Да
Нет. Имея некоторую структуру металла/сплава/интерметаллида/твердого_раствора_металла_в_металле ДФТ больших проблем не испытывает, особенно плосковолновое. Но вот сказать что индий в палладии дает твердый раствор (равнономерно разупорядоченные по обьему палладия) а свинец дает структуру L11 где каждый четвертый атом палладия замещен на атом свинца - на такое мы не готовы.
В Chemcraft вы можете ткнуть в палочку частоты, внизу будет показан номер моды, и далее переходите в список колебаний и ищете эту моду.
Но согласитесь, было бы удобнее, если бы в табличек частот и в окне структуры сразу было бы нужное колебание. Впрочем, с колебаниями - это баловство, не больно то и нужно. А вот интерактивный график энергии по траектории в молдене очень полезен. Для меня это киллер-фича молдена.
В каком файле хранится траектория? Сейчас Chemcraft может прочитать xyz файл с множеством структур и показать график энергий по траектории.А вот интерактивный график энергии по траектории в молдене очень полезен. Для меня это киллер-фича молдена.
А, сорри, упустил. Я его попробовал скормить как molden.input (это дефолтное имя создаваемое турбомолем) и когда оно не завелось - решил тут написать. Да, судя по документации фиче уже 13 лет, а я до нее только добрался.
Время корреляции вращения молекул оценивается по уравнению Дебая τr = μVm/kT. Я пробовал считать молекулярный объем Vm тремя способами: ван-дер-Ваальсов объем, который выдает Marvin Sketch, COSMO VOLUME из MOPAC'а и объем, приходящимся на одну молекулу в конденсированной фазе из плотности. Считается, что Vm для уравнения Дебая имеет промежуточное значение между посчитанным 1-м и 3-м способами. Поэтому я брал значения из 2-го способа (они как раз промежуточные).
Я уже ответил по почте, изредка онлайн генератор ключей сбоит, и мне трудно это исправить, поскольку генератор был давно написал другим программистом и его контакты я потерял. Запросите ключ ещё раз.alexp51 писал(а): ↑Ср мар 22, 2023 4:58 pmЗдравствуйте, уважаемый Vit Nhoc
У меня проблемы с registration key
Я скачал последнюю версию Chemcraft_b640b_win64.zip
Система сообщила , что registration key устарел. Я послал запрос на обновление и попробовал воспользоваться обновленным ключом.
Однако система сообщила, что он invalid.
Соответствующий вопрос я направил по адресу support@chemcraftprog.com. Посмотрите плз.
Надеюсь на вашу помощь.
С уважением,
alexp51
В смысле трёхмерную карту электростатического потенциала? С Gaussian-ом для этого можно через cubegen.exe создать куб с электростатическим потенциалом, и открыть его в Chemcraft. Сам Chemcraft сейчас может рисовать только орбитали или полную электронную плотность, но не потенциал.
В Chemcraft тоже можно построить изоповерхность по одному кубу, прокрашенную значениями из другого куба.Гесс писал(а): ↑Чт мар 23, 2023 9:12 amЯ рискну предположить что вопрос про molecular electrostatic potential https://www.google.com/search?q=molecul ... =637&dpr=3
В vmd строится прокрашиванием одного cube другим cub-ом (density красится градиентом). Картинки красивые, химический смысл неоднозначен.
Мне сказали что эту опцию не так просто найти, поясню. Вы открываете один куб в Chemcraft, далее выбираете внизу-справа Multiple cubes operation/Add cube(s) и открываете второй куб. Далее строите для первого куба изоповерхность и нажимаете Map other, и выбираете 2.
В смысле, чтобы на эквивалентных атомах отображалось одно и то же число? Вы открываете файл в котором напечатаны и заряды на атомах, и PBC, и надо это совместить?
Сейчас этот форум просматривают: нет зарегистрированных пользователей и 14 гостей
