Вопросы по совершенствованию программы Chemcraft

[Vit Nhoc]

Спасибо. Если есть достаточно много поти одинаковых файлов с почти одинаковыми энергиями, то сопоставление типа пятая по счету энергия из пятого по счету файла уже не так удобно. Eсли в таблице есть прямое соответствие "имя файла - энергия", то это уже будет поудобней, к тому же скопировать можно сразу два столбца куда нибудь скопировать, что бы сохранить и не запутаться.

Что значит имя файла? Вы что, каждый конформер получаемый при вращении будете называть своим именем?
И обычно по-моему достаточно взять наименьшую энергию, неважно из какого по счёту файла.

[Uncle4enni]

Спасибо. Если есть достаточно много поти одинаковых файлов с почти одинаковыми энергиями, то сопоставление типа пятая по счету энергия из пятого по счету файла уже не так удобно. Eсли в таблице есть прямое соответствие "имя файла - энергия", то это уже будет поудобней, к тому же скопировать можно сразу два столбца куда нибудь скопировать, что бы сохранить и не запутаться.

Что значит имя файла? Вы что, каждый конформер получаемый при вращении будете называть своим именем?
И обычно по-моему достаточно взять наименьшую энергию, неважно из какого по счёту файла.

Кажется немного не поняли друг друга. Если мы открываем много файлов через multiple file, то каждый файл имеет уникальное название например: geometry001.out; geometry002.out; geometry003.out и т.д. Было бы здорово если бы можно было бы составить таблицу вида
geometry001 -543.005256874
gepmetry002 -543.005498854
geometry003 -543.005652886
и т.д.

[Vit Nhoc]

Опять нашёлся маленький баг с построением слабов, или даже не баг а "всё не так однозначно" - иногда трудно обрезать неуникальные атомы в ячейке, не сделав её некрасивой. Улучшено тут:

https://chemcraftprog.com/files/Chemcra ... _win64.zip

[Vit Nhoc]

У меня вопрос ко всем. В последней версии я удалил из триальной версии симметризатор (Edit/Set point group); я подумал что это полезно против хакеров, т.к. сами они его не напишут. После покупки программы пользователю приходит email с полной версией, в которой симметризатор есть. Может это неудачная на самом деле идея?

[amge]

Так то симметризаторов хватает, но чтоб был встроен в визуализатор - такой из бесплатных я знаю только один, wxMacMolPlt, но в нем визуализация отстойная.

[Vit Nhoc]

Мне пользовательница написала, что не может поставить Chemcraft на Windows 11. До этого она пользовалась программой на Windows 10 и проблем не было. Сейчас же выдаются сообщения:

Windows cannot access the specified device, path, or file.
You may not have the appropriate permissions to access the site

Вы с такими проблемами не сталкивались? Запускаете Chemcraft под Windows 11?

[Lab Mouse]

Загрузил твой Chemcraft на Virustotal https://www.virustotal.com/gui/home/upload , для проверки, смотри что нашлось :

Интересно почему, ложное срабатывание или троян в нём?

[Vit Nhoc]

Загрузил твой Chemcraft на Virustotal https://www.virustotal.com/gui/home/upload , для проверки, смотри что нашлось :

Интересно почему, ложное срабатывание или троян в нём?

Ложное срабатывание из-за антихакерской защиты.

[Vit Nhoc]

У меня такой вопрос к пользователям Chemcraft: я вот думаю, что имеет смысл убрать дистрибутив программы в формате exe инсталлятора, и оставить только дистрибутив в формате zip файла.
Дело в том что я поддерживаю идеологию, когда можно ставить разные копии Chemcraft в разные каталоги. Возможно довольно часто бывает нужно поставить старую версию для какой-то задачи, например в старых версиях есть сохранение анимированных гифов с прозрачным фоном (в новой Delphi пропала сторонняя библиотека). Бывает что в новой версии есть баги которых не было в старой, но ставить старую тоже нецелесообразно потому что в ней не хватает новых фич.
Если распаковывать zip – дистрибутивы в разные каталоги, они друг с другом не конфликтуют, можно отдельно запускать Chemcraft.exe в каждом отдельном каталоге. Для деинсталляции достаточно просто удалить каталог. Если же использовать exe инсталлятор, в несколько мест проинсталлировать не получится и человек может смутиться моего подхода. Как думаете, может мне лучше убрать exe инсталлятор?

[bigM]

Дело в том что я поддерживаю идеологию...

[Суровый]

Инсталлятор должен уметь давать выбор папки для установки. А также определять уже установленную программу любой версии.

[alex7851]

Как думаете, может мне лучше убрать exe инсталлятор?

Как вариант, сделать инсталлятор, который может и установить и просто распаковать portable версию.

[aka_Marlen]

Добрый день, коллеги!

Обнаружил, что функция отрисовки natural charges (в меню Tools/Color atoms by atomic properties), активная для выходных файлов GAMESS, не работает для ORCA. Планируется ли добавить это в ближайших версиях, либо существует ли какой-то трюк, чтобы прочитать секцию NBO в ORCA (кроме, например, подмены малликеновских зарядов на натуральные)?

Заранее спасибо!

[Vit Nhoc]

Добрый день, коллеги!

Обнаружил, что функция отрисовки natural charges (в меню Tools/Color atoms by atomic properties), активная для выходных файлов GAMESS, не работает для ORCA. Планируется ли добавить это в ближайших версиях, либо существует ли какой-то трюк, чтобы прочитать секцию NBO в ORCA (кроме, например, подмены малликеновских зарядов на натуральные)?

Заранее спасибо!

Пришлите здесь, или мне на почту, пример выходного файла Orca с natural charges.

[aka_Marlen]

Добрый день, коллеги!

Обнаружил, что функция отрисовки natural charges (в меню Tools/Color atoms by atomic properties), активная для выходных файлов GAMESS, не работает для ORCA. Планируется ли добавить это в ближайших версиях, либо существует ли какой-то трюк, чтобы прочитать секцию NBO в ORCA (кроме, например, подмены малликеновских зарядов на натуральные)?

Заранее спасибо!

Пришлите здесь, или мне на почту, пример выходного файла Orca с natural charges.

Добрый день!

Пример в прикрепленном архиве.

Пример секции:

Код: Выделить всё

 Summary of Natural Population Analysis:

                                     Natural Population                 Natural
             Natural    ---------------------------------------------    Spin
  Atom No    Charge        Core      Valence    Rydberg      Total      Density
 -------------------------------------------------------------------------------

Небольшая сложность в том, что эта секция (Summary of Natural Population Analysis) повторяется трижды: для альфа+бета и отдельно для альфа и бета.


Спасибо!

[Vit Nhoc]

Добрый день, коллеги!

Обнаружил, что функция отрисовки natural charges (в меню Tools/Color atoms by atomic properties), активная для выходных файлов GAMESS, не работает для ORCA. Планируется ли добавить это в ближайших версиях, либо существует ли какой-то трюк, чтобы прочитать секцию NBO в ORCA (кроме, например, подмены малликеновских зарядов на натуральные)?

Заранее спасибо!

Сделал:

https://chemcraftprog.com/files/Chemcra ... _win64.zip

Просьба протестировать эту версию.

[endlesslake]

сборка 688b при чтении файлов полученых в 6 орке, колебательные частоты все нулевые показывает. Не исправляли еще?

m1_x2c_wB97XD3_tzvp_opt.out.zip

[Vit Nhoc]

сборка 688b при чтении файлов полученых в 6 орке, колебательные частоты все нулевые показывает. Не исправляли еще?

Исправил:

https://chemcraftprog.com/download.html