12, 2020 9:11 pm
Re: Какой базис выбрать для AgNO3
аутпут
У вас нет необходимых прав для просмотра вложений в этом сообщении.
Re: Какой базис выбрать для AgNO3
Optimization stopped.
-- Number of steps exceeded, NStep= 24
Вон ваша проблема.
Замените Opt на Opt=(MaxCycles=100)
Касательно инпута:
scf=qc -> sf=xqc
geom=connectivity - бесполезный кейворд
polar - а зачем?
gfprint - бесполезный кейворд
pop=full - а есть повод?
Вот #P - это правильно, это очень одобряю.
-- Number of steps exceeded, NStep= 24
Вон ваша проблема.
Замените Opt на Opt=(MaxCycles=100)
Касательно инпута:
scf=qc -> sf=xqc
geom=connectivity - бесполезный кейворд
polar - а зачем?
gfprint - бесполезный кейворд
pop=full - а есть повод?
Вот #P - это правильно, это очень одобряю.
Кто сейчас на конференции
Сейчас этот форум просматривают: нет зарегистрированных пользователей и 11 гостей