определение молекулярной массы пептидов

вопросы современной биологической химии, молекулярной биологии, химической энзимологии и смежных наук
biochem, molbio, chemical enzymology and related discussions for professionals
masilisa89
Сообщения: 11
Зарегистрирован: Вт окт 30, 2018 4:42 pm

определение молекулярной массы пептидов

Сообщение masilisa89 » Вт окт 30, 2018 5:00 pm

Ищу лабораторию для проведения анализа пептидов методом гель-проникающей хроматографии. В методе используется самонабивная атмосферная колонка. Подвижная фаза прокачивается сверху вниз (обязательное условие) перистальтическим насосом. Детектор - рефрактометр. молекулярная масса 1000 до 40000 кД
контроль необходимо провести в Москве или Московской области.
Последний раз редактировалось masilisa89 Чт ноя 01, 2018 2:19 pm, всего редактировалось 3 раза.

masilisa89
Сообщения: 11
Зарегистрирован: Вт окт 30, 2018 4:42 pm

ищу лабораторию

Сообщение masilisa89 » Вт окт 30, 2018 5:01 pm

Ищу лабораторию для проведения анализа пептидов методом гель-проникающей хроматографии. В методе используется самонабивная атмосферная колонка. Подвижная фаза прокачивается сверху вниз (обязательное условие) перистальтическим насосом. Детектор - рефрактометр.

masilisa89
Сообщения: 11
Зарегистрирован: Вт окт 30, 2018 4:42 pm

ищу лабораторию

Сообщение masilisa89 » Вт окт 30, 2018 5:01 pm

Ищу лабораторию для проведения анализа пептидов методом гель-проникающей хроматографии. В методе используется самонабивная атмосферная колонка. Подвижная фаза прокачивается сверху вниз (обязательное условие) перистальтическим насосом. Детектор - рефрактометр.

Аватара пользователя
Tokashi
Сообщения: 3899
Зарегистрирован: Пн мар 13, 2006 10:02 pm

Re: ищу лабораторию

Сообщение Tokashi » Вт окт 30, 2018 5:52 pm

Город любой подойдёт? В Новый Уренгой полетите ?
Энергия ядерного взрыва примерно равна 20 Тера кал, что эквивалентно 4 Кило тоннам копчёной колбасы!

JAG
Сообщения: 874
Зарегистрирован: Пн ноя 07, 2016 1:39 pm

Re: ищу лабораторию

Сообщение JAG » Вт окт 30, 2018 6:31 pm

Tokashi, че сразу лететь как мажоры? На электричках с пересадками можно или бла-бла-каром.

Скорей всего если люди не пишут город, то по умолчанию это город-герой Москва, большинство населения страны живёт в нём.
EvaGreen, FAM, ROX, TAMRA, MFP 590, , , , , , .

JAG
Сообщения: 874
Зарегистрирован: Пн ноя 07, 2016 1:39 pm

Re: ищу лабораторию

Сообщение JAG » Вт окт 30, 2018 11:46 pm

самонабивная атмосферная колонка - это хорошо когда самонабивная... плохо когда самому приходится её набивать..

прокачивается сверху вниз (обязательное условие) - это всё облегчает..

перистальтическим насосом - какой марки?

Детектор - рефрактометр. - здесь где-то в барахолке отдавали никто не брал...
EvaGreen, FAM, ROX, TAMRA, MFP 590, , , , , , .

Аватара пользователя
avor
Сообщения: 11168
Зарегистрирован: Пн янв 24, 2005 1:13 pm

Re: определение молекулярной массы пептидов

Сообщение avor » Вт окт 30, 2018 11:53 pm

Во-первых вы не написали предполагаемые мол массы. Во-вторых в описываемых вами системах обычно используется UV-детектор, Рефрактометрический детектор - редкий гость в пептидной химии. В-третьих география лаборатории вас не волнует? Иркутск, Владивосток, Новосибирск устроит? В четвертых A не хотите попробовать MALDI? В-пятых если вам нужна аккредитованная лаборатория, то вряд ли вы ее найдете с протоколом гель-фильтрации пептидов.

Аватара пользователя
Гесс
Сообщения: 11406
Зарегистрирован: Ср фев 15, 2012 11:19 pm

Re: определение молекулярной массы пептидов

Сообщение Гесс » Ср окт 31, 2018 10:17 am

masilisa89 - не надо размножать дубли.
JAG - не надо тут хохмить и дурковать.

JAG
Сообщения: 874
Зарегистрирован: Пн ноя 07, 2016 1:39 pm

Re: определение молекулярной массы пептидов

Сообщение JAG » Ср окт 31, 2018 2:43 pm

Да мы не хохмим, мы задаем встречные вопросы, для выявления условий ТУ.

Человек пришёл с точным знанием что ему необходимо, даже обязательные условия знает..

Я как-то имел возможность работы в билайте, там технические условия приходили после выполнения работы, половина сотрудников не понимало что мы делаем, а вторая половина смотря на то что мы делаем создавала тех.условия, параллельно рабочие заканчивали возведение башни и настройку оборудования, но приходили результаты геодезии: здесь бурить нельзя. Затем переделывались документы на можно, параллельно изменяя ТУ.

В результате все получали зарплаты: кто больше кто меньше в зависимости от занимаемой должности.

Меньше всех получали рабочие.
Больше всех - те кто вообще не знает для чего его туда папа устроил работать, когда и так всё есть.

Amik бы сказал: "ди__ы бл__ь" ... :)
EvaGreen, FAM, ROX, TAMRA, MFP 590, , , , , , .

masilisa89
Сообщения: 11
Зарегистрирован: Вт окт 30, 2018 4:42 pm

Re: определение молекулярной массы пептидов

Сообщение masilisa89 » Чт ноя 01, 2018 2:21 pm

avor писал(а):
Вт окт 30, 2018 11:53 pm
Во-первых вы не написали предполагаемые мол массы. Во-вторых в описываемых вами системах обычно используется UV-детектор, Рефрактометрический детектор - редкий гость в пептидной химии. В-третьих география лаборатории вас не волнует? Иркутск, Владивосток, Новосибирск устроит? В четвертых A не хотите попробовать MALDI? В-пятых если вам нужна аккредитованная лаборатория, то вряд ли вы ее найдете с протоколом гель-фильтрации пептидов.
Ищу уже неаккредитованную лабораторию, так как аккредитованную не нашла.
К сожалению, уже есть готовая методика и ее нужно воспроизвести. молекулярные массы от 1000 до 40000 кД. я бы с удовольствием попробовала другой метод, но увы. Задача не просто проанализировать.
Спасибо за комментарии, поправила исходный текст.

Аватара пользователя
avor
Сообщения: 11168
Зарегистрирован: Пн янв 24, 2005 1:13 pm

Re: определение молекулярной массы пептидов

Сообщение avor » Чт ноя 01, 2018 3:10 pm

masilisa89 писал(а):
Чт ноя 01, 2018 2:21 pm
молекулярные массы от 1000 до 40000 кД. я бы с удовольствием попробовала другой метод, но увы. Задача не просто проанализировать.
Спасибо за комментарии, поправила исходный текст.
Вы наверное опять описАлись. 1-40МДа это уже совсем не пептиды, а очень честные белки при чем 40МДа - это аафигенно большой белок, который гель-фильтрацией и смотреть-то проблематично разве что на агарозе. Так что я думаю, что вы имели ввиду 1-40кДа( или что тоже самое 1000-40000Да.)

Что касается где? - стучитесь в ИБХ, там все должно быть.

masilisa89
Сообщения: 11
Зарегистрирован: Вт окт 30, 2018 4:42 pm

Re: определение молекулярной массы пептидов

Сообщение masilisa89 » Чт ноя 01, 2018 3:33 pm

avor писал(а):
Чт ноя 01, 2018 3:10 pm
masilisa89 писал(а):
Чт ноя 01, 2018 2:21 pm
молекулярные массы от 1000 до 40000 кД. я бы с удовольствием попробовала другой метод, но увы. Задача не просто проанализировать.
Спасибо за комментарии, поправила исходный текст.
Вы наверное опять описАлись. 1-40МДа это уже совсем не пептиды, а очень честные белки при чем 40МДа - это аафигенно большой белок, который гель-фильтрацией и смотреть-то проблематично разве что на агарозе. Так что я думаю, что вы имели ввиду 1-40кДа( или что тоже самое 1000-40000Да.)

Что касается где? - стучитесь в ИБХ, там все должно быть.
большое спасибо за совет! попробую.

Аватара пользователя
Гесс
Сообщения: 11406
Зарегистрирован: Ср фев 15, 2012 11:19 pm

Re: определение молекулярной массы пептидов

Сообщение Гесс » Чт ноя 01, 2018 6:43 pm

Кнопка "пожаловаться на сообщение" совсем не для того чтобы в "жалобе" писать ответ.

metrim
Сообщения: 125
Зарегистрирован: Пт авг 22, 2014 10:49 pm

Re: определение молекулярной массы пептидов

Сообщение metrim » Чт янв 24, 2019 11:37 am

Просто любопытно: а чем все кончилось?
Нашлась ли лаборатория с необходимым оснащемнием, в том числе и рефрактометрическим детектором при ситовой колонке и готовая выполнить анализ?

masilisa89
Сообщения: 11
Зарегистрирован: Вт окт 30, 2018 4:42 pm

Re: определение молекулярной массы пептидов

Сообщение masilisa89 » Пн янв 28, 2019 9:59 am

metrim писал(а):
Чт янв 24, 2019 11:37 am
Просто любопытно: а чем все кончилось?
Нашлась ли лаборатория с необходимым оснащемнием, в том числе и рефрактометрическим детектором при ситовой колонке и готовая выполнить анализ?
именно на этот метод не нашлась(

Polychemist
Сообщения: 9029
Зарегистрирован: Вт дек 21, 2004 11:42 am

Re: определение молекулярной массы пептидов

Сообщение Polychemist » Пн янв 28, 2019 6:21 pm

Как-то непонятно ТЗ. Зачем рефрактометрический детектор? Его используют когда УФ не тянет, но это не случай пептидов. И система похожа на самодельную, но в случае рефрактометрии нужно суровое термостатирование колонки и детектора, очень суровое, иначе будет у Вас ММ флуктуаций. Опять же в этом всём важен сорбент и стандарты, просто пустая трубка с насосом и детектором ничего не дадут. И присоединяюсь к вопросу - у Вас точно более 1000 кДа?

masilisa89
Сообщения: 11
Зарегистрирован: Вт окт 30, 2018 4:42 pm

Re: определение молекулярной массы пептидов

Сообщение masilisa89 » Пт фев 15, 2019 4:59 pm

Polychemist писал(а):
Пн янв 28, 2019 6:21 pm
Как-то непонятно ТЗ. Зачем рефрактометрический детектор? Его используют когда УФ не тянет, но это не случай пептидов. И система похожа на самодельную, но в случае рефрактометрии нужно суровое термостатирование колонки и детектора, очень суровое, иначе будет у Вас ММ флуктуаций. Опять же в этом всём важен сорбент и стандарты, просто пустая трубка с насосом и детектором ничего не дадут. И присоединяюсь к вопросу - у Вас точно более 1000 кДа?
Выбор - обоснован тем, что было в наличии.
поскольку не являюсь специалистом в этой области, могу тупить.
Диапазон молекулярных масс написан в соответствии с тем, что заявил разработчик.
Соединение, видимо, не пептид, а как уже выясняется петидогликан. но это неточно :?
и было бы неплохо понять что именно это уже любым методом

Аватара пользователя
avor
Сообщения: 11168
Зарегистрирован: Пн янв 24, 2005 1:13 pm

Re: определение молекулярной массы пептидов

Сообщение avor » Пт фев 15, 2019 6:33 pm

40MDa!!!!?????? Вы так и не ответили. Это не опечатка?!! Это оооочень большая молекула и могу предположить, что для нее практически невозможно найти ни маркер(стандарт), ни хроматографическую фазу с такими большими порами.

Demiurg
Сообщения: 158
Зарегистрирован: Вт мар 09, 2010 3:33 pm

Re: определение молекулярной массы пептидов

Сообщение Demiurg » Пт фев 15, 2019 10:49 pm

Это уже не молекула будет, а какой-то надмолекулярный агрегат:) Причём нефиговый такой!
Для сравнения: титин (полипептид с самой большой молекулярной массой) - примерно 3 MDa, рибосома (которые уже не молекула) - примерно столько же...

masilisa89
Сообщения: 11
Зарегистрирован: Вт окт 30, 2018 4:42 pm

Re: определение молекулярной массы пептидов

Сообщение masilisa89 » Пн фев 18, 2019 10:47 am

avor писал(а):
Пт фев 15, 2019 6:33 pm
40MDa!!!!?????? Вы так и не ответили. Это не опечатка?!! Это оооочень большая молекула и могу предположить, что для нее практически невозможно найти ни маркер(стандарт), ни хроматографическую фазу с такими большими порами.
Молекулярная масса от 1000 до 40000 кД (это указывает производитель)

Ответить

Вернуться в «биохимия и молекулярная биология / biochemistry and molecular biology»

Кто сейчас на конференции

Сейчас этот форум просматривают: нет зарегистрированных пользователей и 1 гость