Какой выбрать CPU для GAUSSIAN09

вопросы строения молекул и квантовой химии
Ответить
Аватара пользователя
Гесс
Сообщения: 12027
Зарегистрирован: Ср фев 15, 2012 11:19 pm

Re: Какой выбрать CPU для GAUSSIAN09

Сообщение Гесс » Пт мар 23, 2018 5:24 pm

+1 к Shorku
MP2, CCSD и мультиреференсные расчеты влегкую будут отьедать 60+ Гб оперативы на ноду (и существественно ускоряться).
Для ДФТ (на CPU) память прожорливыми является в первую очередь расчет частот (возможно еще TDDFT), а вот оптимизация упирается в первую очередь в количество и качество процов (RAM больше 2Гб на ядро это редкость).
ДФТ можно делать на видеокартах (умеет только платный теракем, там свои недостатки). Такая машина будет больше похожа на машину для молдинамики.

mizuchi
Сообщения: 78
Зарегистрирован: Ср фев 23, 2011 5:10 pm

Re: Какой выбрать CPU для GAUSSIAN09

Сообщение mizuchi » Пт мар 23, 2018 8:25 pm

Rupreht писал(а):
Пт мар 23, 2018 3:43 pm
Понятно, значит основной уклон на ЦПУ.
Спасибо
Но тут надо понимать, что сейчас заметна тенденция ухода квантов с x86 на альтернативные many-core архитектуры, типа CUDA или Xeon Phi.

ximi
Сообщения: 3104
Зарегистрирован: Вс янв 29, 2012 7:50 pm

Re: Какой выбрать CPU для GAUSSIAN09

Сообщение ximi » Пт мар 23, 2018 9:52 pm

тенденция ухода квантов с x86 на альтернативные many-core архитектуры, типа CUDA или Xeon Phi.
Вернуться к началу
Xeon Phi это x86 :)

Аватара пользователя
Гесс
Сообщения: 12027
Зарегистрирован: Ср фев 15, 2012 11:19 pm

Re: Какой выбрать CPU для GAUSSIAN09

Сообщение Гесс » Пт мар 23, 2018 11:10 pm

mizuchi писал(а):
Пт мар 23, 2018 8:25 pm
или Xeon Phi.
А что есть с ксеонфаями? Я искал около года или полутора назад, нашел только какую то связанную с триплсами CCSD(T) процедуру в NWChem, с тех пор не отслеживал. Просто я слышал как минимум о двух местах (одно это LRZ) где из этих копроцессоров собрали кластеры, но о химическом применении не в курсе.

Rupreht
Сообщения: 333
Зарегистрирован: Пт сен 12, 2008 9:34 pm

Re: Какой выбрать CPU для GAUSSIAN09

Сообщение Rupreht » Сб мар 24, 2018 1:40 am

CUDA..... при нынешнем буме на майнинг, цена на видеокарты очень высока.
Думаю остановиться на AMD Ryzen Threadripper 1950X и отсюда уже плясать далее.

mizuchi
Сообщения: 78
Зарегистрирован: Ср фев 23, 2011 5:10 pm

Re: Какой выбрать CPU для GAUSSIAN09

Сообщение mizuchi » Сб мар 24, 2018 9:15 pm

Гесс писал(а):
Пт мар 23, 2018 11:10 pm
А что есть с ксеонфаями?
"Есть" не совсем верное слово, но к тому движется:
https://software.intel.com/en-us/node/536449
https://software.intel.com/en-us/node/536509

К тому же на KNL уже существуют платформы. Видимо, успех Tianhe-2 вдохновил инженеров Intel.

Аватара пользователя
Гесс
Сообщения: 12027
Зарегистрирован: Ср фев 15, 2012 11:19 pm

Re: Какой выбрать CPU для GAUSSIAN09

Сообщение Гесс » Сб мар 24, 2018 10:21 pm

Прикольно. Спасибо. Ну молдинамическое применение особенно ламмпс и длполи не удивляют. Нвкем безусловно интересно что там уже complet, но у меня счас нет этого кода, я с ним не работал и у меня к нему некоторое предубеждение основанное на отзывах что нвкем очень тормознут на каждом отдельном ядре и отвгрывается только за счет сверхпараллельности. Вообщем когда у меня будет кластер на тысячи процов или копроцов тогда и буду смотреть на нвкем. Дирак и гамесс поинтереснее, с ними я хоть пересекался. Весьма прикольно видеть в списке васп. Это может пригодться (мне).

mizuchi
Сообщения: 78
Зарегистрирован: Ср фев 23, 2011 5:10 pm

Re: Какой выбрать CPU для GAUSSIAN09

Сообщение mizuchi » Вс мар 25, 2018 2:24 am

Гесс писал(а):
Сб мар 24, 2018 10:21 pm
нвкем очень тормознут на каждом отдельном ядре и отвгрывается только за счет сверхпараллельности
Нет у него такого. На малом количестве ядер работает с такой же скоростью, что и G16. Код, конечно, странненький, но привыкнуть можно.

Аватара пользователя
Гесс
Сообщения: 12027
Зарегистрирован: Ср фев 15, 2012 11:19 pm

Re: Какой выбрать CPU для GAUSSIAN09

Сообщение Гесс » Вс мар 25, 2018 2:27 am

mizuchi писал(а):
Вс мар 25, 2018 2:24 am
Гесс писал(а):
Сб мар 24, 2018 10:21 pm
нвкем очень тормознут на каждом отдельном ядре и отыгрывается только за счет сверхпараллельности
Нет у него такого. На малом количестве ядер работает с такой же скоростью, что и G16. Код, конечно, странненький, но привыкнуть можно.
О, это ценное замечание. Возможно люди давшие мне исходные отзывы (2 штука но из одной группы) несколько апроксимировали реальность или имели неудачный опыт или корявую установку. Будя повится доступ - надо будет поиграть.

mizuchi
Сообщения: 78
Зарегистрирован: Ср фев 23, 2011 5:10 pm

Re: Какой выбрать CPU для GAUSSIAN09

Сообщение mizuchi » Вс мар 25, 2018 9:59 am

Гесс писал(а):
Вс мар 25, 2018 2:27 am
или корявую установку. Будя повится доступ - надо будет поиграть.
Могу написать небольшой мануал по установке.

Аватара пользователя
Гесс
Сообщения: 12027
Зарегистрирован: Ср фев 15, 2012 11:19 pm

Re: Какой выбрать CPU для GAUSSIAN09

Сообщение Гесс » Вс мар 25, 2018 10:23 am

Ну мне пока нечего ставить но если у вас есть свободное время - гайды это всегда хорошо! Буду признателен!
А то лет 5 назад чтоб распараллелить орку я потратил две недели и чуть не сошел с ума (счас бы это наверное заняло не больше дня но ну его нафиг).

ximi
Сообщения: 3104
Зарегистрирован: Вс янв 29, 2012 7:50 pm

Re: Какой выбрать CPU для GAUSSIAN09

Сообщение ximi » Пн ноя 12, 2018 7:17 pm

Хозяйке на заметку:

Вышел Core i9-9900K LGA1151v2
8 физических ядер и почти до 5 Ггц (в разгоне).
Цена около 500 у.е.

ximi
Сообщения: 3104
Зарегистрирован: Вс янв 29, 2012 7:50 pm

Re: Какой выбрать CPU для GAUSSIAN09

Сообщение ximi » Ср дек 12, 2018 4:57 pm

Хозяйке на заметку:

AMD Ryzen Threadripper 2950X 16 ядер 3,5/4,4 Ггц
AMD Ryzen Threadripper 2970WX 24 ядер 3,0/4,2 Ггц
AMD Ryzen Threadripper 2990WX 32 ядер 3,0/4,2 Ггц

4×DDR4-2993

Последний внушает уважение 32 ядра 64 потока ! 250 Вт
Частота более 4 Ггц.
Память 3 Ггц.

Metalian
Сообщения: 76
Зарегистрирован: Чт июл 05, 2007 4:39 pm

Re: Какой выбрать CPU для GAUSSIAN09

Сообщение Metalian » Ср дек 12, 2018 6:59 pm

Если смотреть за все вместе (камень + мать + память + охлаждение + корпус + БП), то по соотношению производительность/цена преимущество у какой платформы будет: Core i9, AMD Ryzen или у какой-нибудь серверной?

mizuchi
Сообщения: 78
Зарегистрирован: Ср фев 23, 2011 5:10 pm

Re: Какой выбрать CPU для GAUSSIAN09

Сообщение mizuchi » Ср дек 12, 2018 11:26 pm

Metalian писал(а):
Ср дек 12, 2018 6:59 pm
Если смотреть за все вместе (камень + мать + память + охлаждение + корпус + БП), то по соотношению производительность/цена преимущество у какой платформы будет: Core i9, AMD Ryzen или у какой-нибудь серверной?
2x Xeon X5690 :)
Ультимативно-дегенеративная дешевизна всех компонентов и производительность на уровне 2000 попугаев в Cinebench 15.

ximi
Сообщения: 3104
Зарегистрирован: Вс янв 29, 2012 7:50 pm

Re: Какой выбрать CPU для GAUSSIAN09

Сообщение ximi » Чт дек 13, 2018 12:42 am

камень + мать + память + охлаждение + корпус + БП
Тут основное камень и мать.
Все остальное по сути то же самое. Если в стойку для серверов не тулить.
Core i9, AMD Ryzen или у какой-нибудь серверной?
Скорее серверные решения Threadripper или старые б.у. Xeon

Metalian
Сообщения: 76
Зарегистрирован: Чт июл 05, 2007 4:39 pm

Re: Какой выбрать CPU для GAUSSIAN09

Сообщение Metalian » Чт дек 13, 2018 12:55 pm

ximi писал(а):
Чт дек 13, 2018 12:42 am
Тут основное камень и мать.
Все остальное по сути то же самое. Если в стойку для серверов не тулить.
Ну что-то мне кажется, что серверной двухпроцессорной матери нужен и совсем иного класса БП и совсем другой корпус со своей системой охлаждения, а серверные корпуса куда дороже десктопных...

mizuchi
Сообщения: 78
Зарегистрирован: Ср фев 23, 2011 5:10 pm

Re: Какой выбрать CPU для GAUSSIAN09

Сообщение mizuchi » Чт дек 13, 2018 2:53 pm

Metalian писал(а):
Чт дек 13, 2018 12:55 pm
Ну что-то мне кажется, что серверной двухпроцессорной матери нужен и совсем иного класса БП и совсем другой корпус со своей системой охлаждения, а серверные корпуса куда дороже десктопных...
Ничего подобного, киловаттником можно обойтись, и еще ресурс на видеокарты останется, а двухсокетные матплаты легко влезают в обычный корпус, если, конечно, форм-фактор стандартный.

ximi
Сообщения: 3104
Зарегистрирован: Вс янв 29, 2012 7:50 pm

Re: Какой выбрать CPU для GAUSSIAN09

Сообщение ximi » Чт дек 13, 2018 6:16 pm

Ну что-то мне кажется, что серверной двухпроцессорной матери нужен и совсем иного класса БП
Кажется.
БП можно 600Вт ATX и вовсе не обязательно двухпроцессорную мать брать ! Хотя и на нее 600Вт хватит.
совсем другой корпус со своей системой охлаждения,
Можно в настольный корпус FullTower запихнуть при желании.

Аватара пользователя
Yurii
Сообщения: 664
Зарегистрирован: Сб авг 11, 2007 1:59 am

Re: Какой выбрать CPU для GAUSSIAN09

Сообщение Yurii » Вс дек 16, 2018 1:24 pm

Intel возвращает припой под крышки процессоров Core 9000-ой серии.
прозвище "Фабержé" легендарный разведчик Дроздов получил за свое уникальное умение работать с информацией, добывать ее и превращать в драгоценность высшей пробы.

Ответить

Вернуться в «квантовая химия и моделирование»

Кто сейчас на конференции

Сейчас этот форум просматривают: Google [Bot] и 4 гостя