Скрипт rungms для SLURM

вопросы строения молекул и квантовой химии
Ответить
Аватара пользователя
Nickalaich
Сообщения: 48
Зарегистрирован: Сб фев 25, 2017 2:23 pm

Скрипт rungms для SLURM

Сообщение Nickalaich » Сб июн 15, 2019 6:51 pm

Категорически приветствую желающих помочь.

Собрал последний гамесс на Ломоносове, с ifort 15, MKL 15 и iMPI 4.1.0, тут проблем нет. Проблема в том, чтобы подружить rungms со Slurm 2.5.6. Я применил патч, найденный на гитхабе, определил все нужные переменные окружения (надеюсь), но не стартует гамесс - хоть убей. В приложениях и rungms, и лог запуска. Как я вижу - проблема в том, что slurm не выдает гамессу список нод, на которых можно работать, но могу и ошибаться.
У вас нет необходимых прав для просмотра вложений в этом сообщении.

Andriei
Сообщения: 5
Зарегистрирован: Ср июн 19, 2019 12:12 pm

Re: Скрипт rungms для SLURM

Сообщение Andriei » Ср июн 19, 2019 2:49 pm

По ошибки выглядит, что вы указали слишком много памяти на процесс, и у вас она закончилась.
А так srun на растащил по нодам процессы.

Ответить

Вернуться в «квантовая химия и моделирование»

Кто сейчас на конференции

Сейчас этот форум просматривают: нет зарегистрированных пользователей и 35 гостей