Обсуждение потенциальных нововведений

[SkydiVAR]

Ага. Ща потренировался как раз на этом запросе. Сначала импортировал в Марвин, потом экспортировал в в два смайлс-файла, открыл их Ноутпадом и смайлсы поочередно вставил в Сайфайндер.
Может, указать, что для Реаксис - в виде .rdf, а для Сайфайндера - в виде пары смайлсов реакцию обозначать?

[Vanya Ivanov]

ну и что в сухом остатке?
реакцию в виде двух SMILES представлять для запросов?

[SkydiVAR]

Не знаю как насчет официального мнения админов, а мне было бы проще, если бы реакцию представляли в виде пары или тройки смайлсов.
.rdf буду обрабатывать только при наличии изрядного куска свободного времени. Но, может, другим удобнее из файла брать?

[geizerr]

предлагаю обновить правила раздела в соответствии с требованиями:

Код: Выделить всё

http://www.chemport.ru/forum/viewtopic.php?f=65&t=115758#p887098

я о такой причуде реаксиса не знал, прочитал случайно, возможно поэтому мой запрос и висит без ответа несколько дней

[Гесс]

предлагаю обновить правила раздела в соответствии с требованиями:

Код: Выделить всё

http://www.chemport.ru/forum/viewtopic.php?f=65&t=115758#p887098

я о такой причуде реаксиса не знал, прочитал случайно, возможно поэтому мой запрос и висит без ответа несколько дней

Кратко done.

[geizerr]

предлагаю обновить правила раздела в соответствии с требованиями:

Код: Выделить всё

http://www.chemport.ru/forum/viewtopic.php?f=65&t=115758#p887098

я о такой причуде реаксиса не знал, прочитал случайно, возможно поэтому мой запрос и висит без ответа несколько дней

Кратко done.

[Cherep]

а что за хрень "ароматические связи"?

[Гесс]

насколько я понимаю это фича смайлсов - мелкие буквы - ароматические атомы.
Вероятно было придумано для расширения функциональности смайлсов, однако результат получился спорный - является ли кольцо ароматическим или нет часто непонятно. Реаксис как я понимаю решил голову не морочить и все делать заглавными. Опенбабель кстати тоже конвертирует все в заглавные смайлсы независимо от того что там в молекуле (возможно где то есть настройка делать и ароматику, но я не искал).

[uchebnik fiziki]

Кратко done.

Ароматические циклы в смайлсах обозначаются строчными буквами, а не прописными, исправьте.

Реаксис как я понимаю решил голову не морочить и все делать заглавными. Опенбабель кстати тоже конвертирует все в заглавные смайлсы независимо от того что там в молекуле (возможно где то есть настройка делать и ароматику, но я не искал).

Не совсем так. Хороший тон в отрисовке структур -- кекулизация всех связей, то есть их отрисовка в виде чередования двойных и одинарных. Соответственно, при конвертации в смайлс всё так и сконвертируется. Структуры могут приходить из разных источников и быть с кружочками, но с кружочками работать неудобно, поэтому от них избавляются.

[Гесс]

Исправил.

[vasiliev]

Я бы предложил добавить к списку разрешённых расширений для вложений основные молекулярные форматы -- .sdf, .smi, .mol, .mol2, .pdb, .xyz, .cdx (?).

А почему бы и нет! Я поддерживаю. Думаю удобство в этом будет неоспоримое.

и я поддержу

[Vanya Ivanov]

Народ, сейчас SciFinder CAS работает на поиск?
Вот три недели назад вроде всё работало, а сейчас чей-то ничего не кликается.
У вас как?

[Ahha]

Прекращен доступ к SciFinder/SciFinderN

From ******************** on 2022-03-09 18:53

Уважаемые коллеги!
С 7 марта 2022 году прекращен доступ к SciFinder/SciFinderN.
Российский представитель CAS проинформировал меня, что данный перерыв обсуловлен сложностями переговорного процесса с представителями РФФИ (доступ к SciFinder/SciFinderN был частью централизованного доступа, организованного через РФФИ).
То, что причиной отключения стали финансовые вопросы, внушает осторожный оптимизм. Будем надеяться на возобновление доступа к ресурсу.

С уважением,

[Cherep]

спасибо за информацию

[Vanya Ivanov]

пИчаль ...
и за че свою БД 30 лет назад похерили - нипонятна... экономили, экономисты.

[Ahha]

Коль пошла такая пьянка, вот еще на всякий случай:

From: **************
Subject: Важно! Ограничения доступа к CCDC
Date: Wed, 23 Mar 2022 10:43:49 +0300

Глубокоуважаемые коллеги,

представители Кембриджского центра структурных данных сообщили мне, что
они не могут не присоединиться к санкционной политике своего
правительства и, скорее всего, в ближайшее время отключат доступ к
полной онлайн версии ресурса и постараются ограничить работу уже
установленного ПО. Мне кажется, не стоит дожидаться официального письма,
и стоит сохранить за собой возможность работы, установив ПО на компьютер
или ноутбук без доступа к Интернету.

[Cherep]

Прекращен доступ к SciFinder/SciFinderN

Ых, опять торгуются штоле?

[tsarapoid]

пИчаль ...
и за че свою БД 30 лет назад похерили - нипонятна... экономили, экономисты.

РЖХим просто продали немцам, еще в конце 90-х, на основе него и создали Реаксис