Какой есть доступный софт для расчета LogD, pKa и т.д.

Вопросы, связанные с химией вообще. Вы можете задать здесь свой вопрос, и мы постараемся на него ответить.
General chemical questions go here
Ответить
metrim
Сообщения: 247
Зарегистрирован: Пт авг 22, 2014 10:49 pm

Какой есть доступный софт для расчета LogD, pKa и т.д.

Сообщение metrim » Ср апр 05, 2023 2:49 am

Собственно пользовался вебверсией chemaxon для расчёта LogD моих молекул, но внезапно они эту лазейку прикрыли (
Так же похожий функционал есть у ACDlabs, пользуюсь версией 6 с рутрекера, так же вроде есть версия 12 , но там морока с активацией.
Собственно вопрос: а нет ли какого то свободного софта для подобных расчетов? Может быть какие то скрипты или библиотеки под Python, rScript или типа того ? Алгоритмы то вроде как простые и публичные, неужели никто не соорудил?

Аватара пользователя
Jokermaniak
Сообщения: 3019
Зарегистрирован: Чт окт 02, 2014 4:41 pm

Re: Какой есть доступный софт для расчета LogD, pKa и т.д.

Сообщение Jokermaniak » Ср апр 05, 2023 8:51 pm

Есть всякие открытые Пубкемы и Кемспидоры, которые приводят расчетные физхим константы для туевой хучи веществ. Конечно, вашего может там не быть, но у них там адские миллионы гипотетических и никем не синтезированных структур, поэтому вероятность что и ваша будет достаточно велика...
Что, Карл Маркс запрещает держать на лестнице ковры? Разве где-нибудь у Карла Маркса сказано, что 2-й подьезд калабуховского дома на Пречистенеке следует забить досками и ходить кругом через черный двор?

metrim
Сообщения: 247
Зарегистрирован: Пт авг 22, 2014 10:49 pm

Re: Какой есть доступный софт для расчета LogD, pKa и т.д.

Сообщение metrim » Чт апр 06, 2023 12:31 am

Ну они приводят цифры рассчитанные по ACD алгоритму для пары разных рН. Хемаксон и десктопная версия ACD строит график-зависимость в диапазоне рН 0-14, что куда удобнее и нагляднее.

Ответить

Вернуться в «общехимические вопросы / general chemical issues»

Кто сейчас на конференции

Сейчас этот форум просматривают: нет зарегистрированных пользователей и 28 гостей